MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 4567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018643	ATTT	2	8	1323766	1323773	25 %	75 %	0 %	0 %	406707009
4502	NC_018643	TATT	2	8	1323792	1323799	25 %	75 %	0 %	0 %	406707009
4503	NC_018643	AAGG	2	8	1323840	1323847	50 %	0 %	50 %	0 %	406707009
4504	NC_018643	AAAT	2	8	1324344	1324351	75 %	25 %	0 %	0 %	406707009
4505	NC_018643	AATT	2	8	1324442	1324449	50 %	50 %	0 %	0 %	406707009
4506	NC_018643	TAAT	2	8	1324533	1324540	50 %	50 %	0 %	0 %	406707010
4507	NC_018643	GCTA	2	8	1324711	1324718	25 %	25 %	25 %	25 %	406707010
4508	NC_018643	AATT	2	8	1324894	1324901	50 %	50 %	0 %	0 %	406707010
4509	NC_018643	AATA	2	8	1324918	1324925	75 %	25 %	0 %	0 %	406707010
4510	NC_018643	TGAT	2	8	1325033	1325040	25 %	50 %	25 %	0 %	406707010
4511	NC_018643	CTTT	2	8	1325336	1325343	0 %	75 %	0 %	25 %	406707010
4512	NC_018643	CTAT	2	8	1326639	1326646	25 %	50 %	0 %	25 %	406707011
4513	NC_018643	GACA	2	8	1327254	1327261	50 %	0 %	25 %	25 %	406707012
4514	NC_018643	AACT	2	8	1327628	1327635	50 %	25 %	0 %	25 %	406707012
4515	NC_018643	TTTA	2	8	1327679	1327686	25 %	75 %	0 %	0 %	406707012
4516	NC_018643	CTAT	2	8	1327898	1327905	25 %	50 %	0 %	25 %	406707012
4517	NC_018643	ATTT	2	8	1328947	1328954	25 %	75 %	0 %	0 %	406707013
4518	NC_018643	GATG	2	8	1329779	1329786	25 %	25 %	50 %	0 %	406707014
4519	NC_018643	GATT	2	8	1329877	1329884	25 %	50 %	25 %	0 %	406707014
4520	NC_018643	ATTT	2	8	1329895	1329902	25 %	75 %	0 %	0 %	406707014
4521	NC_018643	GAAA	2	8	1330294	1330301	75 %	0 %	25 %	0 %	406707015
4522	NC_018643	CTAG	2	8	1330504	1330511	25 %	25 %	25 %	25 %	406707015
4523	NC_018643	ATTT	2	8	1330607	1330614	25 %	75 %	0 %	0 %	406707015
4524	NC_018643	AAGT	2	8	1330832	1330839	50 %	25 %	25 %	0 %	406707015
4525	NC_018643	AAAT	2	8	1331072	1331079	75 %	25 %	0 %	0 %	406707015
4526	NC_018643	TTAT	2	8	1331418	1331425	25 %	75 %	0 %	0 %	406707016
4527	NC_018643	GATG	2	8	1331635	1331642	25 %	25 %	50 %	0 %	406707016
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4530	NC_018643	TAAT	2	8	1332898	1332905	50 %	50 %	0 %	0 %	406707017
4531	NC_018643	GATC	2	8	1333369	1333376	25 %	25 %	25 %	25 %	406707018
4532	NC_018643	GATG	2	8	1333545	1333552	25 %	25 %	50 %	0 %	406707018
4533	NC_018643	TGGT	2	8	1333651	1333658	0 %	50 %	50 %	0 %	406707018
4534	NC_018643	AAGA	2	8	1334144	1334151	75 %	0 %	25 %	0 %	406707018
4535	NC_018643	TACT	2	8	1334210	1334217	25 %	50 %	0 %	25 %	406707018
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4539	NC_018643	AGAA	2	8	1334885	1334892	75 %	0 %	25 %	0 %	406707019
4540	NC_018643	ATTT	2	8	1335116	1335123	25 %	75 %	0 %	0 %	406707020
4541	NC_018643	TCTT	2	8	1335679	1335686	0 %	75 %	0 %	25 %	406707020
4542	NC_018643	ATTA	2	8	1335699	1335706	50 %	50 %	0 %	0 %	406707020
4543	NC_018643	TTCT	2	8	1335785	1335792	0 %	75 %	0 %	25 %	406707020
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4545	NC_018643	ATTT	2	8	1337102	1337109	25 %	75 %	0 %	0 %	406707021
4546	NC_018643	ATTG	2	8	1337132	1337139	25 %	50 %	25 %	0 %	406707021
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4549	NC_018643	TTTA	2	8	1338464	1338471	25 %	75 %	0 %	0 %	406707023
4550	NC_018643	ATTT	2	8	1338480	1338487	25 %	75 %	0 %	0 %	406707023
4551	NC_018643	ACCT	2	8	1338492	1338499	25 %	25 %	0 %	50 %	406707023
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4554	NC_018643	ATTG	2	8	1339145	1339152	25 %	50 %	25 %	0 %	406707024
4555	NC_018643	AAAG	2	8	1339172	1339179	75 %	0 %	25 %	0 %	406707024
4556	NC_018643	AGAT	2	8	1339339	1339346	50 %	25 %	25 %	0 %	406707024
4557	NC_018643	ATTT	2	8	1339561	1339568	25 %	75 %	0 %	0 %	406707024
4558	NC_018643	ATCT	2	8	1340283	1340290	25 %	50 %	0 %	25 %	406707025
4559	NC_018643	ATTT	2	8	1340492	1340499	25 %	75 %	0 %	0 %	406707026
4560	NC_018643	ATAG	2	8	1340556	1340563	50 %	25 %	25 %	0 %	406707026
4561	NC_018643	ATTT	2	8	1340609	1340616	25 %	75 %	0 %	0 %	406707026
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4564	NC_018643	AAAT	2	8	1341482	1341489	75 %	25 %	0 %	0 %	406707027
4565	NC_018643	AGAT	2	8	1342297	1342304	50 %	25 %	25 %	0 %	406707027
4566	NC_018643	CAAC	2	8	1343035	1343042	50 %	0 %	0 %	50 %	406707028
4567	NC_018643	AAAG	2	8	1343124	1343131	75 %	0 %	25 %	0 %	406707028

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.