MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018641	AAAAGT	2	12	3348	3359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018641	AAGGTT	2	12	32862	32873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018641	TTCTTT	2	12	52195	52206	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018641	CATGCC	2	12	63768	63779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018641	TGATCT	2	12	76412	76423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018641	TGATCT	2	12	79112	79123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018641	GGAGAA	2	12	80290	80301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018641	AAAAAT	2	12	81475	81486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018641	AATATA	2	12	88737	88748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018641	TAGGGG	2	12	90261	90272	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018641	GTTTTT	2	12	91186	91197	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018641	GCTAAG	2	12	94000	94011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018641	TAGTTA	2	12	94189	94200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018641	TGGGTA	2	12	146258	146269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018641	TATTTT	2	12	147352	147363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018641	GTGATG	2	12	149777	149788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018641	GAATAA	2	12	155420	155431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018641	TGACAA	2	12	169190	169201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018641	ATCAAA	2	12	173881	173892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018641	TAAAAA	2	12	174133	174144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018641	GGGCAA	2	12	223758	223769	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018641	TGGAAG	2	12	263461	263472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018641	CTGCGA	2	12	263550	263561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018641	TAAAAA	2	12	292205	292216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018641	CTGCGA	2	12	307867	307878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018641	TTGTAA	2	12	352674	352685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018641	ATATTG	2	12	366833	366844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018641	TCTTTT	2	12	367747	367758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018641	AAAATA	2	12	397422	397433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018641	AATTTT	2	12	408788	408799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018641	AACTTT	2	12	429536	429547	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018641	CAATGC	2	12	451459	451470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018641	CTCTAT	2	12	464873	464884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018641	ACCTGA	2	12	500227	500238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018641	TCTGAT	2	12	525932	525943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018641	CAAAAA	2	12	551387	551398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018641	CAACAT	2	12	561063	561074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018641	TCTAAA	2	12	625586	625597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018641	GAAACG	2	12	655314	655325	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018641	TGCGAC	2	12	685861	685872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018641	GAAAAA	2	12	722072	722083	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018641	GAGGAT	2	12	735287	735298	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018641	TCGCAG	2	12	758953	758964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018641	CTGCGA	2	12	761940	761951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018641	TCGCAG	2	12	797292	797303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018641	TCGCAG	2	12	825683	825694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018641	AAAATA	2	12	828605	828616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018641	TCTTCA	2	12	868715	868726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018641	TGGAAG	2	12	889363	889374	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018641	CTGCGA	2	12	889452	889463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018641	TGTTAT	2	12	890470	890481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018641	TATACT	2	12	897510	897521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018641	TGGAAG	2	12	911037	911048	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018641	CTGCGA	2	12	911126	911137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018641	TCGCAG	2	12	919438	919449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018641	TCGCAG	2	12	919562	919573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018641	TATTTT	2	12	967860	967871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018641	TTGCGG	2	12	984273	984284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018641	CTGCGA	2	12	993488	993499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018641	GTTTTT	2	12	1043829	1043840	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018641	AAAAAT	2	12	1054204	1054215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018641	TTTAGT	2	12	1163059	1163070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018641	TTTTTA	2	12	1183959	1183970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018641	TGAATT	2	12	1196640	1196651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018641	CTGCGA	2	12	1201952	1201963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018641	GAAAAG	2	12	1299499	1299510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018641	AACGAA	2	12	1356215	1356226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018641	AGCGCA	2	12	1440752	1440763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018641	ATGCGG	2	12	1483001	1483012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018641	TGAAAA	2	12	1507925	1507936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018641	GATAGT	2	12	1526290	1526301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018641	TCGCAG	2	12	1560164	1560175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018641	AGGATG	2	12	1562298	1562309	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018641	TCGCAG	2	12	1592868	1592879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018641	CGAAAA	2	12	1592921	1592932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018641	GATCAG	2	12	1593155	1593166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018641	CTGGAT	2	12	1603499	1603510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018641	ACGCCA	2	12	1604276	1604287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018641	TCGCAG	2	12	1619400	1619411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018641	TTAGTT	2	12	1639171	1639182	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018641	TTTGTC	2	12	1676105	1676116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018641	TTTTGA	2	12	1683645	1683656	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018641	AATGCT	2	12	1704257	1704268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018641	ACAGGT	2	12	1709205	1709216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018641	CTGCGA	2	12	1778549	1778560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018641	CCTGCC	2	12	1803618	1803629	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018641	TCTTTG	2	12	1825820	1825831	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018641	AAGGCA	2	12	1904863	1904874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018641	CAACCC	2	12	1906086	1906097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018641	TCGCCA	2	12	1911892	1911903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018641	ATCAAA	2	12	1914448	1914459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018641	TTACGA	2	12	1938157	1938168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018641	TCGCAG	2	12	1984710	1984721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018641	CACTTC	2	12	1984873	1984884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018641	ATTGTT	2	12	1993471	1993482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018641	CATGGT	2	12	2002970	2002981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018641	GACATG	2	12	2040733	2040744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018641	TAACCT	2	12	2050934	2050945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018641	CTTTCA	2	12	2053996	2054007	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018641	ACCGCT	2	12	2064373	2064384	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018641	GATAGC	2	12	2125367	2125378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018641	ATAACA	2	12	2127321	2127332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018641	AAATAA	2	12	2149919	2149930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018641	TGAATC	2	12	2185738	2185749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018641	TCGCAG	2	12	2194407	2194418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018641	TTTTGC	2	12	2216511	2216522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018641	CTGCGA	2	12	2243286	2243297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018641	ATTTTA	2	12	2263269	2263280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018641	TCATTT	2	12	2270263	2270274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018641	GAACCA	2	12	2273464	2273475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018641	GATATG	2	12	2275725	2275736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018641	CGCATC	2	12	2282075	2282086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018641	ATTTAA	2	12	2284887	2284898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018641	AAATTG	2	12	2295540	2295551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018641	CTGCGA	2	12	2312321	2312332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018641	GAGACC	2	12	2324383	2324394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018641	TATTTT	2	12	2351697	2351708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018641	GTGAGC	2	12	2371442	2371453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018641	TTCGCA	2	12	2386384	2386395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018641	TAACAA	2	12	2426531	2426542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018641	CATGAA	2	12	2435555	2435566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018641	AATTTA	2	12	2437886	2437897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018641	AAATTA	2	12	2458454	2458465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018641	GTCTTC	2	12	2468664	2468675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018641	CTTGTT	2	12	2519461	2519472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018641	TACAGT	2	12	2529310	2529321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018641	ACATAT	2	12	2545661	2545672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018641	TGTCGC	2	12	2548263	2548274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018641	AACGGC	2	12	2614595	2614606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018641	TCGCAG	2	12	2624298	2624309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018641	TCGCAG	2	12	2636209	2636220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018641	CACTTC	2	12	2636372	2636383	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018641	TTAAGA	2	12	2684867	2684878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018641	AAAAAC	2	12	2690921	2690932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018641	TTTCAG	2	12	2778003	2778014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_018641	AAATTT	2	12	2783272	2783283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018641	TAAACG	2	12	2814186	2814197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_018641	CGCAGG	2	12	2814202	2814213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018641	AGACCT	2	12	2839970	2839981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018641	GGTCAG	2	12	2866745	2866756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_018641	TCCTAT	2	12	2934540	2934551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018641	TCGCAG	2	12	2977456	2977467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018641	GTGAGC	2	12	2978458	2978469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018641	TTTCTA	2	12	3057652	3057663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_018641	TACTGC	2	12	3057734	3057745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.