MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018641	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018641	ATTA	2	8	12657	12664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018641	AACG	2	8	15201	15208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018641	AAGC	2	8	18871	18878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018641	TAAT	2	8	19638	19645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018641	CGTT	2	8	20292	20299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018641	AGCT	2	8	21731	21738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018641	CGAG	2	8	21941	21948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018641	GGGT	2	8	22158	22165	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018641	GGTT	2	8	28925	28932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018641	CATA	2	8	28971	28978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018641	AGTG	2	8	29117	29124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018641	AACA	2	8	29924	29931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018641	GTGC	2	8	32973	32980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018641	GCAA	2	8	33267	33274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018641	ATGA	2	8	34206	34213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018641	AGCA	2	8	37478	37485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018641	ATTT	2	8	37526	37533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018641	AAAC	2	8	38563	38570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018641	AGAA	2	8	40295	40302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018641	GTCA	2	8	46467	46474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018641	CAAA	2	8	47701	47708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018641	CGCT	2	8	51615	51622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018641	AACA	2	8	54887	54894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018641	TGAA	2	8	55066	55073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018641	TGAA	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018641	CTGG	2	8	63596	63603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018641	ATTG	2	8	63751	63758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018641	ATCA	2	8	63789	63796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018641	TAGC	2	8	65473	65480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018641	ACAA	2	8	65843	65850	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018641	TTGT	2	8	65881	65888	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018641	GACT	2	8	65955	65962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018641	TACT	2	8	71500	71507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018641	GCCA	2	8	73704	73711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018641	GATA	2	8	73928	73935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018641	TGCT	2	8	74016	74023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018641	CAGG	2	8	76542	76549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018641	ATTA	2	8	85414	85421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018641	TCCC	2	8	89837	89844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_018641	AGTA	2	8	89872	89879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018641	GCAC	2	8	90178	90185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018641	CTGG	2	8	90330	90337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018641	TTGC	2	8	90364	90371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018641	TATC	2	8	91172	91179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018641	GTAT	2	8	94103	94110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018641	TAAA	2	8	94176	94183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018641	TTTC	2	8	94237	94244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018641	CAAT	2	8	94334	94341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018641	CGGC	2	8	97957	97964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018641	GTTG	2	8	99794	99801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018641	AAAT	2	8	99851	99858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018641	GTCT	2	8	99998	100005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018641	GGCA	2	8	104415	104422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018641	GTGA	2	8	104470	104477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018641	CTTT	2	8	105915	105922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018641	ATCA	2	8	106850	106857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018641	TTGT	2	8	110149	110156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018641	AAGA	2	8	111662	111669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018641	CAGC	2	8	115402	115409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018641	TGAC	2	8	119613	119620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018641	ATTA	2	8	128482	128489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018641	TTAG	2	8	128532	128539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018641	TGAC	2	8	129958	129965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018641	TGTT	2	8	134235	134242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018641	CAGA	2	8	134319	134326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018641	AAAT	2	8	135428	135435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018641	ATTA	2	8	137775	137782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018641	TTAA	2	8	137915	137922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018641	GATT	2	8	141251	141258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018641	GCCT	2	8	147423	147430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018641	TTAC	2	8	148461	148468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018641	AGTA	2	8	148473	148480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018641	ACAT	2	8	154256	154263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018641	GAAT	2	8	155495	155502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018641	TAAC	2	8	169023	169030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018641	GCAG	2	8	169058	169065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018641	CAGA	2	8	173969	173976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018641	GGTA	2	8	174007	174014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018641	TGAA	2	8	174168	174175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018641	AAAC	2	8	183932	183939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018641	AGAA	2	8	187370	187377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018641	AGTA	2	8	187621	187628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018641	TTAA	2	8	188105	188112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018641	AAAG	2	8	188263	188270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018641	TGCT	2	8	192915	192922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018641	GTTT	2	8	194374	194381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018641	GAAA	2	8	194418	194425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018641	CAGC	2	8	194991	194998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018641	TGTT	2	8	195137	195144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018641	AGGC	2	8	195171	195178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018641	CTTT	2	8	200974	200981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018641	AAGA	2	8	209807	209814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018641	TCAA	2	8	209877	209884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018641	TACT	2	8	209886	209893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018641	TAAA	2	8	210867	210874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018641	TATT	2	8	211884	211891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018641	TGAA	2	8	211943	211950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018641	ATGA	2	8	224773	224780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018641	TACA	2	8	224833	224840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018641	ATAA	2	8	227607	227614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018641	ATTA	2	8	234043	234050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018641	CAAA	2	8	249765	249772	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018641	AAGC	2	8	253865	253872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018641	ATCA	2	8	253914	253921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018641	TATG	2	8	253945	253952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018641	AGCA	2	8	255867	255874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018641	TGCA	2	8	255953	255960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018641	TGGA	2	8	259066	259073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018641	GTGA	2	8	259245	259252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018641	AGCG	2	8	259415	259422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018641	ATGG	2	8	260080	260087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018641	GAGC	2	8	260299	260306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018641	TAAG	2	8	260694	260701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018641	AGAA	2	8	260824	260831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018641	GCGA	2	8	260853	260860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018641	GCTT	2	8	260885	260892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018641	TTGC	2	8	261239	261246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018641	ATGT	2	8	261387	261394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018641	GAGC	2	8	262295	262302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018641	TAGG	2	8	262741	262748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018641	CTGC	2	8	263734	263741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018641	TAAG	2	8	263808	263815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018641	AGCA	2	8	263839	263846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018641	TGCT	3	12	264238	264249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018641	AACC	2	8	265843	265850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018641	CCGA	2	8	265958	265965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018641	AAAG	2	8	273162	273169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018641	GCTT	2	8	274015	274022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018641	ATGG	2	8	278722	278729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018641	TAGA	2	8	278933	278940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018641	AAAG	2	8	282144	282151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018641	CCGG	2	8	286296	286303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018641	TTTA	2	8	287771	287778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018641	TTGC	2	8	287801	287808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018641	TGCT	2	8	287835	287842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018641	ATGA	2	8	290866	290873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018641	TGGT	2	8	292265	292272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018641	ATGA	2	8	295552	295559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018641	CTTA	2	8	300144	300151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018641	TTGA	2	8	300190	300197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018641	AATC	2	8	300249	300256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018641	AGCC	2	8	307902	307909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018641	CAAA	2	8	311194	311201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018641	TGAT	2	8	311247	311254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018641	TTGT	2	8	316351	316358	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018641	GTCT	2	8	316454	316461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018641	ATGG	2	8	322852	322859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018641	CGAG	2	8	330619	330626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018641	ACCT	2	8	331610	331617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018641	GCAA	2	8	334118	334125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_018641	GGAG	2	8	1079418	1079425	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_018641	AGCA	2	8	1116974	1116981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_018641	TAGA	2	8	1126183	1126190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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