MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes L312

Total Repeats: 2116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018642	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018642	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	406702777
3	NC_018642	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	406702777
4	NC_018642	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	406702778
5	NC_018642	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	406702781
6	NC_018642	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	406702783
7	NC_018642	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	406702784
8	NC_018642	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	406702786
9	NC_018642	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018642	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	406702788
11	NC_018642	ATTGT	2	10	17720	17729	20 %	60 %	20 %	0 %	406702790
12	NC_018642	ATGAA	2	10	19330	19339	60 %	20 %	20 %	0 %	406702791
13	NC_018642	GAATG	2	10	21072	21081	40 %	20 %	40 %	0 %	406702792
14	NC_018642	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	406702795
15	NC_018642	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	406702796
16	NC_018642	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	406702796
17	NC_018642	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	406702797
18	NC_018642	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	406702797
19	NC_018642	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018642	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	406702804
21	NC_018642	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	406702806
22	NC_018642	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	406702807
23	NC_018642	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	406702807
24	NC_018642	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	406702808
25	NC_018642	CCATA	2	10	35591	35600	40 %	20 %	0 %	40 %	406702809
26	NC_018642	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018642	AGATA	2	10	36692	36701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018642	AATTG	2	10	37003	37012	40 %	40 %	20 %	0 %	406702810
29	NC_018642	TAAAA	2	10	37255	37264	80 %	20 %	0 %	0 %	406702810
30	NC_018642	AAAGG	2	10	37663	37672	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018642	CTATT	2	10	38159	38168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018642	GAAAA	2	10	39245	39254	80 %	0 %	20 %	0 %	406702813
33	NC_018642	TGAAA	2	10	40400	40409	60 %	20 %	20 %	0 %	406702814
34	NC_018642	GAATG	2	10	42271	42280	40 %	20 %	40 %	0 %	406702816
35	NC_018642	AAATT	2	10	42398	42407	60 %	40 %	0 %	0 %	406702816
36	NC_018642	ATTTT	2	10	43004	43013	20 %	80 %	0 %	0 %	406702816
37	NC_018642	AAAAC	2	10	46631	46640	80 %	0 %	0 %	20 %	406702818
38	NC_018642	TTATT	2	10	48117	48126	20 %	80 %	0 %	0 %	406702820
39	NC_018642	GAAAA	2	10	49330	49339	80 %	0 %	20 %	0 %	406702820
40	NC_018642	ATAAA	2	10	50155	50164	80 %	20 %	0 %	0 %	406702821
41	NC_018642	ATTTT	2	10	51959	51968	20 %	80 %	0 %	0 %	406702823
42	NC_018642	GACAT	2	10	53172	53181	40 %	20 %	20 %	20 %	406702824
43	NC_018642	GACTT	2	10	53456	53465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018642	ATTTT	2	10	53542	53551	20 %	80 %	0 %	0 %	406702825
45	NC_018642	AAATG	2	10	54671	54680	60 %	20 %	20 %	0 %	406702826
46	NC_018642	ATGGT	2	10	55708	55717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018642	GTAGA	2	10	55757	55766	40 %	20 %	40 %	0 %	406702827
