MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 1956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	409995666
2	NC_018641	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018641	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	409995667
4	NC_018641	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	409995671
5	NC_018641	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	409995671
6	NC_018641	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	409995671
7	NC_018641	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	409995672
8	NC_018641	GACAA	2	10	9041	9050	60 %	0 %	20 %	20 %	409995672
9	NC_018641	CATTT	2	10	10155	10164	20 %	60 %	0 %	20 %	409995673
10	NC_018641	GTCGA	2	10	14526	14535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018641	CAAAA	2	10	14936	14945	80 %	0 %	0 %	20 %	409995679
12	NC_018641	ATTGA	2	10	20034	20043	40 %	40 %	20 %	0 %	409995685
13	NC_018641	CAACC	2	10	21361	21370	40 %	0 %	0 %	60 %	409995687
14	NC_018641	TGGCT	2	10	22958	22967	0 %	40 %	40 %	20 %	409995689
15	NC_018641	GCTTT	2	10	24510	24519	0 %	60 %	20 %	20 %	409995690
16	NC_018641	CAGCG	2	10	25157	25166	20 %	0 %	40 %	40 %	409995690
17	NC_018641	GCCCG	2	10	26061	26070	0 %	0 %	40 %	60 %	409995690
18	NC_018641	GTTTT	2	10	27129	27138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018641	GGCTA	2	10	28575	28584	20 %	20 %	40 %	20 %	409995695
20	NC_018641	TTGTT	2	10	28871	28880	0 %	80 %	20 %	0 %	409995696
21	NC_018641	AAGCC	2	10	33295	33304	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018641	CAAAG	2	10	34143	34152	60 %	0 %	20 %	20 %	409995699
23	NC_018641	TTCTT	2	10	34192	34201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018641	TTTCT	2	10	41213	41222	0 %	80 %	0 %	20 %	409995708
25	NC_018641	GAAAG	2	10	43522	43531	60 %	0 %	40 %	0 %	409995713
26	NC_018641	GTTTG	2	10	44520	44529	0 %	60 %	40 %	0 %	409995714
27	NC_018641	TAAAG	2	10	45267	45276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018641	GAAAA	2	10	46869	46878	80 %	0 %	20 %	0 %	409995718
29	NC_018641	TTGAA	2	10	47294	47303	40 %	40 %	20 %	0 %	409995718
30	NC_018641	ATAAA	2	10	47440	47449	80 %	20 %	0 %	0 %	409995718
31	NC_018641	AATAA	2	10	47686	47695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018641	TCAAT	2	10	48304	48313	40 %	40 %	0 %	20 %	409995719
33	NC_018641	AACGC	2	10	50189	50198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018641	ATGAA	2	10	50621	50630	60 %	20 %	20 %	0 %	409995721
35	NC_018641	ACAAA	2	10	52150	52159	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018641	TTTCT	2	10	52784	52793	0 %	80 %	0 %	20 %	409995724
37	NC_018641	TCGTT	2	10	53181	53190	0 %	60 %	20 %	20 %	409995724
38	NC_018641	TTCTT	2	10	53732	53741	0 %	80 %	0 %	20 %	409995725
39	NC_018641	TGTTT	2	10	56886	56895	0 %	80 %	20 %	0 %	409995727
40	NC_018641	GCGCC	2	10	58389	58398	0 %	0 %	40 %	60 %	409995728
41	NC_018641	CAGTT	2	10	60861	60870	20 %	40 %	20 %	20 %	409995729
42	NC_018641	TTGAT	2	10	67894	67903	20 %	60 %	20 %	0 %	409995737
43	NC_018641	TTGCT	2	10	67987	67996	0 %	60 %	20 %	20 %	409995737
44	NC_018641	CGTTT	2	10	69887	69896	0 %	60 %	20 %	20 %	409995739
45	NC_018641	TAAGT	2	10	73746	73755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018641	TCATC	2	10	75295	75304	20 %	40 %	0 %	40 %	409995745
47	NC_018641	AAAGC	2	10	76762	76771	60 %	0 %	20 %	20 %	409995746
48	NC_018641	AGTTG	2	10	77278	77287	20 %	40 %	40 %	0 %	409995746
49	NC_018641	GTATT	2	10	77508	77517	20 %	60 %	20 %	0 %	409995746
50	NC_018641	CGGCC	2	10	80060	80069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_018641	GAAGC	2	10	82291	82300	40 %	0 %	40 %	20 %	409995752
52	NC_018641	TGGCA	2	10	82458	82467	20 %	20 %	40 %	20 %	409995752
53	NC_018641	GTTTC	2	10	85239	85248	0 %	60 %	20 %	20 %	409995755
54	NC_018641	TGTGC	2	10	86365	86374	0 %	40 %	40 %	20 %	409995756
55	NC_018641	TGCTT	2	10	87436	87445	0 %	60 %	20 %	20 %	409995757
56	NC_018641	ATCCA	2	10	87899	87908	40 %	20 %	0 %	40 %	409995758
