MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WC plasmid pcpWC

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018639	TC	3	6	219	224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018639	AC	3	6	819	824	50 %	0 %	0 %	50 %	406598929
3	NC_018639	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018639	AT	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018639	AT	3	6	1725	1730	50 %	50 %	0 %	0 %	406598931
6	NC_018639	AG	3	6	1817	1822	50 %	0 %	50 %	0 %	406598931
7	NC_018639	AT	3	6	2739	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	406598932
8	NC_018639	GA	3	6	3094	3099	50 %	0 %	50 %	0 %	406598932
9	NC_018639	TC	3	6	4159	4164	0 %	50 %	0 %	50 %	406598933
10	NC_018639	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	406598933
11	NC_018639	AT	3	6	4806	4811	50 %	50 %	0 %	0 %	406598933
12	NC_018639	TG	4	8	5052	5059	0 %	50 %	50 %	0 %	406598934
13	NC_018639	GT	3	6	5375	5380	0 %	50 %	50 %	0 %	406598934
14	NC_018639	TA	3	6	5417	5422	50 %	50 %	0 %	0 %	406598934
15	NC_018639	GT	3	6	5721	5726	0 %	50 %	50 %	0 %	406598934
16	NC_018639	CA	3	6	5880	5885	50 %	0 %	0 %	50 %	406598934
17	NC_018639	TA	3	6	6130	6135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018639	CT	3	6	6415	6420	0 %	50 %	0 %	50 %	406598935
19	NC_018639	CT	3	6	6658	6663	0 %	50 %	0 %	50 %	406598935
20	NC_018639	AT	3	6	6789	6794	50 %	50 %	0 %	0 %	406598935
21	NC_018639	AT	3	6	6930	6935	50 %	50 %	0 %	0 %	406598935
22	NC_018639	AC	3	6	7441	7446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.