MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406708524
2	NC_018646	TGCTTA	2	12	9003	9014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708531
3	NC_018646	AGAAAA	2	12	10766	10777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406708534
4	NC_018646	GTATTG	2	12	12229	12240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406708536
5	NC_018646	GAAAGA	2	12	15245	15256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708538
6	NC_018646	CTACAG	2	12	29732	29743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406708539
7	NC_018646	AGGTCA	2	12	36901	36912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708547
8	NC_018646	GCAGAA	2	12	36948	36959	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406708547
9	NC_018646	ACTGAG	2	12	37197	37208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708547
10	NC_018646	CAGGCG	2	12	37651	37662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406708547
11	NC_018646	TGATGC	2	12	45296	45307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708552
12	NC_018646	AATGAA	2	12	47326	47337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406708554
13	NC_018646	CAAATA	2	12	48522	48533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708554
14	NC_018646	TTTTTG	2	12	51106	51117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406708557
15	NC_018646	ATTTAG	2	12	52819	52830	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708559
16	NC_018646	AGGTAG	2	12	53029	53040	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	406708559
17	NC_018646	ACCAAA	2	12	55977	55988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708563
18	NC_018646	CTTTGC	2	12	58385	58396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	406708565
19	NC_018646	GAACTT	2	12	61976	61987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406708568
20	NC_018646	ATATTT	2	12	64214	64225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708570
21	NC_018646	CGTACC	2	12	65865	65876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406708571
22	NC_018646	GGTAAA	2	12	66700	66711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406708573
23	NC_018646	CAGTAT	2	12	74081	74092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406708577
24	NC_018646	AAAGGT	2	12	76743	76754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406708580
25	NC_018646	CGCAAT	2	12	79324	79335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406708585
26	NC_018646	ATTGAA	2	12	79736	79747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708586
27	NC_018646	ACATCA	2	12	79872	79883	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406708586
28	NC_018646	ATCGTT	2	12	82413	82424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708592
29	NC_018646	TAAAGG	2	12	83829	83840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406708595
30	NC_018646	ATAAAA	2	12	84012	84023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406708596
31	NC_018646	TTTCTG	2	12	84843	84854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406708597
32	NC_018646	AAATTA	2	12	84887	84898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708598
33	NC_018646	ATTGAA	2	12	87816	87827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708602
34	NC_018646	GTAAAG	2	12	88501	88512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406708604
35	NC_018646	TTTTCT	2	12	106068	106079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406708616
36	NC_018646	TTTTGA	2	12	107018	107029	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406708617
37	NC_018646	ACTGAA	2	12	107864	107875	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708618
38	NC_018646	AACTCA	2	12	109267	109278	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406708619
39	NC_018646	TTGTCA	2	12	109424	109435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708619
40	NC_018646	GATATT	2	12	113453	113464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708622
41	NC_018646	TAACGA	2	12	116500	116511	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708626
42	NC_018646	TGACCT	2	12	119291	119302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406708629
43	NC_018646	CACCGT	2	12	120465	120476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406708629
44	NC_018646	TAGCTG	2	12	123632	123643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708632
45	NC_018646	GAGGAA	2	12	125269	125280	50 %	0 %	50 %	0 %	406708634
46	NC_018646	CAATGG	2	12	125900	125911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708634
47	NC_018646	GTGTTT	2	12	127456	127467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708635
48	NC_018646	GCTTTT	2	12	129710	129721	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406708637
49	NC_018646	TCAGGT	2	12	136370	136381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708644
50	NC_018646	CAAAGA	2	12	136472	136483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406708644
51	NC_018646	TAGTAT	2	12	137822	137833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708646
52	NC_018646	GTTAAC	2	12	142271	142282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406708649
53	NC_018646	GTTCAT	2	12	145255	145266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708653
54	NC_018646	GTTGAA	2	12	145372	145383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708653
55	NC_018646	ACAAAA	2	12	146425	146436	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	406708654
56	NC_018646	CAGAAG	2	12	146813	146824	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406708654
57	NC_018646	TCTAAT	2	12	152204	152215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406708659
58	NC_018646	CAACAT	2	12	153011	153022	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406708660
59	NC_018646	TTGATA	2	12	157950	157961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708668
60	NC_018646	TTTGAT	2	12	162781	162792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406708671
61	NC_018646	TTTAGA	2	12	166903	166914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708675
62	NC_018646	TTTCTA	2	12	167599	167610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406708675
63	NC_018646	TTTGGT	2	12	169862	169873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708678
64	NC_018646	TCTGTT	2	12	170586	170597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	406708678
65	NC_018646	AAATCA	2	12	177679	177690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708684
66	NC_018646	GACAAC	2	12	177779	177790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406708684
67	NC_018646	ATAATG	2	12	183969	183980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708685
68	NC_018646	TATTGC	2	12	186416	186427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708688
69	NC_018646	TAAACC	2	12	187919	187930	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406708689
