MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018650	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	410480140
2	NC_018650	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	410480142
3	NC_018650	TGGCG	2	10	7583	7592	0 %	20 %	60 %	20 %	410480146
4	NC_018650	TGAAA	2	10	8775	8784	60 %	20 %	20 %	0 %	410480148
5	NC_018650	TTATG	2	10	9689	9698	20 %	60 %	20 %	0 %	410480149
6	NC_018650	AAACT	2	10	10160	10169	60 %	20 %	0 %	20 %	410480149
7	NC_018650	GGTAC	2	10	10342	10351	20 %	20 %	40 %	20 %	410480150
8	NC_018650	AGTGA	2	10	10420	10429	40 %	20 %	40 %	0 %	410480150
9	NC_018650	TTATT	2	10	12280	12289	20 %	80 %	0 %	0 %	410480152
10	NC_018650	TCTCT	2	10	13113	13122	0 %	60 %	0 %	40 %	410480152
11	NC_018650	CGCAG	2	10	17245	17254	20 %	0 %	40 %	40 %	410480157
12	NC_018650	TGGTG	2	10	21227	21236	0 %	40 %	60 %	0 %	410480160
13	NC_018650	TGAAA	2	10	22679	22688	60 %	20 %	20 %	0 %	410480163
14	NC_018650	AAATG	2	10	27359	27368	60 %	20 %	20 %	0 %	410480168
15	NC_018650	ATTTT	2	10	28100	28109	20 %	80 %	0 %	0 %	410480169
16	NC_018650	CCGCA	2	10	29348	29357	20 %	0 %	20 %	60 %	410480172
17	NC_018650	TGGGC	2	10	33137	33146	0 %	20 %	60 %	20 %	410480176
18	NC_018650	GGCGC	2	10	33177	33186	0 %	0 %	60 %	40 %	410480176
19	NC_018650	GTGTT	2	10	33207	33216	0 %	60 %	40 %	0 %	410480176
20	NC_018650	TCCGA	2	10	33834	33843	20 %	20 %	20 %	40 %	410480177
21	NC_018650	TCTGG	2	10	35097	35106	0 %	40 %	40 %	20 %	410480179
22	NC_018650	CTGGC	2	10	35206	35215	0 %	20 %	40 %	40 %	410480179
23	NC_018650	GCACG	2	10	36000	36009	20 %	0 %	40 %	40 %	410480179
24	NC_018650	GCTGC	2	10	36583	36592	0 %	20 %	40 %	40 %	410480180
25	NC_018650	GCGGA	2	10	39568	39577	20 %	0 %	60 %	20 %	410480182
26	NC_018650	TGCCT	2	10	40287	40296	0 %	40 %	20 %	40 %	410480182
27	NC_018650	ATTCC	2	10	41580	41589	20 %	40 %	0 %	40 %	410480183
28	NC_018650	CTCGC	2	10	42577	42586	0 %	20 %	20 %	60 %	410480184
29	NC_018650	TCAGG	2	10	42605	42614	20 %	20 %	40 %	20 %	410480184
30	NC_018650	CGCGG	2	10	42963	42972	0 %	0 %	60 %	40 %	410480185
31	NC_018650	CGACC	2	10	45092	45101	20 %	0 %	20 %	60 %	410480188
32	NC_018650	CATCT	2	10	48632	48641	20 %	40 %	0 %	40 %	410480192
33	NC_018650	TCTGG	2	10	49450	49459	0 %	40 %	40 %	20 %	410480193
34	NC_018650	GAAAG	2	10	51850	51859	60 %	0 %	40 %	0 %	410480199
35	NC_018650	CACCG	2	10	57240	57249	20 %	0 %	20 %	60 %	410480205
36	NC_018650	CACTT	2	10	62287	62296	20 %	40 %	0 %	40 %	410480210
37	NC_018650	AAAGG	2	10	68474	68483	60 %	0 %	40 %	0 %	410480217
38	NC_018650	GCTTC	2	10	69215	69224	0 %	40 %	20 %	40 %	410480218
39	NC_018650	TCCCC	2	10	69575	69584	0 %	20 %	0 %	80 %	410480219
40	NC_018650	TGCCC	2	10	69633	69642	0 %	20 %	20 %	60 %	410480219
41	NC_018650	CGGCG	2	10	70191	70200	0 %	0 %	60 %	40 %	410480221
