MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 18682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018644	GAA	2	6	270233	270238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707319
3502	NC_018644	CTC	2	6	270248	270253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707319
3503	NC_018644	ATC	2	6	270267	270272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707319
3504	NC_018644	AAT	2	6	270328	270333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707319
3505	NC_018644	TAA	2	6	270511	270516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707320
3506	NC_018644	CAA	2	6	270571	270576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707320
3507	NC_018644	TTG	2	6	270584	270589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707320
3508	NC_018644	ACT	2	6	270594	270599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707320
3509	NC_018644	TCT	2	6	270636	270641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707320
3510	NC_018644	TTG	2	6	270717	270722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707320
3511	NC_018644	GTC	2	6	270774	270779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707320
3512	NC_018644	CAG	2	6	270848	270853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707320
3513	NC_018644	TAA	2	6	270905	270910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707320
3514	NC_018644	GTT	2	6	270938	270943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707321
3515	NC_018644	CTG	2	6	270950	270955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707321
3516	NC_018644	CTG	2	6	270968	270973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707321
3517	NC_018644	CTT	2	6	270977	270982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707321
3518	NC_018644	GCA	2	6	271009	271014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707321
3519	NC_018644	TTC	2	6	271020	271025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707321
3520	NC_018644	CTC	2	6	271068	271073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707321
3521	NC_018644	TGC	2	6	271074	271079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707321
3522	NC_018644	TGC	2	6	271113	271118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707321
3523	NC_018644	CCT	2	6	271136	271141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707321
3524	NC_018644	CTT	3	9	271160	271168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707321
3525	NC_018644	CAT	2	6	271242	271247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707321
3526	NC_018644	TCT	2	6	271382	271387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707321
3527	NC_018644	GTG	2	6	271406	271411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707321
3528	NC_018644	CCT	2	6	271459	271464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707321
3529	NC_018644	TTG	2	6	271481	271486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707321
3530	NC_018644	TCA	2	6	271586	271591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3531	NC_018644	AAG	2	6	271617	271622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707322
3532	NC_018644	TTC	2	6	271664	271669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707322
3533	NC_018644	TAT	2	6	271728	271733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707322
3534	NC_018644	TGA	2	6	271741	271746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707322
3535	NC_018644	CAT	2	6	271779	271784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3536	NC_018644	GCC	2	6	271833	271838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406707322
3537	NC_018644	TCA	2	6	271895	271900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3538	NC_018644	CTA	2	6	271955	271960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3539	NC_018644	TGA	2	6	272155	272160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707322
3540	NC_018644	CAA	2	6	272168	272173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707322
3541	NC_018644	TTG	2	6	272184	272189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707322
3542	NC_018644	CAT	2	6	272193	272198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3543	NC_018644	TTC	2	6	272268	272273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707322
3544	NC_018644	AAT	2	6	272301	272306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707322
3545	NC_018644	ATT	2	6	272397	272402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707322
3546	NC_018644	CGC	2	6	272433	272438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406707322
3547	NC_018644	TCT	2	6	272442	272447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707322
3548	NC_018644	TTA	2	6	272476	272481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707322
3549	NC_018644	AAT	2	6	272495	272500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707322
3550	NC_018644	ACT	2	6	272589	272594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3551	NC_018644	TCA	2	6	272620	272625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707322
3552	NC_018644	TAA	2	6	272636	272641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707322
3553	NC_018644	TGA	2	6	272705	272710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707322
3554	NC_018644	TTA	2	6	272806	272811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707322
3555	NC_018644	TTA	2	6	272966	272971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707323
3556	NC_018644	GAT	2	6	273042	273047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707323
3557	NC_018644	ATC	2	6	273119	273124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707323
3558	NC_018644	TTC	2	6	273248	273253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707323
3559	NC_018644	TTA	2	6	273386	273391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707323
3560	NC_018644	TGT	2	6	273426	273431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707323
3561	NC_018644	ATA	2	6	273539	273544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707323
3562	NC_018644	AGG	3	9	273573	273581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707323
3563	NC_018644	TTC	2	6	273626	273631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707323
3564	NC_018644	CAG	2	6	273728	273733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707323
3565	NC_018644	CCA	2	6	273749	273754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707323
3566	NC_018644	CAA	2	6	273837	273842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707324
3567	NC_018644	ATA	2	6	273844	273849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707324
3568	NC_018644	TGA	2	6	273949	273954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707324
3569	NC_018644	AGA	2	6	274064	274069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707324
3570	NC_018644	TCA	2	6	274070	274075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707324
3571	NC_018644	CAA	2	6	274173	274178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707324
3572	NC_018644	ACC	2	6	274186	274191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707324
3573	NC_018644	TAT	2	6	274205	274210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707324
3574	NC_018644	AAT	2	6	274227	274232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707324
3575	NC_018644	TGA	2	6	274259	274264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707324
3576	NC_018644	ATC	2	6	274345	274350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707324
3577	NC_018644	TAA	2	6	274562	274567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707324
3578	NC_018644	GAG	2	6	274647	274652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707324
3579	NC_018644	GCA	2	6	274740	274745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707324
3580	NC_018644	GAA	2	6	274866	274871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707324
3581	NC_018644	GAT	2	6	274928	274933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707324
3582	NC_018644	GAC	2	6	274958	274963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707324
3583	NC_018644	TGA	2	6	275008	275013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707325
3584	NC_018644	GTG	2	6	275037	275042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707325
3585	NC_018644	AGA	2	6	275098	275103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707325
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3587	NC_018644	CAA	2	6	275138	275143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707325
3588	NC_018644	CAA	2	6	275179	275184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707325
3589	NC_018644	AAT	2	6	275207	275212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707325
3590	NC_018644	ACA	2	6	275225	275230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707325
3591	NC_018644	CAA	2	6	275258	275263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707325
3592	NC_018644	AGC	2	6	275287	275292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707325
3593	NC_018644	CTG	2	6	275388	275393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707325
3594	NC_018644	AAT	2	6	275465	275470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707325
3595	NC_018644	TCA	2	6	275508	275513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707325
3596	NC_018644	ATT	2	6	275591	275596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707325
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3598	NC_018644	TAA	2	6	275783	275788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707325
3599	NC_018644	AAC	2	6	275793	275798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707326
3600	NC_018644	ATT	2	6	275819	275824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707326
3601	NC_018644	TAT	2	6	275837	275842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707326
3602	NC_018644	ATC	2	6	275882	275887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707326
3603	NC_018644	CTA	2	6	275937	275942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707326
3604	NC_018644	AAT	2	6	275959	275964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707326
3605	NC_018644	TAG	2	6	275967	275972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707326
3606	NC_018644	TGG	2	6	275977	275982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707326
3607	NC_018644	ATC	2	6	276032	276037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707326
3608	NC_018644	CAA	2	6	276079	276084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707326
3609	NC_018644	CTT	2	6	276098	276103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707326
3610	NC_018644	CTC	2	6	276109	276114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707326
3611	NC_018644	ATT	2	6	276278	276283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707326
3612	NC_018644	GAA	2	6	276298	276303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707326
3613	NC_018644	AAT	2	6	276330	276335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707326
3614	NC_018644	TCT	2	6	276352	276357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707327
3615	NC_018644	CCT	2	6	276376	276381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707327
3616	NC_018644	CCT	2	6	276448	276453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707327
3617	NC_018644	AAG	2	6	276483	276488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707327
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3619	NC_018644	ATC	2	6	276532	276537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707327
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3977	NC_018644	CTG	2	6	303978	303983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707364
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