MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes L312

Total Repeats: 41726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018642	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702776
2	NC_018642	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
3	NC_018642	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
4	NC_018642	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
5	NC_018642	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
6	NC_018642	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702776
7	NC_018642	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406702776
8	NC_018642	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702776
9	NC_018642	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
10	NC_018642	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
11	NC_018642	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
12	NC_018642	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
13	NC_018642	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
14	NC_018642	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
15	NC_018642	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
16	NC_018642	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702776
17	NC_018642	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
18	NC_018642	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702776
19	NC_018642	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702776
20	NC_018642	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702776
21	NC_018642	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702776
22	NC_018642	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
23	NC_018642	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702776
24	NC_018642	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702776
25	NC_018642	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702776
26	NC_018642	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702776
27	NC_018642	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
28	NC_018642	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
29	NC_018642	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
30	NC_018642	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702777
31	NC_018642	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702777
32	NC_018642	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702777
33	NC_018642	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
34	NC_018642	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
35	NC_018642	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
36	NC_018642	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702777
37	NC_018642	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702777
38	NC_018642	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702777
39	NC_018642	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702777
40	NC_018642	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702777
41	NC_018642	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
42	NC_018642	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702777
43	NC_018642	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
44	NC_018642	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702778
45	NC_018642	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
46	NC_018642	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
47	NC_018642	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
48	NC_018642	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
49	NC_018642	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702778
50	NC_018642	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
51	NC_018642	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
52	NC_018642	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702778
53	NC_018642	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702778
54	NC_018642	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702778
55	NC_018642	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702778
56	NC_018642	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702778
57	NC_018642	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702778
58	NC_018642	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406702778
59	NC_018642	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702778
60	NC_018642	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
61	NC_018642	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
62	NC_018642	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
63	NC_018642	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
64	NC_018642	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702778
65	NC_018642	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702778
66	NC_018642	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702778
67	NC_018642	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702778
68	NC_018642	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018642	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702779
70	NC_018642	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406702779
71	NC_018642	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702780
72	NC_018642	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
73	NC_018642	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
74	NC_018642	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
75	NC_018642	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702780
76	NC_018642	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702780
77	NC_018642	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702780
78	NC_018642	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
79	NC_018642	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702780
80	NC_018642	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702780
81	NC_018642	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
82	NC_018642	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702780
83	NC_018642	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
84	NC_018642	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702780
85	NC_018642	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018642	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018642	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
88	NC_018642	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702781
89	NC_018642	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
90	NC_018642	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702781
91	NC_018642	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
92	NC_018642	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702781
93	NC_018642	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
94	NC_018642	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
95	NC_018642	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
96	NC_018642	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702781
97	NC_018642	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
98	NC_018642	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702781
99	NC_018642	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702781
100	NC_018642	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702781
101	NC_018642	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702781
102	NC_018642	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
103	NC_018642	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702781
104	NC_018642	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702781
105	NC_018642	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702781
106	NC_018642	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
107	NC_018642	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
108	NC_018642	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406702781
109	NC_018642	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702781
110	NC_018642	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702781
111	NC_018642	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702781
112	NC_018642	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702781
113	NC_018642	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702781
114	NC_018642	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702781
115	NC_018642	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702781
116	NC_018642	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018642	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018642	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702782
119	NC_018642	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702782
120	NC_018642	TCG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702782
121	NC_018642	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406702782
122	NC_018642	CTT	2	6	8467	8472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702782
123	NC_018642	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702782
124	NC_018642	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406702782
125	NC_018642	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406702782
126	NC_018642	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702782
127	NC_018642	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702782
128	NC_018642	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702782
129	NC_018642	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702782
130	NC_018642	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702782
131	NC_018642	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702782
132	NC_018642	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406702782
133	NC_018642	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702782
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143	NC_018642	TGA	3	9	9441	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702782
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153	NC_018642	TTC	2	6	9739	9744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702782
154	NC_018642	ATC	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702782
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258	NC_018642	GTT	2	6	17735	17740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406702790
259	NC_018642	CAT	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702790
260	NC_018642	ATC	2	6	17819	17824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702790
261	NC_018642	TAT	2	6	17878	17883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_018642	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_018642	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_018642	TGC	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406702791
265	NC_018642	ACT	2	6	18335	18340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702791
266	NC_018642	ATT	2	6	18426	18431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702791
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288	NC_018642	TGA	2	6	20008	20013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702792
289	NC_018642	ATT	2	6	20118	20123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702792
290	NC_018642	TTC	2	6	20190	20195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702792
291	NC_018642	ATG	2	6	20220	20225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406702792
292	NC_018642	ATT	2	6	20304	20309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702792
293	NC_018642	CTT	2	6	20405	20410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406702792
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341	NC_018642	GAG	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_018642	CAT	2	6	25621	25626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406702797
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375	NC_018642	TAT	3	9	26295	26303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702798
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378	NC_018642	GAA	2	6	26497	26502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406702798
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381	NC_018642	TAT	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406702799
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