48	NC_018642	TTACT	2	10	56739	56748	20 %	60 %	0 %	20 %	406702829
49	NC_018642	CAAAA	2	10	57246	57255	80 %	0 %	0 %	20 %	406702830
50	NC_018642	GAAAT	2	10	57396	57405	60 %	20 %	20 %	0 %	406702830
51	NC_018642	CTTAG	2	10	57495	57504	20 %	40 %	20 %	20 %	406702830
52	NC_018642	AAATA	2	10	57764	57773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018642	TAAAA	2	10	58746	58755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018642	TGCTA	2	10	58920	58929	20 %	40 %	20 %	20 %	406702833
55	NC_018642	TTTTA	2	10	59088	59097	20 %	80 %	0 %	0 %	406702833
56	NC_018642	AGTTA	2	10	60404	60413	40 %	40 %	20 %	0 %	406702834
57	NC_018642	TTATG	2	10	60953	60962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018642	AGTCT	2	10	61869	61878	20 %	40 %	20 %	20 %	406702835
59	NC_018642	TTTTA	2	10	64865	64874	20 %	80 %	0 %	0 %	406702838
60	NC_018642	AAACG	2	10	69234	69243	60 %	0 %	20 %	20 %	406702842
61	NC_018642	CAAAA	2	10	70734	70743	80 %	0 %	0 %	20 %	406702843
62	NC_018642	AACAA	2	10	72153	72162	80 %	0 %	0 %	20 %	406702845
63	NC_018642	ATGGA	2	10	78853	78862	40 %	20 %	40 %	0 %	406702851
64	NC_018642	AAAAT	2	10	78881	78890	80 %	20 %	0 %	0 %	406702852
65	NC_018642	ATATC	2	10	79220	79229	40 %	40 %	0 %	20 %	406702852
66	NC_018642	GTATA	2	10	80268	80277	40 %	40 %	20 %	0 %	406702853
67	NC_018642	TATTT	2	10	80408	80417	20 %	80 %	0 %	0 %	406702854
68	NC_018642	ATATA	2	10	80663	80672	60 %	40 %	0 %	0 %	406702854
69	NC_018642	TTTTA	2	10	82180	82189	20 %	80 %	0 %	0 %	406702856
70	NC_018642	TTTTA	2	10	82285	82294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018642	GCTTG	2	10	84255	84264	0 %	40 %	40 %	20 %	406702858
72	NC_018642	GCGCT	2	10	86309	86318	0 %	20 %	40 %	40 %	406702860
73	NC_018642	AACAA	2	10	86758	86767	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018642	TTTGT	2	10	88002	88011	0 %	80 %	20 %	0 %	406702862
75	NC_018642	TTTCT	2	10	88740	88749	0 %	80 %	0 %	20 %	406702862
76	NC_018642	ATTTT	2	10	88989	88998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018642	CTAAA	2	10	91100	91109	60 %	20 %	0 %	20 %	406702865
78	NC_018642	GAAAA	2	10	92443	92452	80 %	0 %	20 %	0 %	406702865
79	NC_018642	TGAAA	2	10	92685	92694	60 %	20 %	20 %	0 %	406702865
80	NC_018642	AAATT	2	10	93029	93038	60 %	40 %	0 %	0 %	406702865
81	NC_018642	AGCGG	2	10	93613	93622	20 %	0 %	60 %	20 %	406702865
82	NC_018642	GGAAA	2	10	94792	94801	60 %	0 %	40 %	0 %	406702865
83	NC_018642	CGAAA	2	10	96108	96117	60 %	0 %	20 %	20 %	406702866
84	NC_018642	AAAAG	2	10	96421	96430	80 %	0 %	20 %	0 %	406702866
85	NC_018642	TGCAT	2	10	100081	100090	20 %	40 %	20 %	20 %	406702869
86	NC_018642	TTACT	2	10	100327	100336	20 %	60 %	0 %	20 %	406702869
87	NC_018642	GTTTT	2	10	101925	101934	0 %	80 %	20 %	0 %	406702871
88	NC_018642	TGGCT	2	10	102076	102085	0 %	40 %	40 %	20 %	406702871
89	NC_018642	ATATC	2	10	110937	110946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018642	AAAAG	2	10	113625	113634	80 %	0 %	20 %	0 %	406702885
91	NC_018642	ACGGT	2	10	115169	115178	20 %	20 %	40 %	20 %	406702886
92	NC_018642	GAAAT	2	10	116408	116417	60 %	20 %	20 %	0 %	406702887
93	NC_018642	GAATT	2	10	117049	117058	40 %	40 %	20 %	0 %	406702887
94	NC_018642	CTTTA	2	10	121253	121262	20 %	60 %	0 %	20 %	406702890
95	NC_018642	AGAGA	2	10	121763	121772	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018642	CTCGA	2	10	122604	122613	20 %	20 %	20 %	40 %	406702892
97	NC_018642	TTCCA	2	10	122938	122947	20 %	40 %	0 %	40 %	406702892
