MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	406708524
2	NC_018646	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	406708524
3	NC_018646	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	406708524
4	NC_018646	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	406708525
5	NC_018646	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	406708525
6	NC_018646	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	406708526
7	NC_018646	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	406708526
8	NC_018646	TGGTA	2	10	4595	4604	20 %	40 %	40 %	0 %	406708529
9	NC_018646	TTTAT	2	10	5844	5853	20 %	80 %	0 %	0 %	406708530
10	NC_018646	TGGGT	2	10	10394	10403	0 %	40 %	60 %	0 %	406708533
11	NC_018646	ACTAT	2	10	12919	12928	40 %	40 %	0 %	20 %	406708536
12	NC_018646	GGATA	2	10	13148	13157	40 %	20 %	40 %	0 %	406708536
13	NC_018646	TCGTG	2	10	17469	17478	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018646	GTTAA	2	10	18224	18233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018646	GGGAG	2	10	18743	18752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018646	AGGGA	2	10	20954	20963	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018646	TCGTG	2	10	23302	23311	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018646	GTTAA	2	10	24057	24066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018646	GGGAG	2	10	24576	24585	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018646	AGGGA	2	10	26787	26796	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018646	ATTTT	2	10	32726	32735	20 %	80 %	0 %	0 %	406708542
22	NC_018646	TCAAT	2	10	33154	33163	40 %	40 %	0 %	20 %	406708542
23	NC_018646	CTTTT	2	10	33773	33782	0 %	80 %	0 %	20 %	406708543
24	NC_018646	AACGG	2	10	34871	34880	40 %	0 %	40 %	20 %	406708544
25	NC_018646	TGGTG	2	10	35894	35903	0 %	40 %	60 %	0 %	406708546
26	NC_018646	AGCGA	2	10	40332	40341	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018646	AGCAG	2	10	43248	43257	40 %	0 %	40 %	20 %	406708550
28	NC_018646	GGTCA	2	10	43612	43621	20 %	20 %	40 %	20 %	406708550
29	NC_018646	TTGGG	2	10	44613	44622	0 %	40 %	60 %	0 %	406708552
30	NC_018646	CTTTT	2	10	46147	46156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018646	AATGC	2	10	48560	48569	40 %	20 %	20 %	20 %	406708554
32	NC_018646	GAAAA	2	10	49824	49833	80 %	0 %	20 %	0 %	406708556
33	NC_018646	GTCAT	2	10	51454	51463	20 %	40 %	20 %	20 %	406708557
34	NC_018646	AATCA	2	10	52915	52924	60 %	20 %	0 %	20 %	406708559
35	NC_018646	AGTCT	2	10	53759	53768	20 %	40 %	20 %	20 %	406708560
36	NC_018646	GATGG	2	10	55397	55406	20 %	20 %	60 %	0 %	406708562
37	NC_018646	TCCTC	2	10	57525	57534	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_018646	GCAGG	2	10	58968	58977	20 %	0 %	60 %	20 %	406708565
39	NC_018646	CTGCC	2	10	59934	59943	0 %	20 %	20 %	60 %	406708567
40	NC_018646	TTGAC	2	10	60215	60224	20 %	40 %	20 %	20 %	406708567
41	NC_018646	CTCAG	2	10	60327	60336	20 %	20 %	20 %	40 %	406708567
42	NC_018646	GAATA	2	10	60967	60976	60 %	20 %	20 %	0 %	406708568
43	NC_018646	TGATT	2	10	61861	61870	20 %	60 %	20 %	0 %	406708568
44	NC_018646	TATTT	2	10	61882	61891	20 %	80 %	0 %	0 %	406708568
45	NC_018646	TTTAT	2	10	62103	62112	20 %	80 %	0 %	0 %	406708568
46	NC_018646	TTGAT	2	10	64112	64121	20 %	60 %	20 %	0 %	406708570
47	NC_018646	TGAAA	2	10	65528	65537	60 %	20 %	20 %	0 %	406708571
48	NC_018646	TGTTT	2	10	66100	66109	0 %	80 %	20 %	0 %	406708572
49	NC_018646	TTTAC	2	10	66959	66968	20 %	60 %	0 %	20 %	406708574
50	NC_018646	TTTTA	2	10	67952	67961	20 %	80 %	0 %	0 %	406708574
51	NC_018646	GGTAT	2	10	69707	69716	20 %	40 %	40 %	0 %	406708575
52	NC_018646	AAATA	2	10	76377	76386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018646	GAAAA	2	10	79001	79010	80 %	0 %	20 %	0 %	406708584
54	NC_018646	TTTGG	2	10	79415	79424	0 %	60 %	40 %	0 %	406708585
55	NC_018646	TTCAC	2	10	79771	79780	20 %	40 %	0 %	40 %	406708586
56	NC_018646	GAAAT	2	10	80852	80861	60 %	20 %	20 %	0 %	406708588
