MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	TTAA	2	8	26808	26815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	TAAA	2	8	26852	26859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018643	TAAA	2	8	40794	40801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018643	TAAA	2	8	47922	47929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	ATTA	2	8	47969	47976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	TAAG	2	8	76099	76106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	ATTT	2	8	80661	80668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018643	TAAA	2	8	93889	93896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	AATT	2	8	135788	135795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018643	TATT	2	8	137037	137044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018643	ATTT	2	8	147083	147090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	TAAA	2	8	151411	151418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018643	AAAT	2	8	154130	154137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	ATTA	2	8	160788	160795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	TAAT	2	8	171337	171344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	ATTT	2	8	173209	173216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	TTTA	2	8	174167	174174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018643	TATT	2	8	174798	174805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018643	TTTA	2	8	177462	177469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	TTTA	2	8	185480	185487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	AAAT	2	8	186602	186609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	TATT	2	8	194471	194478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018643	TTTA	2	8	199934	199941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	ATTT	2	8	210002	210009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018643	TAAA	3	12	210063	210074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	AAGA	2	8	213515	213522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018643	TATT	2	8	220082	220089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	AATT	2	8	220426	220433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018643	ATTT	2	8	236692	236699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018643	AGAT	2	8	260617	260624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018643	AATT	2	8	269075	269082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018643	TTTA	2	8	297093	297100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018643	ATAG	2	8	319704	319711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018643	GTAG	2	8	326091	326098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018643	CAAT	2	8	340194	340201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018643	TTAA	2	8	341616	341623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018643	TGAA	2	8	347084	347091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018643	TAAA	2	8	355563	355570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018643	TAAT	2	8	356749	356756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018643	AATT	2	8	361925	361932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018643	AATT	2	8	367892	367899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018643	ATTG	2	8	375443	375450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018643	GTTT	2	8	379187	379194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018643	AATT	2	8	379248	379255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018643	TAAT	2	8	379283	379290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018643	GTTC	2	8	380253	380260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018643	ATTT	2	8	380288	380295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018643	TTAA	2	8	388828	388835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018643	TTAC	2	8	404153	404160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018643	AAAT	2	8	409494	409501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018643	ATTA	2	8	411045	411052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018643	ATTA	2	8	414105	414112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018643	TAAA	2	8	414125	414132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018643	TTAC	2	8	414152	414159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018643	CTTT	2	8	417797	417804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018643	GAGG	2	8	425630	425637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018643	TATT	2	8	431095	431102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018643	TAAA	2	8	431169	431176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018643	TATT	2	8	431211	431218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018643	TATT	2	8	435284	435291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018643	ATTT	2	8	436195	436202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018643	GTTA	2	8	437945	437952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018643	TAAT	2	8	437956	437963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018643	TAAA	2	8	444007	444014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018643	TCTT	2	8	445871	445878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018643	ATTT	2	8	448885	448892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018643	CTTA	2	8	451272	451279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018643	AAAT	2	8	454889	454896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018643	TTGT	2	8	458734	458741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018643	AACA	2	8	458781	458788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018643	ATTT	2	8	470945	470952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018643	GAAC	2	8	475458	475465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018643	ATAA	2	8	475476	475483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018643	AATT	2	8	548649	548656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018643	AAAT	3	12	548842	548853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018643	TAAT	2	8	549921	549928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018643	ACTT	2	8	553942	553949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018643	CCTT	2	8	561279	561286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018643	ATTC	2	8	567941	567948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018643	TTTA	2	8	591302	591309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018643	AAAT	2	8	592468	592475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018643	TAAT	2	8	593417	593424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018643	TTAT	2	8	593496	593503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018643	ATTA	2	8	617617	617624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018643	TTAA	2	8	617669	617676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018643	AAAC	2	8	618796	618803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018643	AACA	2	8	618846	618853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018643	TAAA	2	8	618859	618866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018643	TAAA	2	8	619078	619085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018643	AAAG	2	8	619948	619955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018643	ATTA	2	8	623358	623365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018643	GGTA	2	8	624422	624429	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018643	AATG	2	8	629711	629718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018643	ATTA	2	8	664324	664331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018643	ATTT	2	8	692141	692148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018643	CCAA	2	8	692210	692217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018643	TAAA	2	8	700569	700576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018643	ATCA	2	8	703189	703196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018643	GCCC	2	8	704844	704851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_018643	ATTA	2	8	727420	727427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018643	ATTT	2	8	731826	731833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018643	TAAA	2	8	731900	731907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018643	TAAT	2	8	732076	732083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018643	ATTT	2	8	732115	732122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018643	CTAT	2	8	736747	736754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018643	TAAT	2	8	736860	736867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018643	AAAT	2	8	736963	736970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018643	TAAT	2	8	752360	752367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018643	ATTT	2	8	752417	752424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018643	CAAA	2	8	780990	780997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018643	TCAA	2	8	781019	781026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018643	TCCC	2	8	788650	788657	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_018643	AAAG	2	8	788680	788687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018643	TAAA	2	8	792161	792168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018643	TTTA	2	8	798269	798276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018643	TTAA	2	8	799995	800002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018643	TAAA	2	8	800016	800023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018643	AATA	2	8	800191	800198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018643	ATTT	2	8	805320	805327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018643	TTTC	2	8	822726	822733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018643	ATTT	2	8	827552	827559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018643	ATTA	2	8	838128	838135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018643	TAAA	2	8	861125	861132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018643	ATTA	2	8	863165	863172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018643	AAAT	2	8	868900	868907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018643	ATTT	2	8	905923	905930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018643	AATT	2	8	919143	919150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018643	TTAA	4	16	925884	925899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018643	CAAT	2	8	939151	939158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018643	TTTA	2	8	939997	940004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018643	CTAT	2	8	951954	951961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018643	TTCG	2	8	955835	955842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018643	TTAA	2	8	955903	955910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018643	TTAA	2	8	955915	955922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018643	TGAG	2	8	956012	956019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018643	TAAA	2	8	983321	983328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018643	AATT	2	8	983890	983897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018643	ATAC	2	8	998688	998695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018643	AAAC	2	8	998758	998765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018643	AATG	2	8	1007231	1007238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018643	TAAA	2	8	1007331	1007338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018643	ATTA	2	8	1008143	1008150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018643	AAAT	2	8	1010661	1010668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018643	ATTT	2	8	1012056	1012063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018643	TAAT	2	8	1014522	1014529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018643	ATTT	3	12	1014590	1014601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018643	AATA	2	8	1017438	1017445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018643	AAGT	2	8	1017465	1017472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018643	ACTA	2	8	1017636	1017643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.