MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018649	AGGACC	2	12	9835	9846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018649	AATTGG	2	12	19226	19237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018649	CCTGGT	2	12	20010	20021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018649	TTCCGT	2	12	45533	45544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018649	CCCCGG	2	12	155480	155491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018649	TTCCCA	2	12	176589	176600	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018649	AAAACC	2	12	192965	192976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018649	CGGTGG	2	12	227494	227505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018649	CCTGTC	2	12	316763	316774	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018649	TCATGA	2	12	321630	321641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018649	CCCGCT	2	12	329927	329938	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018649	ATAAAA	2	12	377394	377405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018649	CGAAAT	2	12	506390	506401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018649	CGACGT	2	12	540827	540838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018649	GGCCCG	2	12	566302	566313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018649	TCCGTC	2	12	569443	569454	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018649	GAGGGA	2	12	581306	581317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018649	GAACGG	2	12	584067	584078	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018649	ATTCAA	2	12	596087	596098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018649	GGTATA	2	12	625905	625916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018649	ACGCGC	2	12	625927	625938	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018649	CTTTTT	2	12	663242	663253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018649	ATAAAG	2	12	664838	664849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018649	GAAGGG	2	12	678286	678297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018649	TCCGGA	2	12	725150	725161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018649	ACCTTC	2	12	735724	735735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018649	GGGAAA	2	12	740598	740609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018649	CTTGGC	2	12	760734	760745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018649	AAGAAA	2	12	791721	791732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018649	GAACCG	2	12	798461	798472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018649	ACCAGA	2	12	799725	799736	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018649	GGTTCT	2	12	806616	806627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018649	GTGGGG	2	12	809377	809388	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018649	TAAAAG	2	12	819656	819667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018649	GGTCCC	2	12	920237	920248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018649	GGGAGA	2	12	936654	936665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018649	TTCAGG	2	12	943676	943687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018649	CTCTTT	2	12	1047533	1047544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018649	AAGAGA	2	12	1090124	1090135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018649	GGCCTG	2	12	1295817	1295828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018649	AAGCGA	2	12	1296827	1296838	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018649	CCGGGA	2	12	1298408	1298419	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018649	GCACCC	2	12	1309505	1309516	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018649	GTCCCG	2	12	1363572	1363583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018649	TCGCTT	2	12	1365154	1365165	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018649	CAGGCC	2	12	1366164	1366175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018649	ACACTG	2	12	1373203	1373214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018649	AAAGAA	2	12	1434313	1434324	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018649	ACTTAA	2	12	1506174	1506185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018649	CTTGAG	2	12	1508854	1508865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018649	ACCTTT	2	12	1512922	1512933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018649	GCGTAT	2	12	1513563	1513574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018649	TTTAAA	2	12	1535204	1535215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018649	CAATTT	2	12	1553651	1553662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018649	CCCGCC	2	12	1603942	1603953	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_018649	TGAGGA	2	12	1606738	1606749	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018649	CCCTGG	2	12	1626600	1626611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018649	TCTCCT	2	12	1628536	1628547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018649	TTCCGT	2	12	1634175	1634186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018649	ATTTTT	2	12	1654998	1655009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018649	CAAGCG	2	12	1657407	1657418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018649	CGGACA	2	12	1659723	1659734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018649	AGACGA	2	12	1668199	1668210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018649	TATAAA	2	12	1684933	1684944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018649	GGTCCG	2	12	1728381	1728392	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018649	ACAACC	2	12	1792590	1792601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018649	CTCCGT	2	12	1840590	1840601	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018649	GGAAGT	2	12	1909507	1909518	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018649	ATGTCA	2	12	1910607	1910618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018649	CTCCCC	2	12	1912291	1912302	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_018649	TATCTG	2	12	1930499	1930510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018649	CCGGGT	2	12	1938847	1938858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018649	CCATGA	2	12	1953813	1953824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018649	GTTCTC	2	12	1978804	1978815	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018649	ACTTTC	2	12	1995584	1995595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018649	AAAATA	2	12	2011865	2011876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018649	GTTTTT	2	12	2066766	2066777	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018649	TTTGGG	2	12	2181751	2181762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018649	AGAAAA	2	12	2197045	2197056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018649	TCCATT	2	12	2218151	2218162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018649	TCCATA	2	12	2225039	2225050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018649	TCCAGA	2	12	2247809	2247820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018649	ATCTTG	2	12	2257118	2257129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018649	ACAGAA	2	12	2295846	2295857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018649	TATAAG	2	12	2304783	2304794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018649	CGGAAA	2	12	2314842	2314853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018649	ATATTA	2	12	2321620	2321631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018649	TCTGTC	2	12	2360509	2360520	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.