98	NC_018642	TTACT	2	10	123202	123211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018642	TTTTA	2	10	124136	124145	20 %	80 %	0 %	0 %	406702894
100	NC_018642	AAAAG	2	10	124405	124414	80 %	0 %	20 %	0 %	406702895
101	NC_018642	AAAGT	2	10	125443	125452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018642	TTAGT	2	10	126565	126574	20 %	60 %	20 %	0 %	406702899
103	NC_018642	TGAAC	2	10	127247	127256	40 %	20 %	20 %	20 %	406702901
104	NC_018642	AGATG	2	10	127289	127298	40 %	20 %	40 %	0 %	406702901
105	NC_018642	TTTAT	2	10	129565	129574	20 %	80 %	0 %	0 %	406702902
106	NC_018642	AAGTG	2	10	131587	131596	40 %	20 %	40 %	0 %	406702905
107	NC_018642	AGTCT	2	10	131867	131876	20 %	40 %	20 %	20 %	406702905
108	NC_018642	TGTAA	2	10	132947	132956	40 %	40 %	20 %	0 %	406702907
109	NC_018642	AATTT	2	10	133329	133338	40 %	60 %	0 %	0 %	406702908
110	NC_018642	TTGTT	2	10	135695	135704	0 %	80 %	20 %	0 %	406702910
111	NC_018642	ATTTT	2	10	137497	137506	20 %	80 %	0 %	0 %	406702912
112	NC_018642	AAAAT	2	10	138999	139008	80 %	20 %	0 %	0 %	406702912
113	NC_018642	AACTT	2	10	140308	140317	40 %	40 %	0 %	20 %	406702915
114	NC_018642	ACAAA	2	10	140410	140419	80 %	0 %	0 %	20 %	406702915
115	NC_018642	ACTTG	2	10	141204	141213	20 %	40 %	20 %	20 %	406702915
116	NC_018642	CCACA	2	10	141545	141554	40 %	0 %	0 %	60 %	406702915
117	NC_018642	TTGGT	2	10	142000	142009	0 %	60 %	40 %	0 %	406702916
118	NC_018642	TGTTT	2	10	142343	142352	0 %	80 %	20 %	0 %	406702916
119	NC_018642	TATGA	2	10	144980	144989	40 %	40 %	20 %	0 %	406702920
120	NC_018642	TAACG	2	10	146829	146838	40 %	20 %	20 %	20 %	406702923
121	NC_018642	AGTAG	2	10	147151	147160	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018642	TAAAA	2	10	148206	148215	80 %	20 %	0 %	0 %	406702926
123	NC_018642	ATCCG	2	10	149821	149830	20 %	20 %	20 %	40 %	406702928
124	NC_018642	TTTAA	2	10	150514	150523	40 %	60 %	0 %	0 %	406702928
125	NC_018642	AATTT	2	10	150700	150709	40 %	60 %	0 %	0 %	406702928
126	NC_018642	GATAA	2	10	150867	150876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018642	AAACG	2	10	151850	151859	60 %	0 %	20 %	20 %	406702930
128	NC_018642	AATAA	2	10	151973	151982	80 %	20 %	0 %	0 %	406702930
129	NC_018642	GAATA	2	10	153934	153943	60 %	20 %	20 %	0 %	406702933
130	NC_018642	TTACT	2	10	155132	155141	20 %	60 %	0 %	20 %	406702934
131	NC_018642	AGATG	2	10	155180	155189	40 %	20 %	40 %	0 %	406702934
132	NC_018642	ATATG	2	10	157847	157856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018642	GCCAA	2	10	158160	158169	40 %	0 %	20 %	40 %	406702936
134	NC_018642	TCTAA	2	10	160211	160220	40 %	40 %	0 %	20 %	406702937
135	NC_018642	AAACA	2	10	160823	160832	80 %	0 %	0 %	20 %	406702937
136	NC_018642	GGAAT	2	10	163361	163370	40 %	20 %	40 %	0 %	406702939
137	NC_018642	AAGAT	2	10	163782	163791	60 %	20 %	20 %	0 %	406702939
138	NC_018642	GAATT	2	10	164153	164162	40 %	40 %	20 %	0 %	406702940
139	NC_018642	AAATA	2	10	167205	167214	80 %	20 %	0 %	0 %	406702944
140	NC_018642	TTGTA	2	10	169933	169942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018642	ACTTT	2	10	170868	170877	20 %	60 %	0 %	20 %	406702948
142	NC_018642	AAAAG	2	10	172297	172306	80 %	0 %	20 %	0 %	406702949
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149	NC_018642	TACAT	2	10	183154	183163	40 %	40 %	0 %	20 %	406702956
150	NC_018642	GCGTT	2	10	183778	183787	0 %	40 %	40 %	20 %	406702956
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152	NC_018642	TAAAA	2	10	187085	187094	80 %	20 %	0 %	0 %	406702958