42	NC_018650	CGGCG	2	10	71465	71474	0 %	0 %	60 %	40 %	410480224
43	NC_018650	GGGCT	2	10	72087	72096	0 %	20 %	60 %	20 %	410480226
44	NC_018650	CGGCC	2	10	72224	72233	0 %	0 %	40 %	60 %	410480226
45	NC_018650	GGCCT	2	10	72297	72306	0 %	20 %	40 %	40 %	410480226
46	NC_018650	CGGAC	2	10	72359	72368	20 %	0 %	40 %	40 %	410480226
47	NC_018650	CGCAG	2	10	74404	74413	20 %	0 %	40 %	40 %	410480228
48	NC_018650	TGCTC	2	10	77285	77294	0 %	40 %	20 %	40 %	410480232
49	NC_018650	AGGCC	2	10	77474	77483	20 %	0 %	40 %	40 %	410480232
50	NC_018650	CTCCC	2	10	78248	78257	0 %	20 %	0 %	80 %	410480233
51	NC_018650	AAGGC	2	10	78480	78489	40 %	0 %	40 %	20 %	410480234
52	NC_018650	CCAGC	2	10	80493	80502	20 %	0 %	20 %	60 %	410480236
53	NC_018650	ACGTC	2	10	81158	81167	20 %	20 %	20 %	40 %	410480236
54	NC_018650	GGCCT	2	10	82106	82115	0 %	20 %	40 %	40 %	410480238
55	NC_018650	GAGCA	2	10	82295	82304	40 %	0 %	40 %	20 %	410480238
56	NC_018650	TGCTC	2	10	85142	85151	0 %	40 %	20 %	40 %	410480242
57	NC_018650	AGGCC	2	10	85331	85340	20 %	0 %	40 %	40 %	410480242
58	NC_018650	GTTCG	2	10	87067	87076	0 %	40 %	40 %	20 %	410480245
59	NC_018650	TTGAA	2	10	87322	87331	40 %	40 %	20 %	0 %	410480246
60	NC_018650	AGGAA	2	10	87516	87525	60 %	0 %	40 %	0 %	410480246
61	NC_018650	ATTTT	2	10	88158	88167	20 %	80 %	0 %	0 %	410480247
62	NC_018650	CAGCG	2	10	88750	88759	20 %	0 %	40 %	40 %	410480248
63	NC_018650	GGGAT	2	10	88893	88902	20 %	20 %	60 %	0 %	410480248
64	NC_018650	GGCCT	2	10	89250	89259	0 %	20 %	40 %	40 %	410480249
65	NC_018650	GAGCA	2	10	89439	89448	40 %	0 %	40 %	20 %	410480249
66	NC_018650	GCCAA	2	10	91149	91158	40 %	0 %	20 %	40 %	410480251
67	NC_018650	GCATC	2	10	91640	91649	20 %	20 %	20 %	40 %	410480251
68	NC_018650	CGCGC	2	10	92819	92828	0 %	0 %	40 %	60 %	410480251
69	NC_018650	TCTTT	2	10	95513	95522	0 %	80 %	0 %	20 %	410480255
70	NC_018650	CTTAC	2	10	96701	96710	20 %	40 %	0 %	40 %	410480256
71	NC_018650	TTAAT	2	10	96855	96864	40 %	60 %	0 %	0 %	410480256
72	NC_018650	GTTTG	2	10	99325	99334	0 %	60 %	40 %	0 %	410480257
73	NC_018650	CTTTA	2	10	99871	99880	20 %	60 %	0 %	20 %	410480257
74	NC_018650	CGGAC	2	10	102423	102432	20 %	0 %	40 %	40 %	410480259
75	NC_018650	GTGTG	2	10	110722	110731	0 %	40 %	60 %	0 %	410480265
76	NC_018650	CGGGA	2	10	111505	111514	20 %	0 %	60 %	20 %	410480266
77	NC_018650	CCAGG	2	10	111982	111991	20 %	0 %	40 %	40 %	410480266
78	NC_018650	GAATC	2	10	116396	116405	40 %	20 %	20 %	20 %	410480270
79	NC_018650	CAGAT	2	10	118494	118503	40 %	20 %	20 %	20 %	410480274
80	NC_018650	TGGCG	2	10	119932	119941	0 %	20 %	60 %	20 %	410480275
81	NC_018650	ACGCT	2	10	121969	121978	20 %	20 %	20 %	40 %	410480279
82	NC_018650	GAATG	2	10	126549	126558	40 %	20 %	40 %	0 %	410480283
