MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	AT	3	6	24136	24141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	TA	3	6	55950	55955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018643	TA	3	6	80673	80678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018643	AT	3	6	102247	102252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	TA	3	6	110676	110681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	TA	3	6	112503	112508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	AT	3	6	135830	135835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018643	TA	3	6	137097	137102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	AT	3	6	142876	142881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018643	TA	3	6	162949	162954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018643	TA	3	6	171366	171371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	AT	4	8	175405	175412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018643	TA	3	6	176218	176223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	AT	3	6	177532	177537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	TA	3	6	186557	186562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	TA	3	6	186634	186639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	TA	3	6	199991	199996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018643	AT	4	8	205027	205034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018643	TA	3	6	210054	210059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	TA	4	8	210941	210948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	TA	3	6	228300	228305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	AT	3	6	231346	231351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018643	GA	3	6	240530	240535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	TC	3	6	240576	240581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018643	AT	4	8	261581	261588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	TG	3	6	269109	269114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018643	AT	3	6	289234	289239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	TA	3	6	297129	297134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018643	TA	4	8	311791	311798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018643	TA	4	8	325452	325459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018643	AT	3	6	358407	358412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018643	AG	3	6	368049	368054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018643	TG	3	6	391398	391403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018643	AT	3	6	393997	394002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018643	AC	3	6	401591	401596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018643	TA	3	6	404202	404207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018643	TA	3	6	411051	411056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018643	AT	3	6	436300	436305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018643	CT	3	6	439329	439334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018643	TC	4	8	439376	439383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018643	TA	3	6	440873	440878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018643	TA	3	6	458760	458765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018643	AG	3	6	458815	458820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018643	TA	3	6	460773	460778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018643	AT	3	6	464612	464617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018643	TA	4	8	475574	475581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018643	TA	3	6	484899	484904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018643	AT	3	6	484956	484961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018643	AT	3	6	487173	487178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018643	AG	3	6	487208	487213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018643	AT	3	6	491272	491277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018643	CA	3	6	515022	515027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018643	AT	3	6	528908	528913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018643	TA	3	6	534147	534152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018643	AT	3	6	548637	548642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018643	GC	3	6	548732	548737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018643	TA	3	6	548754	548759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018643	TA	3	6	553449	553454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018643	TC	3	6	554168	554173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018643	AT	3	6	592460	592465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018643	TA	3	6	592479	592484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018643	AT	3	6	593430	593435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018643	GA	3	6	596481	596486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018643	TC	3	6	596559	596564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018643	AT	3	6	596621	596626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018643	TA	3	6	607149	607154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018643	AT	3	6	617634	617639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018643	TA	3	6	618833	618838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018643	TA	3	6	618956	618961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018643	TA	3	6	619068	619073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018643	GA	4	8	650319	650326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018643	TC	3	6	650399	650404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018643	TA	3	6	678501	678506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018643	TA	3	6	704932	704937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018643	TA	7	14	736728	736741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018643	AT	3	6	742112	742117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018643	AG	3	6	751987	751992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018643	TA	4	8	752484	752491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018643	TA	4	8	752499	752506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018643	TA	3	6	771743	771748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018643	TA	3	6	780904	780909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018643	AG	3	6	780998	781003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018643	AT	3	6	783313	783318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018643	TA	4	8	785350	785357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018643	TA	3	6	798260	798265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018643	TA	3	6	804448	804453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018643	AT	3	6	812736	812741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018643	TA	3	6	820472	820477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018643	AT	4	8	845330	845337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018643	GA	4	8	847944	847951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018643	AT	3	6	856394	856399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018643	GA	3	6	862128	862133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018643	AT	3	6	863181	863186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018643	TA	4	8	865970	865977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018643	AT	3	6	865985	865990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018643	GA	3	6	872662	872667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018643	AT	3	6	899419	899424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018643	TA	3	6	905915	905920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018643	AT	3	6	907728	907733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018643	AT	3	6	914052	914057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018643	TA	3	6	914066	914071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018643	AT	3	6	914103	914108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018643	TA	3	6	926672	926677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018643	AT	3	6	953792	953797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018643	AG	3	6	956129	956134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018643	GC	3	6	972859	972864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018643	TA	4	8	1002754	1002761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018643	AT	3	6	1008169	1008174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018643	TA	3	6	1010597	1010602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018643	AT	3	6	1014750	1014755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018643	AT	3	6	1017679	1017684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018643	AT	3	6	1030713	1030718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018643	AT	3	6	1033721	1033726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018643	TA	5	10	1033729	1033738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018643	AT	3	6	1038893	1038898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018643	AT	3	6	1043001	1043006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018643	TC	3	6	1048756	1048761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018643	GT	3	6	1050832	1050837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018643	GT	3	6	1051000	1051005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018643	GT	3	6	1051354	1051359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018643	AC	3	6	1051404	1051409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018643	GT	3	6	1052234	1052239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018643	TA	3	6	1059651	1059656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018643	GA	3	6	1094864	1094869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018643	AT	3	6	1095756	1095761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018643	TA	3	6	1112434	1112439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018643	CT	3	6	1116588	1116593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018643	AT	3	6	1117386	1117391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018643	CT	3	6	1117406	1117411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018643	GA	4	8	1127224	1127231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018643	GA	3	6	1152592	1152597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018643	TC	3	6	1152670	1152675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018643	AT	3	6	1168892	1168897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018643	TA	3	6	1181750	1181755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018643	AT	3	6	1183336	1183341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018643	AG	3	6	1190057	1190062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018643	AG	3	6	1212023	1212028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018643	AT	3	6	1213494	1213499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018643	AT	3	6	1213564	1213569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018643	AT	3	6	1220900	1220905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018643	AT	3	6	1238083	1238088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018643	GA	3	6	1238775	1238780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018643	AT	3	6	1241893	1241898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018643	TA	4	8	1261957	1261964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018643	AT	3	6	1269484	1269489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018643	AT	3	6	1277820	1277825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018643	TC	4	8	1284607	1284614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018643	AT	3	6	1287900	1287905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018643	AT	3	6	1300466	1300471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018643	TA	4	8	1309033	1309040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018643	AG	3	6	1311228	1311233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018643	TA	3	6	1315395	1315400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.