MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 1617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	409995666
2	NC_018641	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	409995667
3	NC_018641	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	409995671
4	NC_018641	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	409995671
5	NC_018641	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	409995671
6	NC_018641	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	409995672
7	NC_018641	GACAA	2	10	9041	9050	60 %	0 %	20 %	20 %	409995672
8	NC_018641	CATTT	2	10	10155	10164	20 %	60 %	0 %	20 %	409995673
9	NC_018641	CAAAA	2	10	14936	14945	80 %	0 %	0 %	20 %	409995679
10	NC_018641	ATTGA	2	10	20034	20043	40 %	40 %	20 %	0 %	409995685
11	NC_018641	CAACC	2	10	21361	21370	40 %	0 %	0 %	60 %	409995687
12	NC_018641	TGGCT	2	10	22958	22967	0 %	40 %	40 %	20 %	409995689
13	NC_018641	GCTTT	2	10	24510	24519	0 %	60 %	20 %	20 %	409995690
14	NC_018641	CAGCG	2	10	25157	25166	20 %	0 %	40 %	40 %	409995690
15	NC_018641	GCCCG	2	10	26061	26070	0 %	0 %	40 %	60 %	409995690
16	NC_018641	GGCTA	2	10	28575	28584	20 %	20 %	40 %	20 %	409995695
17	NC_018641	TTGTT	2	10	28871	28880	0 %	80 %	20 %	0 %	409995696
18	NC_018641	CAAAG	2	10	34143	34152	60 %	0 %	20 %	20 %	409995699
19	NC_018641	TTTCT	2	10	41213	41222	0 %	80 %	0 %	20 %	409995708
20	NC_018641	GAAAG	2	10	43522	43531	60 %	0 %	40 %	0 %	409995713
21	NC_018641	GTTTG	2	10	44520	44529	0 %	60 %	40 %	0 %	409995714
22	NC_018641	GAAAA	2	10	46869	46878	80 %	0 %	20 %	0 %	409995718
23	NC_018641	TTGAA	2	10	47294	47303	40 %	40 %	20 %	0 %	409995718
24	NC_018641	ATAAA	2	10	47440	47449	80 %	20 %	0 %	0 %	409995718
25	NC_018641	TCAAT	2	10	48304	48313	40 %	40 %	0 %	20 %	409995719
26	NC_018641	ATGAA	2	10	50621	50630	60 %	20 %	20 %	0 %	409995721
27	NC_018641	TTTCT	2	10	52784	52793	0 %	80 %	0 %	20 %	409995724
28	NC_018641	TCGTT	2	10	53181	53190	0 %	60 %	20 %	20 %	409995724
29	NC_018641	TTCTT	2	10	53732	53741	0 %	80 %	0 %	20 %	409995725
30	NC_018641	TGTTT	2	10	56886	56895	0 %	80 %	20 %	0 %	409995727
31	NC_018641	GCGCC	2	10	58389	58398	0 %	0 %	40 %	60 %	409995728
32	NC_018641	CAGTT	2	10	60861	60870	20 %	40 %	20 %	20 %	409995729
33	NC_018641	TTGAT	2	10	67894	67903	20 %	60 %	20 %	0 %	409995737
34	NC_018641	TTGCT	2	10	67987	67996	0 %	60 %	20 %	20 %	409995737
35	NC_018641	CGTTT	2	10	69887	69896	0 %	60 %	20 %	20 %	409995739
36	NC_018641	TCATC	2	10	75295	75304	20 %	40 %	0 %	40 %	409995745
37	NC_018641	AAAGC	2	10	76762	76771	60 %	0 %	20 %	20 %	409995746
38	NC_018641	AGTTG	2	10	77278	77287	20 %	40 %	40 %	0 %	409995746
39	NC_018641	GTATT	2	10	77508	77517	20 %	60 %	20 %	0 %	409995746
40	NC_018641	GAAGC	2	10	82291	82300	40 %	0 %	40 %	20 %	409995752
41	NC_018641	TGGCA	2	10	82458	82467	20 %	20 %	40 %	20 %	409995752
42	NC_018641	GTTTC	2	10	85239	85248	0 %	60 %	20 %	20 %	409995755
43	NC_018641	TGTGC	2	10	86365	86374	0 %	40 %	40 %	20 %	409995756
44	NC_018641	TGCTT	2	10	87436	87445	0 %	60 %	20 %	20 %	409995757
45	NC_018641	ATCCA	2	10	87899	87908	40 %	20 %	0 %	40 %	409995758