83	NC_018650	TCTAT	2	10	127299	127308	20 %	60 %	0 %	20 %	410480284
84	NC_018650	ATTTA	2	10	128444	128453	40 %	60 %	0 %	0 %	410480285
85	NC_018650	TATAA	2	10	128788	128797	60 %	40 %	0 %	0 %	410480285
86	NC_018650	AACAA	2	10	129086	129095	80 %	0 %	0 %	20 %	410480286
87	NC_018650	AATTA	2	10	129180	129189	60 %	40 %	0 %	0 %	410480286
88	NC_018650	CAATG	2	10	131606	131615	40 %	20 %	20 %	20 %	410480288
89	NC_018650	TGTGC	2	10	133928	133937	0 %	40 %	40 %	20 %	410480290
90	NC_018650	ACGGA	2	10	140416	140425	40 %	0 %	40 %	20 %	410480296
91	NC_018650	GCGCG	2	10	140709	140718	0 %	0 %	60 %	40 %	410480296
92	NC_018650	TCATC	2	10	142167	142176	20 %	40 %	0 %	40 %	410480297
93	NC_018650	GCACA	2	10	145037	145046	40 %	0 %	20 %	40 %	410480300
94	NC_018650	AACAA	2	10	145181	145190	80 %	0 %	0 %	20 %	410480301
95	NC_018650	GCGGT	2	10	146212	146221	0 %	20 %	60 %	20 %	410480302
96	NC_018650	CCACG	2	10	147210	147219	20 %	0 %	20 %	60 %	410480303
97	NC_018650	GGGAT	2	10	147548	147557	20 %	20 %	60 %	0 %	410480303
98	NC_018650	GGGCA	2	10	147743	147752	20 %	0 %	60 %	20 %	410480304
99	NC_018650	CAAAG	2	10	149840	149849	60 %	0 %	20 %	20 %	410480306
100	NC_018650	TCTTT	2	10	149855	149864	0 %	80 %	0 %	20 %	410480306
101	NC_018650	CATGC	2	10	149891	149900	20 %	20 %	20 %	40 %	410480306
102	NC_018650	CGGTG	2	10	154171	154180	0 %	20 %	60 %	20 %	410480308
103	NC_018650	CAGAG	2	10	154382	154391	40 %	0 %	40 %	20 %	410480308
104	NC_018650	TTTGG	2	10	155725	155734	0 %	60 %	40 %	0 %	410480308
105	NC_018650	CGCTG	2	10	156376	156385	0 %	20 %	40 %	40 %	410480308
106	NC_018650	TGCAT	2	10	159346	159355	20 %	40 %	20 %	20 %	410480312
107	NC_018650	GCAGT	2	10	159408	159417	20 %	20 %	40 %	20 %	410480312
108	NC_018650	ATTGC	2	10	159838	159847	20 %	40 %	20 %	20 %	410480313
109	NC_018650	ACCGT	2	10	161458	161467	20 %	20 %	20 %	40 %	410480314
110	NC_018650	GGTCA	2	10	161826	161835	20 %	20 %	40 %	20 %	410480314
111	NC_018650	CGGTG	2	10	171633	171642	0 %	20 %	60 %	20 %	410480321
112	NC_018650	CGGGC	2	10	173554	173563	0 %	0 %	60 %	40 %	410480321
113	NC_018650	CGCAG	2	10	175769	175778	20 %	0 %	40 %	40 %	410480323
114	NC_018650	CGCGG	2	10	177205	177214	0 %	0 %	60 %	40 %	410480324
115	NC_018650	TGATG	2	10	180269	180278	20 %	40 %	40 %	0 %	410480326
116	NC_018650	AGATG	2	10	182216	182225	40 %	20 %	40 %	0 %	410480329
117	NC_018650	AGGTA	2	10	182702	182711	40 %	20 %	40 %	0 %	410480329
118	NC_018650	GGCGA	2	10	186186	186195	20 %	0 %	60 %	20 %	410480333
119	NC_018650	GCCAG	2	10	189804	189813	20 %	0 %	40 %	40 %	410480336
120	NC_018650	AGCCC	2	10	190858	190867	20 %	0 %	20 %	60 %	410480337
121	NC_018650	TTGGG	2	10	193009	193018	0 %	40 %	60 %	0 %	410480340
