MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	TTATT	2	10	55902	55911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	AACTT	2	10	111745	111754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018643	TAACT	2	10	137020	137029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018643	AATTA	2	10	154120	154129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	TATAT	2	10	177507	177516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	TAAAT	2	10	186672	186681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	TTGTT	2	10	220059	220068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018643	ATAAA	2	10	224363	224372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	TAATC	2	10	269091	269100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018643	TAGCA	2	10	317984	317993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018643	TAATT	2	10	335641	335650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	ATTTA	2	10	359604	359613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018643	TTTAA	2	10	362884	362893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	TAAAT	2	10	378127	378136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	GAAAG	2	10	380165	380174	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	AAGTT	2	10	407897	407906	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	CTATC	2	10	409188	409197	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018643	TACTT	2	10	411100	411109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018643	TTATT	2	10	417837	417846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	ATTAT	2	10	442326	442335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	TAATT	2	10	445954	445963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	TTAAT	2	10	454879	454888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018643	AAATT	2	10	460634	460643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	AAATA	2	10	481384	481393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018643	AATAA	2	10	553392	553401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	AATTA	2	10	554088	554097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018643	AAATT	2	10	562368	562377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	CTTGA	2	10	569520	569529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018643	TTATA	2	10	569553	569562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018643	TAATA	2	10	572790	572799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018643	TTTTA	2	10	578324	578333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018643	ATTTA	2	10	587177	587186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018643	AATTA	2	10	617900	617909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018643	AAAAT	2	10	663811	663820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018643	TCTTA	2	10	706758	706767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018643	TTATA	2	10	732253	732262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018643	AATCC	2	10	736909	736918	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018643	TTTAT	2	10	737021	737030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018643	AAAAT	2	10	753507	753516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018643	TAAAA	2	10	771717	771726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018643	ATTAA	2	10	785365	785374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018643	AACTA	2	10	788734	788743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018643	ATTAA	2	10	792175	792184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018643	CAAAA	2	10	795007	795016	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018643	TAAAA	2	10	798152	798161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018643	TTTTA	2	10	800003	800012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018643	CTAGA	2	10	804467	804476	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018643	ATTAT	2	10	898171	898180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018643	TAATT	2	10	914022	914031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018643	AAAGA	2	10	925953	925962	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018643	TACAA	2	10	939081	939090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018643	ATTTA	2	10	955675	955684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018643	ATTAT	2	10	955689	955698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018643	TGAAA	2	10	956032	956041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018643	ATTAA	2	10	972936	972945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018643	GAAAA	2	10	998708	998717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018643	AAAAT	2	10	1007243	1007252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018643	ATTTT	2	10	1007280	1007289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018643	AATAA	2	10	1007298	1007307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018643	TAAAA	2	10	1011975	1011984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018643	ATTAT	2	10	1014495	1014504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018643	TAAAA	2	10	1014543	1014552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018643	AAATA	2	10	1017644	1017653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018643	GAATT	2	10	1038900	1038909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018643	AAATC	2	10	1047282	1047291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018643	CACGA	2	10	1051150	1051159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018643	CCGAA	2	10	1051197	1051206	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018643	CTTCT	2	10	1052272	1052281	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_018643	TTTTA	2	10	1074601	1074610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018643	GCTCT	2	10	1127261	1127270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018643	ATTTT	2	10	1141959	1141968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018643	ATTAT	2	10	1156103	1156112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018643	ATTGT	2	10	1175744	1175753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018643	TAATA	2	10	1190140	1190149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018643	AATAT	2	10	1200379	1200388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018643	ATATT	2	10	1201259	1201268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018643	TATAT	2	10	1209455	1209464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018643	TCGTT	2	10	1216401	1216410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018643	ATAAG	2	10	1259440	1259449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018643	AAATT	2	10	1259472	1259481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018643	ATTTA	2	10	1262171	1262180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018643	AAATT	2	10	1276026	1276035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018643	TAAAA	2	10	1303068	1303077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018643	TAAAA	2	10	1311255	1311264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.