MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018650	ATCG	2	8	8553	8560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018650	TCAC	2	8	14390	14397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018650	TACT	2	8	16833	16840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018650	CTTA	2	8	17339	17346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018650	GGGA	2	8	30784	30791	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018650	TAAA	2	8	31369	31376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018650	ATGC	2	8	37473	37480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018650	TATG	2	8	46453	46460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018650	AATT	2	8	47884	47891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018650	AAAT	2	8	48453	48460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018650	ATTC	2	8	48496	48503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018650	ATGA	2	8	52457	52464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018650	CGAT	2	8	56961	56968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018650	CGAT	2	8	56974	56981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018650	ATCG	2	8	56991	56998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018650	TCTG	2	8	58062	58069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018650	TCAG	2	8	58973	58980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018650	TTTA	2	8	59418	59425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018650	GACG	2	8	59646	59653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018650	GATA	2	8	59777	59784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018650	TTAT	2	8	60445	60452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018650	CCGT	2	8	61061	61068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018650	CTGC	2	8	61316	61323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018650	GTGA	2	8	63026	63033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018650	TCCC	2	8	63698	63705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018650	TTGA	2	8	65495	65502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018650	CAAT	2	8	65560	65567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018650	CTGG	2	8	65744	65751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018650	GCGG	2	8	65805	65812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018650	CAGC	2	8	65897	65904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018650	CGGC	2	8	70228	70235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018650	AATC	2	8	83302	83309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018650	TAAC	2	8	95713	95720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018650	AAAT	2	8	95891	95898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018650	TCTG	2	8	113417	113424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018650	AAAG	2	8	113594	113601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018650	TCAA	2	8	113661	113668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018650	AAAG	2	8	114542	114549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018650	AAAT	2	8	120850	120857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018650	AGGA	2	8	123905	123912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018650	TGAT	2	8	123958	123965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018650	ATAA	2	8	135523	135530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018650	ATCA	2	8	136572	136579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018650	TTAT	2	8	136650	136657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018650	GCTG	2	8	144207	144214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018650	TACA	2	8	148208	148215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018650	AATG	2	8	152002	152009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018650	GAAA	2	8	158066	158073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018650	TTAA	2	8	158169	158176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018650	ATTA	2	8	158875	158882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018650	GAGT	2	8	165586	165593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018650	TAAA	2	8	165608	165615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018650	TCAT	2	8	165625	165632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018650	CTTA	2	8	165830	165837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018650	TTGC	2	8	166363	166370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018650	ACCT	2	8	166631	166638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018650	TGTT	2	8	169569	169576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018650	TTCC	2	8	169579	169586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018650	TAAA	2	8	169627	169634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018650	ATTT	2	8	173897	173904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018650	ATTA	2	8	177935	177942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018650	AAAT	2	8	177950	177957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018650	TGTC	2	8	191635	191642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018650	TGAT	2	8	193310	193317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018650	AAGG	2	8	196268	196275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018650	GTTT	2	8	196503	196510	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018650	GGCG	2	8	196531	196538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018650	GCTG	2	8	198000	198007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018650	ATCC	2	8	198069	198076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018650	TGGA	2	8	198125	198132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018650	AGGA	2	8	198412	198419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018650	ATTC	2	8	203763	203770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018650	GCGA	2	8	205049	205056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018650	CGAT	2	8	206565	206572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018650	CCTG	2	8	208037	208044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018650	TAAT	3	12	208081	208092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018650	ATAA	2	8	210192	210199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018650	TCCA	2	8	210565	210572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018650	CCTT	2	8	210588	210595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018650	CAGA	2	8	213833	213840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018650	ATTT	2	8	214158	214165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018650	CGAT	2	8	214196	214203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018650	TATT	2	8	214204	214211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018650	GTAA	2	8	218098	218105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018650	TCAT	2	8	222403	222410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018650	AAAT	2	8	223755	223762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018650	AATT	2	8	223915	223922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018650	GTTT	2	8	229750	229757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018650	TTCG	2	8	231571	231578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018650	TGGC	2	8	231913	231920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018650	TTTG	2	8	232116	232123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018650	AGAA	2	8	239361	239368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018650	GCAA	2	8	242986	242993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018650	ATTA	2	8	243973	243980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018650	CTGG	2	8	262475	262482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018650	TAAA	2	8	266332	266339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018650	CAGC	2	8	269652	269659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018650	GGCT	2	8	269671	269678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018650	ATTG	2	8	271616	271623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018650	AAAT	2	8	273328	273335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018650	TGCT	2	8	274926	274933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018650	ATTT	2	8	275036	275043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018650	ATCA	2	8	275044	275051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018650	ATTA	2	8	275079	275086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018650	TAAG	2	8	282746	282753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018650	CTTT	2	8	282937	282944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018650	AATA	2	8	288521	288528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018650	ACTA	2	8	288980	288987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018650	CAGA	2	8	290120	290127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018650	CTGG	2	8	292908	292915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018650	CTGG	2	8	293139	293146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018650	GTAA	2	8	295862	295869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018650	CTAT	2	8	301377	301384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018650	TACT	2	8	304909	304916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018650	GTTT	2	8	313989	313996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018650	ATCT	2	8	315345	315352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018650	AACC	2	8	315506	315513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018650	AGTT	2	8	315517	315524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018650	GGCT	2	8	321027	321034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018650	ATTT	2	8	322592	322599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018650	TAAA	2	8	335363	335370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018650	ATTG	2	8	338997	339004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018650	GGAA	2	8	339938	339945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018650	ATAA	2	8	341342	341349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018650	GGAT	2	8	341407	341414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018650	TTAA	2	8	342691	342698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018650	GGCA	2	8	343469	343476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018650	TTTA	2	8	343845	343852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018650	CGAT	2	8	344341	344348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018650	TAAT	2	8	344703	344710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018650	GCAT	2	8	344943	344950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018650	GGAT	2	8	345184	345191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018650	GAAA	2	8	350446	350453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018650	AAGG	2	8	350553	350560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018650	GCGT	2	8	350656	350663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018650	ATCT	2	8	351095	351102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018650	TCAT	2	8	360241	360248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018650	TACG	2	8	360986	360993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018650	TATC	2	8	372416	372423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018650	GCGG	2	8	373743	373750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018650	TTGA	2	8	377456	377463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018650	TAAA	2	8	385646	385653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018650	TTAT	2	8	387591	387598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018650	AAAT	2	8	387692	387699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018650	AAGG	2	8	387706	387713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018650	AGCC	2	8	388444	388451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018650	GCCT	2	8	390462	390469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018650	CTCG	2	8	390483	390490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018650	ATCT	2	8	390638	390645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018650	GGAT	2	8	391704	391711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018650	TTGT	2	8	410717	410724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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