57	NC_018641	AACCA	2	10	88274	88283	60 %	0 %	0 %	40 %	409995758
58	NC_018641	AAAAT	2	10	88852	88861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018641	GTTAA	2	10	88873	88882	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018641	TGAAT	2	10	90858	90867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018641	TAGTT	2	10	91773	91782	20 %	60 %	20 %	0 %	409995763
62	NC_018641	AGATA	2	10	94063	94072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018641	CCAAC	2	10	94521	94530	40 %	0 %	0 %	60 %	409995765
64	NC_018641	TCCCA	2	10	95568	95577	20 %	20 %	0 %	60 %	409995766
65	NC_018641	CCCAG	2	10	96201	96210	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_018641	GCTTT	2	10	99209	99218	0 %	60 %	20 %	20 %	409995768
67	NC_018641	ATTGA	2	10	102463	102472	40 %	40 %	20 %	0 %	409995770
68	NC_018641	CAAAA	2	10	105138	105147	80 %	0 %	0 %	20 %	409995774
69	NC_018641	ATTTC	2	10	105664	105673	20 %	60 %	0 %	20 %	409995774
70	NC_018641	ATGGC	2	10	107380	107389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018641	GAAGA	2	10	109726	109735	60 %	0 %	40 %	0 %	409995778
72	NC_018641	GAAAA	2	10	109744	109753	80 %	0 %	20 %	0 %	409995778
73	NC_018641	CAAAG	2	10	109810	109819	60 %	0 %	20 %	20 %	409995778
74	NC_018641	CGGCC	2	10	113515	113524	0 %	0 %	40 %	60 %	409995781
75	NC_018641	CTCAA	2	10	114098	114107	40 %	20 %	0 %	40 %	409995781
76	NC_018641	ACCAA	2	10	114369	114378	60 %	0 %	0 %	40 %	409995781
77	NC_018641	CAAGT	2	10	115328	115337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018641	GACCC	2	10	116775	116784	20 %	0 %	20 %	60 %	409995783
79	NC_018641	ACCAA	2	10	117363	117372	60 %	0 %	0 %	40 %	409995784
80	NC_018641	TTGGC	2	10	118879	118888	0 %	40 %	40 %	20 %	409995784
81	NC_018641	GAAAA	2	10	122283	122292	80 %	0 %	20 %	0 %	409995787
82	NC_018641	TCAAA	2	10	126853	126862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018641	ATTGC	2	10	129343	129352	20 %	40 %	20 %	20 %	409995793
84	NC_018641	TGATC	2	10	130173	130182	20 %	40 %	20 %	20 %	409995794
85	NC_018641	CATGC	2	10	131303	131312	20 %	20 %	20 %	40 %	409995795
86	NC_018641	CGATC	2	10	138053	138062	20 %	20 %	20 %	40 %	409995803
87	NC_018641	AAAGC	2	10	144007	144016	60 %	0 %	20 %	20 %	409995811
88	NC_018641	CATAA	2	10	144076	144085	60 %	20 %	0 %	20 %	409995811
89	NC_018641	GGGAT	2	10	145168	145177	20 %	20 %	60 %	0 %	409995812
90	NC_018641	GCTCA	2	10	145503	145512	20 %	20 %	20 %	40 %	409995812
91	NC_018641	GTCAT	2	10	147446	147455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018641	TTTTC	2	10	149482	149491	0 %	80 %	0 %	20 %	409995816
93	NC_018641	CAAGC	2	10	150870	150879	40 %	0 %	20 %	40 %	409995817
94	NC_018641	AATGA	2	10	152170	152179	60 %	20 %	20 %	0 %	409995818
95	NC_018641	CCAAC	2	10	152738	152747	40 %	0 %	0 %	60 %	409995819
96	NC_018641	GCCTT	2	10	154630	154639	0 %	40 %	20 %	40 %	409995821
97	NC_018641	GAGGC	2	10	157454	157463	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018641	GTAAG	2	10	158766	158775	40 %	20 %	40 %	0 %	409995825
99	NC_018641	CACAA	2	10	160200	160209	60 %	0 %	0 %	40 %	409995826
100	NC_018641	TGAAT	2	10	162188	162197	40 %	40 %	20 %	0 %	409995828
101	NC_018641	ATCAA	2	10	163640	163649	60 %	20 %	0 %	20 %	409995830
102	NC_018641	CCGTT	2	10	167859	167868	0 %	40 %	20 %	40 %	409995834
103	NC_018641	CCAAC	2	10	170268	170277	40 %	0 %	0 %	60 %	409995836
104	NC_018641	GAACC	2	10	171519	171528	40 %	0 %	20 %	40 %	409995836
105	NC_018641	TGAAG	2	10	172916	172925	40 %	20 %	40 %	0 %	409995837
106	NC_018641	CAGCC	2	10	173828	173837	20 %	0 %	20 %	60 %	409995837
107	NC_018641	GTTCA	2	10	173908	173917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018641	CAATG	2	10	174195	174204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018641	TGGTT	2	10	175145	175154	0 %	60 %	40 %	0 %	409995840
110	NC_018641	CTGAA	2	10	177024	177033	40 %	20 %	20 %	20 %	409995842
111	NC_018641	GTTGA	2	10	179302	179311	20 %	40 %	40 %	0 %	409995843
112	NC_018641	TCGAT	2	10	180829	180838	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018641	CGTTG	2	10	181527	181536	0 %	40 %	40 %	20 %	409995845
