MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	AT	3	6	4442	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018644	AT	3	6	18561	18566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018644	AG	3	6	20849	20854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018644	TA	4	8	35573	35580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018644	AT	3	6	38136	38141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018644	AT	3	6	39612	39617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018644	AG	3	6	40667	40672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018644	AT	5	10	73274	73283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018644	TA	3	6	93627	93632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018644	TC	3	6	99929	99934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018644	AT	3	6	103465	103470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018644	TA	3	6	106169	106174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018644	TA	3	6	107047	107052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018644	TA	3	6	114486	114491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018644	TA	3	6	114503	114508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018644	AT	3	6	118082	118087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018644	TA	3	6	131432	131437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018644	GA	4	8	134601	134608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018644	AT	3	6	147177	147182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018644	AT	3	6	157576	157581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018644	TA	3	6	162297	162302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018644	TA	4	8	169175	169182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018644	TC	3	6	169934	169939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018644	TA	3	6	185025	185030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018644	TA	3	6	191693	191698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018644	TA	3	6	206922	206927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018644	TA	3	6	221931	221936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018644	TC	3	6	222019	222024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018644	AT	3	6	222026	222031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018644	TA	3	6	231541	231546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018644	TC	3	6	242123	242128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018644	TA	3	6	246654	246659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018644	TA	3	6	249541	249546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018644	TA	4	8	256102	256109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018644	TA	3	6	257132	257137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018644	TA	3	6	260212	260217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018644	AG	3	6	260274	260279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018644	AG	4	8	262894	262901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018644	TA	4	8	277523	277530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018644	TA	3	6	277556	277561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018644	GC	3	6	279378	279383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018644	GA	3	6	298475	298480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018644	AT	3	6	314813	314818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018644	TA	3	6	317399	317404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018644	AT	3	6	321605	321610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018644	AT	3	6	324278	324283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018644	TA	3	6	344266	344271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018644	AT	5	10	344290	344299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018644	TA	5	10	344301	344310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018644	AT	4	8	365423	365430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018644	TA	3	6	372573	372578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018644	TA	4	8	380340	380347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018644	TA	3	6	387127	387132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018644	TA	3	6	389655	389660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018644	AT	3	6	405465	405470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018644	CA	3	6	413283	413288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018644	GA	3	6	428717	428722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018644	TA	3	6	442133	442138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018644	TA	3	6	457674	457679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018644	TC	3	6	457942	457947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018644	TA	4	8	463518	463525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018644	TA	4	8	473925	473932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018644	AT	3	6	475044	475049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018644	TC	3	6	480002	480007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018644	AT	3	6	483067	483072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018644	TC	3	6	485458	485463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018644	AT	3	6	491892	491897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018644	AT	4	8	496878	496885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018644	TA	3	6	512150	512155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018644	TA	3	6	514723	514728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018644	TC	4	8	524131	524138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018644	AC	3	6	528410	528415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018644	TA	3	6	528468	528473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018644	TC	3	6	530939	530944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018644	CT	3	6	543904	543909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018644	AT	3	6	557459	557464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018644	TA	3	6	557466	557471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018644	GA	3	6	577048	577053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018644	CT	3	6	577125	577130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018644	AT	3	6	578001	578006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018644	TA	3	6	602185	602190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018644	TA	3	6	607259	607264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018644	AT	3	6	621042	621047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018644	AC	3	6	622182	622187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018644	TG	3	6	622203	622208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018644	AT	3	6	625840	625845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018644	AT	3	6	640752	640757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018644	TA	3	6	640788	640793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018644	AT	3	6	653636	653641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018644	GA	3	6	653644	653649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018644	AT	3	6	653655	653660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018644	AT	3	6	676528	676533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018644	TC	3	6	676621	676626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018644	TA	3	6	681616	681621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018644	GA	3	6	712419	712424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018644	AT	3	6	712435	712440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018644	AT	3	6	717938	717943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018644	TA	3	6	729266	729271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018644	TA	3	6	731819	731824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018644	TA	4	8	731839	731846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018644	GT	3	6	731970	731975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018644	AT	4	8	731994	732001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018644	GA	3	6	762508	762513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018644	TC	3	6	764373	764378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018644	TA	4	8	764531	764538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018644	AT	3	6	775230	775235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018644	AT	3	6	790592	790597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018644	AT	3	6	813553	813558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018644	AT	3	6	833889	833894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018644	AT	5	10	850498	850507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018644	TA	3	6	853231	853236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018644	CT	4	8	860491	860498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018644	AG	3	6	871465	871470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018644	TA	3	6	886272	886277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018644	AT	3	6	886617	886622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018644	TA	3	6	901357	901362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018644	AT	3	6	907191	907196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018644	TA	3	6	909080	909085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018644	AG	3	6	917672	917677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018644	GA	3	6	920002	920007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018644	AT	3	6	928757	928762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018644	AT	3	6	961846	961851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018644	TA	3	6	962159	962164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018644	GT	3	6	971811	971816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018644	AT	4	8	1000689	1000696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018644	AT	4	8	1015229	1015236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018644	TA	4	8	1015300	1015307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018644	AT	3	6	1016373	1016378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018644	AT	3	6	1033654	1033659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018644	AT	3	6	1042520	1042525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018644	TC	3	6	1047072	1047077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018644	TC	3	6	1047178	1047183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018644	AG	3	6	1052378	1052383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018644	AT	3	6	1052434	1052439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018644	AT	3	6	1059845	1059850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018644	AT	4	8	1059863	1059870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018644	TA	3	6	1061205	1061210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018644	TA	3	6	1081665	1081670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018644	TA	3	6	1085311	1085316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018644	CA	3	6	1085324	1085329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018644	TC	3	6	1085343	1085348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018644	GC	3	6	1092760	1092765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018644	AT	4	8	1098444	1098451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018644	CA	3	6	1173111	1173116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018644	AT	3	6	1193781	1193786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018644	TA	3	6	1200344	1200349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018644	AT	3	6	1201560	1201565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018644	TA	3	6	1203228	1203233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018644	TA	3	6	1211626	1211631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018644	AT	3	6	1221993	1221998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018644	TA	3	6	1226030	1226035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018644	TA	3	6	1238807	1238812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018644	CT	3	6	1255068	1255073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.