57	NC_018646	AAGGA	2	10	81933	81942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018646	TTCCA	2	10	86214	86223	20 %	40 %	0 %	40 %	406708600
59	NC_018646	TCCAA	2	10	86373	86382	40 %	20 %	0 %	40 %	406708600
60	NC_018646	GAATA	2	10	86944	86953	60 %	20 %	20 %	0 %	406708600
61	NC_018646	TCGTG	2	10	91995	92004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018646	GTTAA	2	10	92750	92759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018646	GGGAG	2	10	93269	93278	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018646	AGGGA	2	10	95480	95489	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018646	CTTTA	2	10	95992	96001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018646	AGATA	2	10	97447	97456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018646	GAAGC	2	10	98125	98134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018646	ATTTT	2	10	100063	100072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018646	TTTAA	2	10	100155	100164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018646	AGATA	2	10	102504	102513	60 %	20 %	20 %	0 %	406708612
71	NC_018646	GAAGC	2	10	103181	103190	40 %	0 %	40 %	20 %	406708612
72	NC_018646	TAAAG	2	10	104009	104018	60 %	20 %	20 %	0 %	406708613
73	NC_018646	TATAA	2	10	104551	104560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018646	ATTTG	2	10	104960	104969	20 %	60 %	20 %	0 %	406708614
75	NC_018646	GTTTG	2	10	106294	106303	0 %	60 %	40 %	0 %	406708616
76	NC_018646	ATCAA	2	10	108728	108737	60 %	20 %	0 %	20 %	406708619
77	NC_018646	TATGG	2	10	108986	108995	20 %	40 %	40 %	0 %	406708619
78	NC_018646	CATTA	2	10	112661	112670	40 %	40 %	0 %	20 %	406708621
79	NC_018646	TATTG	2	10	114758	114767	20 %	60 %	20 %	0 %	406708624
80	NC_018646	AATAG	2	10	116359	116368	60 %	20 %	20 %	0 %	406708626
81	NC_018646	TAAAC	2	10	116725	116734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018646	AATAT	2	10	117936	117945	60 %	40 %	0 %	0 %	406708627
83	NC_018646	ATTTA	2	10	119067	119076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018646	AAAAC	2	10	119649	119658	80 %	0 %	0 %	20 %	406708629
85	NC_018646	ATTTT	2	10	120721	120730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018646	CTTTT	2	10	120765	120774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018646	AAAAT	2	10	122362	122371	80 %	20 %	0 %	0 %	406708631
88	NC_018646	CAAGT	2	10	123356	123365	40 %	20 %	20 %	20 %	406708632
89	NC_018646	TGCCA	2	10	125769	125778	20 %	20 %	20 %	40 %	406708634
90	NC_018646	CATGC	2	10	128377	128386	20 %	20 %	20 %	40 %	406708636
91	NC_018646	TGGAT	2	10	128729	128738	20 %	40 %	40 %	0 %	406708636
92	NC_018646	TATAA	2	10	129209	129218	60 %	40 %	0 %	0 %	406708636
93	NC_018646	GTGAT	2	10	130525	130534	20 %	40 %	40 %	0 %	406708638
94	NC_018646	GCTTG	2	10	131731	131740	0 %	40 %	40 %	20 %	406708639
95	NC_018646	TTTGG	2	10	133407	133416	0 %	60 %	40 %	0 %	406708641
96	NC_018646	GAAAA	2	10	135459	135468	80 %	0 %	20 %	0 %	406708643
97	NC_018646	AGTCA	2	10	136020	136029	40 %	20 %	20 %	20 %	406708643
98	NC_018646	GGGTA	2	10	137604	137613	20 %	20 %	60 %	0 %	406708645
99	NC_018646	CTAAG	2	10	137629	137638	40 %	20 %	20 %	20 %	406708645
100	NC_018646	GAAAA	2	10	138853	138862	80 %	0 %	20 %	0 %	406708647
101	NC_018646	GATTT	2	10	139557	139566	20 %	60 %	20 %	0 %	406708647
102	NC_018646	AGTTA	2	10	139862	139871	40 %	40 %	20 %	0 %	406708647
103	NC_018646	TATGA	2	10	140163	140172	40 %	40 %	20 %	0 %	406708648
104	NC_018646	AAACC	2	10	143796	143805	60 %	0 %	0 %	40 %	406708651
105	NC_018646	ATAGA	2	10	143991	144000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018646	ATAAA	2	10	146062	146071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018646	GATTC	2	10	146893	146902	20 %	40 %	20 %	20 %	406708654
108	NC_018646	ACTTG	2	10	148548	148557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018646	TAGAT	2	10	149236	149245	40 %	40 %	20 %	0 %	406708659
110	NC_018646	TGGAT	2	10	150862	150871	20 %	40 %	40 %	0 %	406708659
111	NC_018646	GTTAA	2	10	156453	156462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018646	ATTTT	2	10	156983	156992	20 %	80 %	0 %	0 %	406708667