114	NC_018641	AGATG	2	10	182503	182512	40 %	20 %	40 %	0 %	409995846
115	NC_018641	AAGGT	2	10	184715	184724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018641	TTCAT	2	10	184990	184999	20 %	60 %	0 %	20 %	409995850
117	NC_018641	TGAGG	2	10	185191	185200	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018641	AAATG	2	10	186155	186164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018641	GGCAT	2	10	187805	187814	20 %	20 %	40 %	20 %	409995855
120	NC_018641	TCGTT	2	10	188222	188231	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018641	CGGCA	2	10	188409	188418	20 %	0 %	40 %	40 %	409995856
122	NC_018641	GCCAA	2	10	193395	193404	40 %	0 %	20 %	40 %	409995864
123	NC_018641	CTGGG	2	10	196160	196169	0 %	20 %	60 %	20 %	409995868
124	NC_018641	ACTTC	2	10	198322	198331	20 %	40 %	0 %	40 %	409995870
125	NC_018641	GTAGA	2	10	198722	198731	40 %	20 %	40 %	0 %	409995871
126	NC_018641	GCTTG	2	10	200526	200535	0 %	40 %	40 %	20 %	409995873
127	NC_018641	CGTCA	2	10	204489	204498	20 %	20 %	20 %	40 %	409995878
128	NC_018641	TCAAT	2	10	204613	204622	40 %	40 %	0 %	20 %	409995878
129	NC_018641	AAATC	2	10	211493	211502	60 %	20 %	0 %	20 %	409995884
130	NC_018641	TGGAA	2	10	212558	212567	40 %	20 %	40 %	0 %	409995886
131	NC_018641	CAGAA	2	10	213062	213071	60 %	0 %	20 %	20 %	409995886
132	NC_018641	ATTTG	2	10	216286	216295	20 %	60 %	20 %	0 %	409995890
133	NC_018641	AAATG	2	10	219715	219724	60 %	20 %	20 %	0 %	409995892
134	NC_018641	CAAAA	2	10	220235	220244	80 %	0 %	0 %	20 %	409995892
135	NC_018641	ACTGG	2	10	220427	220436	20 %	20 %	40 %	20 %	409995893
136	NC_018641	CCATG	2	10	221631	221640	20 %	20 %	20 %	40 %	409995894
137	NC_018641	GAGTC	2	10	223397	223406	20 %	20 %	40 %	20 %	409995896
138	NC_018641	ACTCA	2	10	224370	224379	40 %	20 %	0 %	40 %	409995897
139	NC_018641	ATTTG	2	10	225015	225024	20 %	60 %	20 %	0 %	409995898
140	NC_018641	TTTGA	2	10	228908	228917	20 %	60 %	20 %	0 %	409995900
141	NC_018641	CGTTT	2	10	232226	232235	0 %	60 %	20 %	20 %	409995905
142	NC_018641	ATTTG	2	10	233640	233649	20 %	60 %	20 %	0 %	409995907
143	NC_018641	CAGTG	2	10	234881	234890	20 %	20 %	40 %	20 %	409995908
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145	NC_018641	GAAGC	2	10	235718	235727	40 %	0 %	40 %	20 %	409995908
146	NC_018641	CTGGA	2	10	238817	238826	20 %	20 %	40 %	20 %	409995911
147	NC_018641	GTTGT	2	10	242765	242774	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018641	AGTTG	2	10	243206	243215	20 %	40 %	40 %	0 %	409995916
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151	NC_018641	TGTCA	2	10	244229	244238	20 %	40 %	20 %	20 %	409995917
152	NC_018641	TGATC	2	10	248033	248042	20 %	40 %	20 %	20 %	409995920
153	NC_018641	AAAAG	2	10	249151	249160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018641	AACTT	2	10	250052	250061	40 %	40 %	0 %	20 %	409995921
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159	NC_018641	AGATC	2	10	257084	257093	40 %	20 %	20 %	20 %	409995928
160	NC_018641	GCACT	2	10	257317	257326	20 %	20 %	20 %	40 %	409995928
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162	NC_018641	TCGTG	2	10	259912	259921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018641	TCGCA	2	10	260572	260581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_018641	GAGAT	2	10	263398	263407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018641	ATTCG	2	10	264839	264848	20 %	40 %	20 %	20 %	409995931
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175	NC_018641	AGATA	2	10	274185	274194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018641	TTGGG	2	10	275063	275072	0 %	40 %	60 %	0 %	409995945
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179	NC_018641	TTTCT	2	10	279665	279674	0 %	80 %	0 %	20 %	409995949
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266	NC_018641	CAGTT	2	10	419409	419418	20 %	40 %	20 %	20 %	409996094
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