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156	NC_018642	AATTT	2	10	190874	190883	40 %	60 %	0 %	0 %	406702963
157	NC_018642	ATTTG	2	10	191701	191710	20 %	60 %	20 %	0 %	406702964
158	NC_018642	TTGTC	2	10	196163	196172	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018642	ACAAA	2	10	196528	196537	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_018642	AAAAG	2	10	209688	209697	80 %	0 %	20 %	0 %	406702979
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177	NC_018642	AAAAT	2	10	213585	213594	80 %	20 %	0 %	0 %	406702984
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183	NC_018642	AGCCG	2	10	220476	220485	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_018642	ATCCG	2	10	221207	221216	20 %	20 %	20 %	40 %	406702991
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186	NC_018642	TTACT	2	10	222936	222945	20 %	60 %	0 %	20 %	406702991
187	NC_018642	ACTGT	2	10	225694	225703	20 %	40 %	20 %	20 %	406702993
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190	NC_018642	GAAAA	2	10	229037	229046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
191	NC_018642	GAATA	2	10	232126	232135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018642	AAATT	2	10	233811	233820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_018642	TAATT	2	10	240031	240040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018642	TCGTG	2	10	241190	241199	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_018642	AAGGT	2	10	242658	242667	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018642	GAGAA	2	10	247100	247109	60 %	0 %	40 %	0 %	406703004
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201	NC_018642	GAACA	2	10	247526	247535	60 %	0 %	20 %	20 %	406703005
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221	NC_018642	AGTAT	2	10	284610	284619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
222	NC_018642	AGAAA	2	10	284750	284759	80 %	0 %	20 %	0 %	406703037
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242	NC_018642	AGGTA	2	10	301535	301544	40 %	20 %	40 %	0 %	406703051
243	NC_018642	AAAGA	2	10	304198	304207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_018642	ATTGT	2	10	305365	305374	20 %	60 %	20 %	0 %	406703055
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256	NC_018642	GTTAC	2	10	322535	322544	20 %	40 %	20 %	20 %	406703071
257	NC_018642	TTATT	2	10	326754	326763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018642	GTTAT	2	10	328315	328324	20 %	60 %	20 %	0 %	406703077
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260	NC_018642	GTTTT	2	10	330311	330320	0 %	80 %	20 %	0 %	406703079
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267	NC_018642	TTCTT	2	10	345310	345319	0 %	80 %	0 %	20 %	406703094
268	NC_018642	AATAA	2	10	345621	345630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018642	ATTGT	2	10	346979	346988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_018642	TTCTT	2	10	512565	512574	0 %	80 %	0 %	20 %	406703257
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401	NC_018642	ACTTA	2	10	535306	535315	40 %	40 %	0 %	20 %	406703281
402	NC_018642	CAAAA	2	10	535327	535336	80 %	0 %	0 %	20 %	406703281
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405	NC_018642	AAAAC	2	10	541298	541307	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
406	NC_018642	GTTTT	2	10	541320	541329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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