70	NC_018646	TACGGT	2	12	196865	196876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708693
71	NC_018646	GTGAAG	2	12	197910	197921	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	406708693
72	NC_018646	GTGTAT	2	12	204935	204946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406708700
73	NC_018646	TATTAG	2	12	206192	206203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708702
74	NC_018646	GCTTGT	2	12	208416	208427	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	406708706
75	NC_018646	CAGTTT	2	12	211425	211436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708711
76	NC_018646	GCTTTG	2	12	213181	213192	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	406708713
77	NC_018646	TGGTAG	2	12	216284	216295	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406708716
78	NC_018646	TCAAAA	2	12	217440	217451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708718
79	NC_018646	AGCTAA	2	12	218403	218414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708718
80	NC_018646	GTCATG	2	12	218933	218944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708718
81	NC_018646	AAGGTA	2	12	222739	222750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406708723
82	NC_018646	GTTGAA	2	12	228847	228858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708726
83	NC_018646	AAATCA	2	12	229651	229662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708727
84	NC_018646	ATTGAT	2	12	236059	236070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708732
85	NC_018646	GCACAA	2	12	243356	243367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406708743
86	NC_018646	AGACTA	2	12	248605	248616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708750
87	NC_018646	AGCTAA	2	12	254364	254375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708759
88	NC_018646	ATGTGA	2	12	256693	256704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708763
89	NC_018646	AGGATT	2	12	258403	258414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708764
90	NC_018646	TTCCAA	2	12	260485	260496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708767
91	NC_018646	AGCAGA	2	12	271942	271953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406708771
92	NC_018646	TTCTTT	2	12	277447	277458	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406708780
93	NC_018646	TTTTCC	2	12	278265	278276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708780
94	NC_018646	TTAAAT	2	12	280896	280907	50 %	50 %	0 %	0 %	406708784
95	NC_018646	CATAAG	2	12	283039	283050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708787
96	NC_018646	CAGAAG	2	12	293838	293849	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406708797
97	NC_018646	TTAGAC	2	12	296757	296768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406708800
98	NC_018646	GTTCAG	2	12	308299	308310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708810
99	NC_018646	ATTTTA	2	12	311205	311216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708812
100	NC_018646	AACGTA	2	12	312030	312041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406708812
101	NC_018646	TATTGA	2	12	312106	312117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406708812
102	NC_018646	GAAAAA	3	18	312394	312411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406708812
103	NC_018646	AATTGA	2	12	314553	314564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708815
104	NC_018646	TGAAAT	2	12	317776	317787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708818
105	NC_018646	ACTTAT	2	12	317798	317809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406708818
106	NC_018646	TAGTAA	2	12	320336	320347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406708820
107	NC_018646	TTACCA	3	18	320412	320429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708821
108	NC_018646	AGTACC	2	12	320987	320998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406708821
109	NC_018646	TTTTCT	2	12	323153	323164	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406708822
110	NC_018646	CAAGAA	2	12	326280	326291	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406708827
111	NC_018646	AGTTCT	2	12	326517	326528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708827
112	NC_018646	AATGGT	2	12	327243	327254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708827
113	NC_018646	AATGAA	2	12	328326	328337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406708829
114	NC_018646	AAAGAA	2	12	335148	335159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	406708836
115	NC_018646	GAGCTA	2	12	336527	336538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708837
116	NC_018646	AATTGG	2	12	339466	339477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708839
117	NC_018646	GTATCG	2	12	340331	340342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708840
118	NC_018646	TTTTAT	2	12	342912	342923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406708842
119	NC_018646	ATATTA	2	12	343214	343225	50 %	50 %	0 %	0 %	406708842
120	NC_018646	TAGATG	2	12	346790	346801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708846
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122	NC_018646	AAATCA	2	12	350505	350516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406708851
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127	NC_018646	AATTTA	2	12	374301	374312	50 %	50 %	0 %	0 %	406708870
128	NC_018646	GACTGT	2	12	375516	375527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406708871
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130	NC_018646	TTAGCT	2	12	378931	378942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406708875
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229	NC_018646	CATTAT	2	12	687762	687773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406709160
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347	NC_018646	TCTTTT	2	12	1021021	1021032	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406709461
348	NC_018646	CTGCTT	2	12	1021979	1021990	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	406709462
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452	NC_018646	AGCAAT	2	12	1312750	1312761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406709745
453	NC_018646	TAACAA	2	12	1316723	1316734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406709749
454	NC_018646	TTTATA	2	12	1320804	1320815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406709754
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456	NC_018646	TTTTCA	2	12	1324333	1324344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406709756
457	NC_018646	TCAACT	2	12	1324977	1324988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406709757
458	NC_018646	TTTGTA	2	12	1328597	1328608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406709763
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