46	NC_018641	AACCA	2	10	88274	88283	60 %	0 %	0 %	40 %	409995758
47	NC_018641	TAGTT	2	10	91773	91782	20 %	60 %	20 %	0 %	409995763
48	NC_018641	CCAAC	2	10	94521	94530	40 %	0 %	0 %	60 %	409995765
49	NC_018641	TCCCA	2	10	95568	95577	20 %	20 %	0 %	60 %	409995766
50	NC_018641	GCTTT	2	10	99209	99218	0 %	60 %	20 %	20 %	409995768
51	NC_018641	ATTGA	2	10	102463	102472	40 %	40 %	20 %	0 %	409995770
52	NC_018641	CAAAA	2	10	105138	105147	80 %	0 %	0 %	20 %	409995774
53	NC_018641	ATTTC	2	10	105664	105673	20 %	60 %	0 %	20 %	409995774
54	NC_018641	GAAGA	2	10	109726	109735	60 %	0 %	40 %	0 %	409995778
55	NC_018641	GAAAA	2	10	109744	109753	80 %	0 %	20 %	0 %	409995778
56	NC_018641	CAAAG	2	10	109810	109819	60 %	0 %	20 %	20 %	409995778
57	NC_018641	CGGCC	2	10	113515	113524	0 %	0 %	40 %	60 %	409995781
58	NC_018641	CTCAA	2	10	114098	114107	40 %	20 %	0 %	40 %	409995781
59	NC_018641	ACCAA	2	10	114369	114378	60 %	0 %	0 %	40 %	409995781
60	NC_018641	GACCC	2	10	116775	116784	20 %	0 %	20 %	60 %	409995783
61	NC_018641	ACCAA	2	10	117363	117372	60 %	0 %	0 %	40 %	409995784
62	NC_018641	TTGGC	2	10	118879	118888	0 %	40 %	40 %	20 %	409995784
63	NC_018641	GAAAA	2	10	122283	122292	80 %	0 %	20 %	0 %	409995787
64	NC_018641	ATTGC	2	10	129343	129352	20 %	40 %	20 %	20 %	409995793
65	NC_018641	TGATC	2	10	130173	130182	20 %	40 %	20 %	20 %	409995794
66	NC_018641	CATGC	2	10	131303	131312	20 %	20 %	20 %	40 %	409995795
67	NC_018641	CGATC	2	10	138053	138062	20 %	20 %	20 %	40 %	409995803
68	NC_018641	AAAGC	2	10	144007	144016	60 %	0 %	20 %	20 %	409995811
69	NC_018641	CATAA	2	10	144076	144085	60 %	20 %	0 %	20 %	409995811
70	NC_018641	GGGAT	2	10	145168	145177	20 %	20 %	60 %	0 %	409995812
71	NC_018641	GCTCA	2	10	145503	145512	20 %	20 %	20 %	40 %	409995812
72	NC_018641	TTTTC	2	10	149482	149491	0 %	80 %	0 %	20 %	409995816
73	NC_018641	CAAGC	2	10	150870	150879	40 %	0 %	20 %	40 %	409995817
74	NC_018641	AATGA	2	10	152170	152179	60 %	20 %	20 %	0 %	409995818
75	NC_018641	CCAAC	2	10	152738	152747	40 %	0 %	0 %	60 %	409995819
76	NC_018641	GCCTT	2	10	154630	154639	0 %	40 %	20 %	40 %	409995821
77	NC_018641	GTAAG	2	10	158766	158775	40 %	20 %	40 %	0 %	409995825
78	NC_018641	CACAA	2	10	160200	160209	60 %	0 %	0 %	40 %	409995826
79	NC_018641	TGAAT	2	10	162188	162197	40 %	40 %	20 %	0 %	409995828
80	NC_018641	ATCAA	2	10	163640	163649	60 %	20 %	0 %	20 %	409995830
81	NC_018641	CCGTT	2	10	167859	167868	0 %	40 %	20 %	40 %	409995834
82	NC_018641	CCAAC	2	10	170268	170277	40 %	0 %	0 %	60 %	409995836
83	NC_018641	GAACC	2	10	171519	171528	40 %	0 %	20 %	40 %	409995836
84	NC_018641	TGAAG	2	10	172916	172925	40 %	20 %	40 %	0 %	409995837
85	NC_018641	CAGCC	2	10	173828	173837	20 %	0 %	20 %	60 %	409995837
86	NC_018641	TGGTT	2	10	175145	175154	0 %	60 %	40 %	0 %	409995840
87	NC_018641	CTGAA	2	10	177024	177033	40 %	20 %	20 %	20 %	409995842
88	NC_018641	GTTGA	2	10	179302	179311	20 %	40 %	40 %	0 %	409995843
89	NC_018641	CGTTG	2	10	181527	181536	0 %	40 %	40 %	20 %	409995845
90	NC_018641	AGATG	2	10	182503	182512	40 %	20 %	40 %	0 %	409995846
91	NC_018641	TTCAT	2	10	184990	184999	20 %	60 %	0 %	20 %	409995850
