MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	ATGAAG	2	12	15979	15990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018646	TAAGGA	2	12	17943	17954	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018646	ACTAAT	2	12	21095	21106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018646	TAAGGA	2	12	23776	23787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018646	ACTAAT	2	12	26928	26939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018646	ATTAAT	2	12	28557	28568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018646	ATCAAA	2	12	49592	49603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018646	TAAGGA	2	12	92469	92480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018646	ACTAAT	2	12	95621	95632	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018646	TTCGGG	2	12	96506	96517	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018646	AATGGA	2	12	97264	97275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018646	AATGGA	2	12	102323	102334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018646	TGTTAT	2	12	155413	155424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018646	TTAAAA	2	12	156784	156795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018646	TTAAAT	2	12	168186	168197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018646	TAAGGA	2	12	180191	180202	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018646	ACTAAT	2	12	183343	183354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018646	CTTGTT	2	12	192598	192609	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018646	TTATTT	2	12	202504	202515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018646	AAATAA	2	12	241118	241129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018646	AAAATG	2	12	247673	247684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018646	TAAGGA	2	12	263832	263843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018646	ACTAAT	2	12	266985	266996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018646	TTCGGG	2	12	267872	267883	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018646	TAAGGA	2	12	362739	362750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018646	ACTAAT	2	12	365893	365904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018646	ATAGTT	2	12	379301	379312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018646	AAGTTT	2	12	413501	413512	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018646	TAAGGA	2	12	431884	431895	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018646	ACTAAT	2	12	435036	435047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018646	AAATAA	2	12	440139	440150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018646	GCCATC	2	12	440385	440396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018646	TCTGCT	2	12	440434	440445	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018646	TGCTAT	2	12	480976	480987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018646	CTTTGA	2	12	493499	493510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018646	TTTATA	2	12	514135	514146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018646	AATGGA	2	12	522301	522312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018646	AATGGA	2	12	537218	537229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018646	ATAATG	2	12	553699	553710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018646	AATGGA	2	12	574552	574563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018646	CTTTTT	2	12	664740	664751	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018646	ATTACC	2	12	670381	670392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018646	CAAGCT	2	12	670892	670903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018646	TTTAAA	2	12	677174	677185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018646	ATCTTA	2	12	709857	709868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018646	AGATAA	2	12	719408	719419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018646	AATGGA	2	12	754026	754037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018646	TTATCT	2	12	787379	787390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018646	AGGACT	2	12	818613	818624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018646	ACGATT	2	12	819558	819569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018646	AAACAA	2	12	820504	820515	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018646	TTTTTA	2	12	857302	857313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018646	TTTAGT	2	12	858073	858084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018646	AAAACA	2	12	863253	863264	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018646	AATGGA	2	12	923492	923503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018646	AAAGAT	2	12	935058	935069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018646	ACAATA	2	12	976462	976473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018646	TTAAAA	2	12	977949	977960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018646	AAAAAT	2	12	1002932	1002943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018646	TCATTT	2	12	1071043	1071054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018646	AATTAA	2	12	1106116	1106127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018646	ATTTTA	2	12	1130745	1130756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018646	CCCGAA	2	12	1164198	1164209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018646	TAACCT	2	12	1238702	1238713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018646	ACAGAA	2	12	1253802	1253813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018646	ATCATT	2	12	1311446	1311457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018646	TTGCAA	2	12	1361053	1361064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018646	TTTCTC	2	12	1418943	1418954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018646	ACTCCA	2	12	1462496	1462507	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018646	TTTTCT	2	12	1466708	1466719	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018646	TTCCAT	2	12	1514492	1514503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018646	AAAAAT	2	12	1516350	1516361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018646	TTCCAT	2	12	1567376	1567387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018646	ATTTCA	2	12	1571024	1571035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018646	TTTTAT	2	12	1633464	1633475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018646	AAATAA	2	12	1645523	1645534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018646	ATATTT	2	12	1645777	1645788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018646	ATAAAA	2	12	1645820	1645831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018646	CTTTAT	2	12	1658261	1658272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018646	TTTCAT	2	12	1680536	1680547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018646	CATTTA	2	12	1706191	1706202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018646	AAAAGT	2	12	1734580	1734591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018646	TTCAAT	2	12	1781735	1781746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018646	TTTTTG	2	12	1838623	1838634	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018646	ATCTTT	2	12	1840937	1840948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018646	GTACTT	2	12	1868623	1868634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018646	CTTCTG	2	12	1892108	1892119	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018646	AGAAAC	2	12	1897933	1897944	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018646	TATCAA	2	12	1898868	1898879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018646	GTTTTC	2	12	1908677	1908688	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018646	TATTCT	2	12	1919830	1919841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018646	AGGAAA	2	12	1929372	1929383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018646	AAATAC	2	12	1930912	1930923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018646	ATAGTT	2	12	1971550	1971561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018646	TTCAAG	2	12	1971712	1971723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018646	TAAAAA	2	12	1989747	1989758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018646	TTCCAT	2	12	1991933	1991944	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018646	TTTTTA	2	12	2002745	2002756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018646	TAAATT	2	12	2046873	2046884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018646	CTATAA	2	12	2060787	2060798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.