113	NC_018646	TTGAT	2	10	158790	158799	20 %	60 %	20 %	0 %	406708668
114	NC_018646	TTTTG	2	10	159032	159041	0 %	80 %	20 %	0 %	406708668
115	NC_018646	AAGCA	2	10	159248	159257	60 %	0 %	20 %	20 %	406708668
116	NC_018646	ACTTT	2	10	161916	161925	20 %	60 %	0 %	20 %	406708670
117	NC_018646	GCTTT	2	10	164018	164027	0 %	60 %	20 %	20 %	406708672
118	NC_018646	AATAT	2	10	164292	164301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018646	ATTAC	2	10	165008	165017	40 %	40 %	0 %	20 %	406708673
120	NC_018646	AAATT	2	10	165821	165830	60 %	40 %	0 %	0 %	406708674
121	NC_018646	ATCCT	2	10	166223	166232	20 %	40 %	0 %	40 %	406708674
122	NC_018646	AGTTT	2	10	167369	167378	20 %	60 %	20 %	0 %	406708675
123	NC_018646	ATACC	2	10	169396	169405	40 %	20 %	0 %	40 %	406708677
124	NC_018646	AGGTT	2	10	171392	171401	20 %	40 %	40 %	0 %	406708679
125	NC_018646	ATTTT	2	10	171734	171743	20 %	80 %	0 %	0 %	406708679
126	NC_018646	AATAG	2	10	172253	172262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018646	AAGAC	2	10	172759	172768	60 %	0 %	20 %	20 %	406708680
128	NC_018646	AAAAC	2	10	173838	173847	80 %	0 %	0 %	20 %	406708680
129	NC_018646	TGGGG	2	10	173869	173878	0 %	20 %	80 %	0 %	406708680
130	NC_018646	AATTA	2	10	174176	174185	60 %	40 %	0 %	0 %	406708680
131	NC_018646	ATGAT	2	10	174291	174300	40 %	40 %	20 %	0 %	406708681
132	NC_018646	CAATC	2	10	178038	178047	40 %	20 %	0 %	40 %	406708684
133	NC_018646	TCGTG	2	10	179717	179726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018646	GTTAA	2	10	180472	180481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018646	GGGAG	2	10	180991	181000	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018646	AGGGA	2	10	183202	183211	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018646	TGTTA	2	10	183736	183745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018646	ATTGT	2	10	183927	183936	20 %	60 %	20 %	0 %	406708685
139	NC_018646	ATTAG	2	10	184040	184049	40 %	40 %	20 %	0 %	406708685
140	NC_018646	TTTTA	2	10	186296	186305	20 %	80 %	0 %	0 %	406708688
141	NC_018646	ATCTA	2	10	187434	187443	40 %	40 %	0 %	20 %	406708689
142	NC_018646	TTATT	2	10	188112	188121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018646	GATTG	2	10	191732	191741	20 %	40 %	40 %	0 %	406708691
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146	NC_018646	AGCAA	2	10	200698	200707	60 %	0 %	20 %	20 %	406708696
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148	NC_018646	TATTG	2	10	203066	203075	20 %	60 %	20 %	0 %	406708698
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151	NC_018646	TTTAT	2	10	206704	206713	20 %	80 %	0 %	0 %	406708703
152	NC_018646	AGAAC	2	10	209471	209480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_018646	TATTT	2	10	210161	210170	20 %	80 %	0 %	0 %	406708708
154	NC_018646	GTCTT	2	10	210209	210218	0 %	60 %	20 %	20 %	406708708
155	NC_018646	AGCTA	2	10	210709	210718	40 %	20 %	20 %	20 %	406708710
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161	NC_018646	TATTT	2	10	219320	219329	20 %	80 %	0 %	0 %	406708719
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167	NC_018646	CAATG	2	10	226093	226102	40 %	20 %	20 %	20 %	406708724
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183	NC_018646	TTCTT	2	10	245119	245128	0 %	80 %	0 %	20 %	406708745
184	NC_018646	TTCAT	2	10	245643	245652	20 %	60 %	0 %	20 %	406708745
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197	NC_018646	TGATA	2	10	256196	256205	40 %	40 %	20 %	0 %	406708762
198	NC_018646	AAAAG	2	10	256214	256223	80 %	0 %	20 %	0 %	406708762
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252	NC_018646	CTAGA	2	10	327748	327757	40 %	20 %	20 %	20 %	406708828
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266	NC_018646	AGGAG	2	10	342429	342438	40 %	0 %	60 %	0 %	406708841
267	NC_018646	TTTGT	2	10	343576	343585	0 %	80 %	20 %	0 %	406708843
268	NC_018646	ATAAA	2	10	344534	344543	80 %	20 %	0 %	0 %	406708843
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