MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	TAAAAA	2	12	12047	12058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018644	TTATAA	2	12	79430	79441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018644	AAATTG	2	12	112762	112773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018644	AATTAA	2	12	188979	188990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018644	ATTAAA	2	12	317432	317443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018644	TTTTAG	2	12	391101	391112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018644	ATTCCT	2	12	519857	519868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018644	ATTTTT	2	12	530660	530671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018644	AAAAAT	2	12	531079	531090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018644	TTAATA	2	12	577142	577153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018644	ATTATA	2	12	625873	625884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018644	CTAAAA	2	12	654441	654452	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018644	TTGAAT	2	12	818863	818874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018644	ATCATT	2	12	971819	971830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018644	TTGAAA	2	12	1033619	1033630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018644	TAAAAA	2	12	1203080	1203091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018644	TAAATT	2	12	1247404	1247415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018644	TCGCTT	2	12	1383917	1383928	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018644	GTTTGT	2	12	1384537	1384548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018644	ATTTTT	2	12	1392234	1392245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.