92	NC_018641	GGCAT	2	10	187805	187814	20 %	20 %	40 %	20 %	409995855
93	NC_018641	CGGCA	2	10	188409	188418	20 %	0 %	40 %	40 %	409995856
94	NC_018641	GCCAA	2	10	193395	193404	40 %	0 %	20 %	40 %	409995864
95	NC_018641	CTGGG	2	10	196160	196169	0 %	20 %	60 %	20 %	409995868
96	NC_018641	ACTTC	2	10	198322	198331	20 %	40 %	0 %	40 %	409995870
97	NC_018641	GTAGA	2	10	198722	198731	40 %	20 %	40 %	0 %	409995871
98	NC_018641	GCTTG	2	10	200526	200535	0 %	40 %	40 %	20 %	409995873
99	NC_018641	CGTCA	2	10	204489	204498	20 %	20 %	20 %	40 %	409995878
100	NC_018641	TCAAT	2	10	204613	204622	40 %	40 %	0 %	20 %	409995878
101	NC_018641	AAATC	2	10	211493	211502	60 %	20 %	0 %	20 %	409995884
102	NC_018641	TGGAA	2	10	212558	212567	40 %	20 %	40 %	0 %	409995886
103	NC_018641	CAGAA	2	10	213062	213071	60 %	0 %	20 %	20 %	409995886
104	NC_018641	ATTTG	2	10	216286	216295	20 %	60 %	20 %	0 %	409995890
105	NC_018641	AAATG	2	10	219715	219724	60 %	20 %	20 %	0 %	409995892
106	NC_018641	CAAAA	2	10	220235	220244	80 %	0 %	0 %	20 %	409995892
107	NC_018641	ACTGG	2	10	220427	220436	20 %	20 %	40 %	20 %	409995893
108	NC_018641	CCATG	2	10	221631	221640	20 %	20 %	20 %	40 %	409995894
109	NC_018641	GAGTC	2	10	223397	223406	20 %	20 %	40 %	20 %	409995896
110	NC_018641	ACTCA	2	10	224370	224379	40 %	20 %	0 %	40 %	409995897
111	NC_018641	ATTTG	2	10	225015	225024	20 %	60 %	20 %	0 %	409995898
112	NC_018641	TTTGA	2	10	228908	228917	20 %	60 %	20 %	0 %	409995900
113	NC_018641	CGTTT	2	10	232226	232235	0 %	60 %	20 %	20 %	409995905
114	NC_018641	ATTTG	2	10	233640	233649	20 %	60 %	20 %	0 %	409995907
115	NC_018641	CAGTG	2	10	234881	234890	20 %	20 %	40 %	20 %	409995908
116	NC_018641	ATTCA	2	10	235671	235680	40 %	40 %	0 %	20 %	409995908
117	NC_018641	GAAGC	2	10	235718	235727	40 %	0 %	40 %	20 %	409995908
118	NC_018641	CTGGA	2	10	238817	238826	20 %	20 %	40 %	20 %	409995911
119	NC_018641	AGTTG	2	10	243206	243215	20 %	40 %	40 %	0 %	409995916
120	NC_018641	TCCAG	2	10	243921	243930	20 %	20 %	20 %	40 %	409995917
121	NC_018641	TGATT	2	10	243985	243994	20 %	60 %	20 %	0 %	409995917
122	NC_018641	TGTCA	2	10	244229	244238	20 %	40 %	20 %	20 %	409995917
123	NC_018641	TGATC	2	10	248033	248042	20 %	40 %	20 %	20 %	409995920
124	NC_018641	AACTT	2	10	250052	250061	40 %	40 %	0 %	20 %	409995921
125	NC_018641	TAATT	2	10	250536	250545	40 %	60 %	0 %	0 %	409995921
126	NC_018641	CAAAC	2	10	253719	253728	60 %	0 %	0 %	40 %	409995925
127	NC_018641	GATCG	2	10	254979	254988	20 %	20 %	40 %	20 %	409995927
128	NC_018641	AGATC	2	10	257084	257093	40 %	20 %	20 %	20 %	409995928
129	NC_018641	GCACT	2	10	257317	257326	20 %	20 %	20 %	40 %	409995928
130	NC_018641	ATTCG	2	10	264839	264848	20 %	40 %	20 %	20 %	409995931
131	NC_018641	ATGCT	2	10	266794	266803	20 %	40 %	20 %	20 %	409995935
132	NC_018641	ATGGC	2	10	266923	266932	20 %	20 %	40 %	20 %	409995935
133	NC_018641	GATCG	2	10	268042	268051	20 %	20 %	40 %	20 %	409995936
134	NC_018641	TTGCT	2	10	268947	268956	0 %	60 %	20 %	20 %	409995938
135	NC_018641	ACATG	2	10	269820	269829	40 %	20 %	20 %	20 %	409995939
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