MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 3665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018646	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018646	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018646	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018646	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018646	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018646	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018646	GTT	2	6	4055	4060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018646	ATA	2	6	4234	4239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018646	TAG	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018646	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018646	CTA	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018646	CAT	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018646	TCT	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018646	ATA	2	6	4434	4439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018646	AAT	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018646	TTA	2	6	5631	5636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018646	AAG	2	6	9796	9801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018646	TTA	2	6	9872	9877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018646	TAG	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018646	ATC	2	6	10025	10030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018646	TCA	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018646	AAG	2	6	16007	16012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018646	ATA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018646	TAG	2	6	16186	16191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018646	AAC	2	6	16201	16206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018646	GGC	2	6	16430	16435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018646	TGA	2	6	16486	16491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018646	CGA	2	6	16675	16680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018646	GCA	2	6	16749	16754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018646	CGC	2	6	16796	16801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018646	TGT	2	6	16835	16840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018646	AGA	2	6	16844	16849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018646	CAG	2	6	16918	16923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018646	GGA	2	6	17043	17048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018646	GGA	2	6	17108	17113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018646	GAA	2	6	17372	17377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018646	GGT	2	6	17446	17451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018646	GTC	2	6	17460	17465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018646	CAT	2	6	17528	17533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018646	TAA	2	6	17563	17568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018646	GGA	2	6	17572	17577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018646	ATC	2	6	17596	17601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018646	CGC	2	6	17762	17767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018646	CAC	2	6	17807	17812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018646	GAT	2	6	17878	17883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018646	CCT	2	6	17934	17939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018646	AGG	2	6	18036	18041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018646	TAA	2	6	18217	18222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018646	GAA	2	6	18270	18275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018646	ACG	2	6	18287	18292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018646	TAG	2	6	18458	18463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018646	AGG	2	6	18480	18485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018646	AGA	2	6	18545	18550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018646	TCG	2	6	18649	18654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018646	GGA	2	6	18662	18667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018646	ACA	2	6	18780	18785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018646	ATG	2	6	18847	18852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018646	TGT	2	6	18917	18922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018646	GGA	2	6	18980	18985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018646	ACC	2	6	19245	19250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018646	AGC	2	6	19325	19330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018646	AAG	2	6	19462	19467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018646	GAG	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018646	ACA	2	6	19633	19638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018646	GAG	2	6	19777	19782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018646	TAG	2	6	19790	19795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018646	GAT	2	6	20036	20041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018646	CGG	2	6	20127	20132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018646	GTT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018646	TAC	2	6	20397	20402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018646	CCT	2	6	20485	20490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018646	GGT	2	6	20621	20626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018646	TCG	2	6	20736	20741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018646	CGT	2	6	20816	20821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018646	AGT	2	6	21272	21277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018646	TAG	2	6	21635	21640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018646	CGT	2	6	21811	21816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018646	ATA	2	6	21916	21921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018646	CTC	2	6	21985	21990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018646	GGC	2	6	22263	22268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018646	TGA	2	6	22319	22324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018646	CGA	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018646	GCA	2	6	22582	22587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018646	CGC	2	6	22629	22634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018646	TGT	2	6	22668	22673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018646	AGA	2	6	22677	22682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018646	CAG	2	6	22751	22756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018646	GGA	2	6	22876	22881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018646	GGA	2	6	22941	22946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018646	GAA	2	6	23205	23210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018646	GGT	2	6	23279	23284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018646	GTC	2	6	23293	23298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018646	CAT	2	6	23361	23366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018646	TAA	2	6	23396	23401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018646	GGA	2	6	23405	23410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018646	ATC	2	6	23429	23434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018646	CGC	2	6	23595	23600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018646	CAC	2	6	23640	23645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018646	GAT	2	6	23711	23716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018646	CCT	2	6	23767	23772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018646	AGG	2	6	23869	23874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018646	TAA	2	6	24050	24055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018646	GAA	2	6	24103	24108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018646	ACG	2	6	24120	24125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018646	TAG	2	6	24291	24296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018646	AGG	2	6	24313	24318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018646	AGA	2	6	24378	24383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018646	TCG	2	6	24482	24487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018646	GGA	2	6	24495	24500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018646	ACA	2	6	24613	24618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018646	ATG	2	6	24680	24685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018646	TGT	2	6	24750	24755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018646	GGA	2	6	24813	24818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018646	ACC	2	6	25078	25083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018646	AGC	2	6	25158	25163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018646	AAG	2	6	25295	25300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018646	GAG	2	6	25310	25315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018646	ACA	2	6	25466	25471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018646	GAG	2	6	25610	25615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018646	TAG	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018646	GAT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018646	CGG	2	6	25960	25965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018646	GTT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018646	TAC	2	6	26230	26235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018646	CCT	2	6	26318	26323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018646	GGT	2	6	26454	26459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018646	TCG	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018646	CGT	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018646	AGT	2	6	27106	27111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018646	TAG	2	6	27468	27473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018646	CGT	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018646	ATA	2	6	27749	27754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018646	CTC	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018646	CCG	2	6	27994	27999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018646	GGA	2	6	28111	28116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018646	TCC	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018646	AGC	2	6	28221	28226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018646	TCG	2	6	28235	28240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018646	CGG	2	6	28334	28339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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