MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	TTTTAT	2	12	177074	177085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	CTTTTT	2	12	185404	185415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018643	ATAATT	2	12	195466	195477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018643	ATTTAA	2	12	209938	209949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	ATTTTT	2	12	336550	336561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	AATATT	2	12	387912	387923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	CAATAT	2	12	425657	425668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018643	AATAAA	2	12	435299	435310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	AAATTG	2	12	481307	481318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018643	TTTTCA	2	12	535245	535256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018643	TTAATT	2	12	618890	618901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	AAACTA	2	12	692254	692265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018643	TAATTT	2	12	704658	704669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	ATATTT	2	12	709235	709246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	AAGTTA	2	12	751910	751921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	TAAAAA	2	12	780955	780966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	AGAATT	2	12	947442	947453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018643	CTCTTC	2	12	1002542	1002553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018643	TAAAAA	2	12	1007263	1007274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	AATTAA	2	12	1012091	1012102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	GATATT	2	12	1050385	1050396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	TTTAAA	2	12	1094924	1094935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018643	AAATTT	2	12	1175712	1175723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	TTATTT	2	12	1188201	1188212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018643	TTAAAA	2	12	1229908	1229919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	ATTTTT	2	12	1248517	1248528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018643	TGATAT	2	12	1269460	1269471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	TTTTAA	2	12	1310752	1310763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.