MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes L312

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018642	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018642	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018642	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018642	CAGGTT	2	12	141653	141664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018642	ACACTT	2	12	169920	169931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018642	AATAAA	2	12	196238	196249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018642	GAAAAC	2	12	223157	223168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018642	ATTCAA	2	12	234074	234085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018642	AAGGAA	2	12	235645	235656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018642	TAGGCG	2	12	237298	237309	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018642	ATTCAA	2	12	240093	240104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018642	AAGGAA	2	12	241664	241675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018642	TAGGCG	2	12	243317	243328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018642	AGTCAA	2	12	245133	245144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018642	TTATAT	2	12	259918	259929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018642	AACTTT	2	12	295635	295646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018642	TAAAAA	2	12	301004	301015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018642	AATACA	2	12	305453	305464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018642	CATAGA	2	12	347681	347692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018642	AAATTT	2	12	370748	370759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018642	TTGTTT	2	12	413319	413330	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018642	TAATTA	2	12	459010	459021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018642	AGTAAA	2	12	467606	467617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018642	TTAAAT	2	12	506437	506448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018642	CTATAA	2	12	508205	508216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018642	AAATGT	2	12	566232	566243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018642	AGATTT	2	12	574363	574374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018642	AAATAA	2	12	614656	614667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018642	ATCATT	2	12	643012	643023	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018642	TGTAAA	2	12	664947	664958	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018642	ATCATT	2	12	679262	679273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018642	GAATAA	2	12	711441	711452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018642	GTTTTA	2	12	717133	717144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018642	TATAGG	2	12	734350	734361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018642	AATTAG	2	12	761797	761808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018642	TGTTGA	2	12	772854	772865	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018642	TTACTT	2	12	854220	854231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018642	AAATAG	2	12	890637	890648	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018642	GTAATC	2	12	897440	897451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018642	TTACAA	2	12	897458	897469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018642	ATGAAA	2	12	906062	906073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018642	TTGACT	2	12	1030000	1030011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018642	AGGAAG	2	12	1040187	1040198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018642	AACAAT	2	12	1079190	1079201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018642	CTTTTT	2	12	1095491	1095502	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018642	GTGCAT	2	12	1127187	1127198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018642	TTTACT	2	12	1134722	1134733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018642	TTTAGT	2	12	1144122	1144133	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018642	CTTTTT	2	12	1184295	1184306	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018642	TAGATA	2	12	1203823	1203834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018642	CTTTTT	2	12	1217098	1217109	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018642	GAAAAA	2	12	1247063	1247074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018642	TAAGTA	2	12	1262999	1263010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018642	TATTAA	2	12	1279192	1279203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018642	GTACAA	2	12	1392477	1392488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018642	ATTAAG	2	12	1425732	1425743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018642	TAATCA	2	12	1425840	1425851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018642	TACCAA	2	12	1443773	1443784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018642	TTTCAT	2	12	1469934	1469945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018642	CTCTTC	2	12	1572618	1572629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018642	TAAAAA	2	12	1588079	1588090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018642	TCATTA	2	12	1608941	1608952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018642	GGTTGT	2	12	1623265	1623276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018642	GGTTGT	2	12	1624737	1624748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018642	GAATAA	2	12	1626291	1626302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018642	GTAAAC	2	12	1627442	1627453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018642	ACAAAA	2	12	1636066	1636077	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018642	AAAATA	2	12	1640386	1640397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018642	TAAAAA	2	12	1641297	1641308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018642	CTTATT	2	12	1727311	1727322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018642	CGCCTA	2	12	1730816	1730827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018642	TTTCCT	2	12	1732468	1732479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018642	TTGAAT	2	12	1734040	1734051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018642	CGCCTA	2	12	1836774	1836785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018642	TTTCCT	2	12	1838426	1838437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018642	TTGAAT	2	12	1839994	1840005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018642	AAATGG	2	12	1840978	1840989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018642	GTTTTG	2	12	1847945	1847956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018642	CTCTAT	2	12	1950522	1950533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018642	TCATTT	2	12	1951720	1951731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018642	GTTTTC	2	12	1978889	1978900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018642	CAAAAA	2	12	1996613	1996624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018642	GAAAAA	2	12	2000473	2000484	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018642	TTCACT	2	12	2154957	2154968	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018642	ATTCAA	2	12	2165687	2165698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018642	TTTAAT	2	12	2201498	2201509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018642	TATATT	2	12	2228584	2228595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018642	AATTTT	2	12	2286285	2286296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018642	AAATTG	2	12	2292461	2292472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018642	CTCTGT	2	12	2299305	2299316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018642	TTATTT	2	12	2354324	2354335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018642	TAATAC	2	12	2383068	2383079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018642	CGCCTA	2	12	2410039	2410050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018642	TTTCCT	2	12	2411942	2411953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018642	TTGAAT	2	12	2413514	2413525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018642	CTTTTT	2	12	2565689	2565700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018642	ATCCCA	2	12	2585602	2585613	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018642	TTTTTA	2	12	2597429	2597440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018642	CGCCTA	2	12	2640922	2640933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018642	TTTCCT	2	12	2642825	2642836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018642	TTGAAT	2	12	2644397	2644408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018642	CCTCTT	2	12	2686869	2686880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018642	AGCTAG	2	12	2701865	2701876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018642	TAAATC	2	12	2713906	2713917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018642	TATCAA	2	12	2855559	2855570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018642	AAATGA	2	12	2855573	2855584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018642	TAAAAA	2	12	2855643	2855654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018642	AAGTAT	2	12	2856510	2856521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.