MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 25951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
2	NC_018646	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
3	NC_018646	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708524
4	NC_018646	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708524
5	NC_018646	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708524
6	NC_018646	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
7	NC_018646	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708524
8	NC_018646	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708524
9	NC_018646	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
10	NC_018646	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
11	NC_018646	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708524
12	NC_018646	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
13	NC_018646	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708524
14	NC_018646	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708524
15	NC_018646	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
16	NC_018646	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
17	NC_018646	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
18	NC_018646	TTA	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
19	NC_018646	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
20	NC_018646	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
21	NC_018646	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
22	NC_018646	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
23	NC_018646	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708525
24	NC_018646	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
25	NC_018646	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
26	NC_018646	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708525
27	NC_018646	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708525
28	NC_018646	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
29	NC_018646	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708525
30	NC_018646	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
31	NC_018646	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
32	NC_018646	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708526
33	NC_018646	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708526
34	NC_018646	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
35	NC_018646	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
36	NC_018646	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708526
37	NC_018646	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
38	NC_018646	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
39	NC_018646	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708526
40	NC_018646	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708526
41	NC_018646	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
42	NC_018646	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
43	NC_018646	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708527
44	NC_018646	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708527
45	NC_018646	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708529
46	NC_018646	GCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
47	NC_018646	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
48	NC_018646	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
49	NC_018646	GTT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708529
50	NC_018646	AAC	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708529
51	NC_018646	TGA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
52	NC_018646	TGA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
53	NC_018646	AGT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
54	NC_018646	GAA	3	9	5217	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
55	NC_018646	TGA	3	9	5237	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
56	NC_018646	ATC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708529
57	NC_018646	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
58	NC_018646	GCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
59	NC_018646	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708529
60	NC_018646	ATG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
61	NC_018646	AAG	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
62	NC_018646	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
63	NC_018646	TAG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
64	NC_018646	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708530
65	NC_018646	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708530
66	NC_018646	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708530
67	NC_018646	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708530
68	NC_018646	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708530
69	NC_018646	GAT	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708530
70	NC_018646	CTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708530
71	NC_018646	TAT	2	6	6025	6030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
72	NC_018646	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
73	NC_018646	ATG	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708530
74	NC_018646	TAT	2	6	6188	6193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
75	NC_018646	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
76	NC_018646	GTG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708531
77	NC_018646	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
78	NC_018646	GCA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
79	NC_018646	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708531
80	NC_018646	CAG	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
81	NC_018646	ATT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
82	NC_018646	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708531
83	NC_018646	TGA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
84	NC_018646	ACA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708531
85	NC_018646	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708531
86	NC_018646	TCA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708531
87	NC_018646	TTG	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
88	NC_018646	TTG	2	6	7559	7564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
89	NC_018646	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
90	NC_018646	ATG	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
91	NC_018646	AGA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
92	NC_018646	TGA	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
93	NC_018646	TTG	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
94	NC_018646	ATA	2	6	8036	8041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708531
95	NC_018646	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
96	NC_018646	CAA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708531
97	NC_018646	CAG	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
98	NC_018646	ATT	3	9	8392	8400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
99	NC_018646	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
100	NC_018646	TGA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
101	NC_018646	TAT	2	6	8679	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
102	NC_018646	AGG	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708531
103	NC_018646	AAT	2	6	8883	8888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708531
104	NC_018646	TTG	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
105	NC_018646	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708531
106	NC_018646	CCA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708531
107	NC_018646	CAG	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708531
108	NC_018646	TAG	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708531
109	NC_018646	ATT	2	6	9566	9571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
110	NC_018646	GTT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708531
111	NC_018646	ATT	2	6	9670	9675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708531
112	NC_018646	GAA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
113	NC_018646	AGA	2	6	9732	9737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708531
114	NC_018646	CGT	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708532
115	NC_018646	AAG	2	6	10090	10095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708532
116	NC_018646	TCA	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708532
117	NC_018646	TAA	2	6	10187	10192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708532
118	NC_018646	TTG	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708532
119	NC_018646	ATT	2	6	10263	10268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708532
120	NC_018646	TGT	2	6	10305	10310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708533
121	NC_018646	GAG	2	6	10366	10371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708533
122	NC_018646	CGT	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708533
123	NC_018646	AAG	2	6	10484	10489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708533
124	NC_018646	TAT	2	6	10603	10608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708533
125	NC_018646	AAT	2	6	10658	10663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708533
126	NC_018646	AAT	2	6	10668	10673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708534
127	NC_018646	AGA	2	6	10721	10726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708534
128	NC_018646	GAA	2	6	10801	10806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708535
129	NC_018646	CTT	2	6	10816	10821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708535
130	NC_018646	GAG	2	6	10865	10870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708535
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255	NC_018646	TCA	2	6	30352	30357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708540
256	NC_018646	CAT	2	6	30475	30480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708540
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258	NC_018646	TGA	2	6	30810	30815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708540
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262	NC_018646	TGA	2	6	30987	30992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708540
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