MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018650	ACATAA	2	12	24398	24409	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018650	GATAAA	2	12	158756	158767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018650	GAATAC	2	12	197527	197538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018650	AGGGGC	2	12	197899	197910	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018650	GTTCCC	2	12	198344	198355	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018650	TAAATA	2	12	223863	223874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018650	TCTCCC	2	12	264765	264776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018650	TGAAAT	2	12	276271	276282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018650	GCATCT	2	12	286381	286392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018650	TATTTC	2	12	287270	287281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018650	CTGGAA	2	12	343918	343929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018650	GTTTTT	2	12	370273	370284	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018650	GAATGA	2	12	388351	388362	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018650	TAAATT	2	12	426145	426156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018650	GTATCT	2	12	628417	628428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018650	ATGCAG	2	12	647129	647140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018650	TTATAT	2	12	663238	663249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018650	ATAAAA	2	12	674004	674015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018650	AATGCA	2	12	675901	675912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018650	CGGTTA	2	12	687822	687833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018650	AGGGAG	2	12	719777	719788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018650	ATCATT	2	12	742389	742400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018650	AAAAAG	2	12	743224	743235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018650	TACAAC	2	12	747899	747910	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018650	GGGGTG	2	12	755690	755701	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018650	TTAAAT	2	12	822282	822293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018650	ACGAAA	2	12	835481	835492	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018650	GAGAAA	2	12	863718	863729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018650	TGACGG	2	12	863753	863764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018650	ATATAA	2	12	895552	895563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018650	ATGTTA	2	12	914817	914828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018650	GCTCCT	2	12	921666	921677	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018650	CTTCAA	2	12	944526	944537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018650	CTCAGT	2	12	977232	977243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018650	ACGCAG	2	12	990905	990916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018650	CCTCAC	2	12	1013454	1013465	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018650	TCGCGA	2	12	1021273	1021284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018650	AACAAA	2	12	1121735	1121746	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018650	TGATCT	2	12	1140813	1140824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018650	TCTTGT	2	12	1146509	1146520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018650	AAAACC	2	12	1150840	1150851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018650	AAACCG	2	12	1165166	1165177	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018650	ATATCA	2	12	1257503	1257514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018650	ATATCA	2	12	1258052	1258063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018650	TCTCCC	2	12	1281816	1281827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018650	GTAAAA	2	12	1292921	1292932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018650	AAACTG	2	12	1359252	1359263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018650	TGTCCA	2	12	1373856	1373867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018650	TGCACT	2	12	1524295	1524306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018650	CATAAC	2	12	1541409	1541420	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018650	CATCAG	2	12	1559250	1559261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018650	ATATTT	2	12	1575306	1575317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018650	GTTAAC	2	12	1577999	1578010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018650	GTTAAC	2	12	1578063	1578074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018650	TTTTCT	2	12	1628811	1628822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018650	GTGACA	2	12	1639103	1639114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018650	CATTTA	2	12	1652737	1652748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018650	GGGTAA	2	12	1670602	1670613	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018650	TAGTGG	2	12	1701531	1701542	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018650	GGAAGA	2	12	1779200	1779211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018650	GTAAGG	2	12	1838742	1838753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018650	GTAAGG	2	12	1839350	1839361	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018650	GTTCCG	2	12	1868849	1868860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018650	AGGGGG	2	12	1890519	1890530	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018650	ACAAAA	2	12	1920374	1920385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018650	GCTGGG	2	12	1928992	1929003	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018650	CTGTGC	2	12	1975327	1975338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018650	TGTCTG	2	12	2008959	2008970	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018650	ATACAC	2	12	2076358	2076369	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018650	ATAAGA	2	12	2088440	2088451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018650	TGAATT	2	12	2102258	2102269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018650	GACAGT	2	12	2201490	2201501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018650	ATGGTT	2	12	2245145	2245156	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018650	AAAGAA	2	12	2249090	2249101	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018650	GTAATA	2	12	2269083	2269094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018650	CTGTTC	2	12	2338533	2338544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018650	CTTTTT	2	12	2414008	2414019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018650	AGTCTT	2	12	2422930	2422941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018650	AAAACA	2	12	2423190	2423201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018650	TTATTT	2	12	2423822	2423833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018650	TAAGTA	2	12	2437479	2437490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018650	CATCTT	2	12	2520380	2520391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018650	AGTAAA	2	12	2540420	2540431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018650	GCTAAT	2	12	2554398	2554409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018650	ATTTAA	2	12	2586856	2586867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018650	CATAAC	2	12	2649507	2649518	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018650	TAACGG	2	12	2658338	2658349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018650	TATGAA	2	12	2661625	2661636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018650	ATTAAT	2	12	2672523	2672534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018650	GTTTTT	2	12	2673212	2673223	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018650	CATTAC	2	12	2680542	2680553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018650	AGTTAT	2	12	2843117	2843128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018650	GATCAG	2	12	2935179	2935190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018650	ACCCCC	2	12	2937437	2937448	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_018650	CTTTTG	2	12	2945657	2945668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018650	CGCAGC	2	12	2965072	2965083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018650	GGGTAT	2	12	2966738	2966749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018650	AGCCTG	2	12	3003640	3003651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018650	TCGAGT	2	12	3003772	3003783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018650	AAGCGT	2	12	3003792	3003803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018650	ACAAAA	2	12	3024430	3024441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018650	CTTTTT	2	12	3038180	3038191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018650	TTTTTG	2	12	3107616	3107627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018650	AAATAA	2	12	3109705	3109716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018650	CGGCTG	2	12	3145028	3145039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018650	TCAGTG	2	12	3182728	3182739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018650	GAAACC	2	12	3185950	3185961	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018650	ACAATA	2	12	3187682	3187693	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018650	AGACAA	2	12	3194369	3194380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018650	TGTGGT	2	12	3194773	3194784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018650	CCGAAT	2	12	3208033	3208044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018650	CATTAT	2	12	3344360	3344371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018650	TCCTTA	2	12	3345774	3345785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018650	TGGACA	2	12	3368041	3368052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018650	ATCTTT	2	12	3388840	3388851	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018650	CGGTTA	2	12	3454450	3454461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018650	TTTCTG	2	12	3545465	3545476	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018650	AACGCA	2	12	3620391	3620402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018650	AGGTAA	2	12	3698492	3698503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018650	TATTTT	2	12	3713656	3713667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018650	CGTCCC	2	12	3728704	3728715	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018650	CGATAA	2	12	3795889	3795900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018650	ATTTGC	2	12	3805451	3805462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018650	CGCCTG	2	12	3915608	3915619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.