MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci VS225 plasmid pcpVS225

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018638	GAAA	2	8	124	131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018638	TGAT	2	8	703	710	25 %	50 %	25 %	0 %	406598919
3	NC_018638	TTCT	2	8	1306	1313	0 %	75 %	0 %	25 %	406598919
4	NC_018638	TCTG	2	8	1785	1792	0 %	50 %	25 %	25 %	406598920
5	NC_018638	AGTA	2	8	2156	2163	50 %	25 %	25 %	0 %	406598920
6	NC_018638	TTTC	2	8	2591	2598	0 %	75 %	0 %	25 %	406598921
7	NC_018638	ATAC	2	8	2780	2787	50 %	25 %	0 %	25 %	406598921
8	NC_018638	TATG	2	8	2922	2929	25 %	50 %	25 %	0 %	406598921
9	NC_018638	TAAG	2	8	3312	3319	50 %	25 %	25 %	0 %	406598922
10	NC_018638	TCAT	2	8	3476	3483	25 %	50 %	0 %	25 %	406598922
11	NC_018638	TTAA	2	8	3555	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018638	TTTG	2	8	3585	3592	0 %	75 %	25 %	0 %	406598923
13	NC_018638	AACA	2	8	3757	3764	75 %	0 %	0 %	25 %	406598923
14	NC_018638	TAAA	2	8	3967	3974	75 %	25 %	0 %	0 %	406598923
15	NC_018638	TAAA	2	8	4494	4501	75 %	25 %	0 %	0 %	406598924
16	NC_018638	GTTT	2	8	4544	4551	0 %	75 %	25 %	0 %	406598924
17	NC_018638	ATAA	2	8	5234	5241	75 %	25 %	0 %	0 %	406598924
18	NC_018638	AATC	2	8	6253	6260	50 %	25 %	0 %	25 %	406598925
19	NC_018638	TTTC	2	8	7029	7036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018638	AGAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018638	CTAA	2	8	7314	7321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.