122	NC_018650	AGCGG	2	10	194030	194039	20 %	0 %	60 %	20 %	410480341
123	NC_018650	CCCAA	2	10	195961	195970	40 %	0 %	0 %	60 %	410480344
124	NC_018650	CATGG	2	10	199967	199976	20 %	20 %	40 %	20 %	410480346
125	NC_018650	AAAGC	2	10	200595	200604	60 %	0 %	20 %	20 %	410480346
126	NC_018650	ATGCC	2	10	202940	202949	20 %	20 %	20 %	40 %	410480348
127	NC_018650	AGCGT	2	10	203377	203386	20 %	20 %	40 %	20 %	410480348
128	NC_018650	CTGGG	2	10	206088	206097	0 %	20 %	60 %	20 %	410480350
129	NC_018650	GCGCA	2	10	209191	209200	20 %	0 %	40 %	40 %	410480354
130	NC_018650	CTGGG	2	10	211016	211025	0 %	20 %	60 %	20 %	410480356
131	NC_018650	ATCGA	2	10	212465	212474	40 %	20 %	20 %	20 %	410480357
132	NC_018650	GTTAC	2	10	214292	214301	20 %	40 %	20 %	20 %	410480359
133	NC_018650	TTACG	2	10	215807	215816	20 %	40 %	20 %	20 %	410480361
134	NC_018650	GCTTC	2	10	217735	217744	0 %	40 %	20 %	40 %	410480363
135	NC_018650	TTCGC	2	10	219884	219893	0 %	40 %	20 %	40 %	410480364
136	NC_018650	CATTA	2	10	221937	221946	40 %	40 %	0 %	20 %	410480367
137	NC_018650	TGGTG	2	10	223129	223138	0 %	40 %	60 %	0 %	410480368
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174	NC_018650	AAAAG	2	10	282530	282539	80 %	0 %	20 %	0 %	410480410
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249	NC_018650	AGAGA	2	10	389447	389456	60 %	0 %	40 %	0 %	410480513
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259	NC_018650	GTACG	2	10	402521	402530	20 %	20 %	40 %	20 %	410480523
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261	NC_018650	GGCGC	2	10	410957	410966	0 %	0 %	60 %	40 %	410480530
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263	NC_018650	GGTTC	2	10	413184	413193	0 %	40 %	40 %	20 %	410480533
264	NC_018650	CGATG	2	10	415226	415235	20 %	20 %	40 %	20 %	410480534
265	NC_018650	GGTTT	2	10	416683	416692	0 %	60 %	40 %	0 %	410480535
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295	NC_018650	ATTTT	2	10	472008	472017	20 %	80 %	0 %	0 %	410480584
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331	NC_018650	CCCAG	2	10	554058	554067	20 %	0 %	20 %	60 %	410480682
332	NC_018650	GCGTG	2	10	564227	564236	0 %	20 %	60 %	20 %	410480690
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382	NC_018650	AGGTC	2	10	649933	649942	20 %	20 %	40 %	20 %	410480772
383	NC_018650	CGACG	2	10	651793	651802	20 %	0 %	40 %	40 %	410480776
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387	NC_018650	TTGAA	2	10	660220	660229	40 %	40 %	20 %	0 %	410480784
388	NC_018650	CGTTA	2	10	662547	662556	20 %	40 %	20 %	20 %	410480786
389	NC_018650	ATCGC	2	10	664738	664747	20 %	20 %	20 %	40 %	410480788
390	NC_018650	ATTCG	2	10	666548	666557	20 %	40 %	20 %	20 %	410480791
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