MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci VS225 plasmid pcpVS225

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018638	ACA	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018638	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018638	CTA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018638	AAT	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018638	ATC	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018638	AGA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598919
7	NC_018638	ATA	3	9	690	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
8	NC_018638	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598919
9	NC_018638	AAC	2	6	985	990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598919
10	NC_018638	TAA	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
11	NC_018638	TGC	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598919
12	NC_018638	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598919
13	NC_018638	GCT	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598919
14	NC_018638	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
15	NC_018638	TGG	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598919
16	NC_018638	ACC	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018638	ACC	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018638	ACC	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018638	ACC	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018638	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018638	TGC	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018638	AGA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598920
23	NC_018638	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598920
24	NC_018638	AGG	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598920
25	NC_018638	TGT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598920
26	NC_018638	GTT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598920
27	NC_018638	TAT	2	6	2185	2190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598920
28	NC_018638	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598920
29	NC_018638	ACT	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598920
30	NC_018638	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598920
31	NC_018638	TCA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
32	NC_018638	GCT	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598921
33	NC_018638	TGA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598921
34	NC_018638	TAA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598921
35	NC_018638	CTG	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598921
36	NC_018638	TTG	2	6	2646	2651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598921
37	NC_018638	CTT	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598921
38	NC_018638	AGG	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598921
39	NC_018638	TCT	2	6	2870	2875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598921
40	NC_018638	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
41	NC_018638	TAC	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
42	NC_018638	GTT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598921
43	NC_018638	ACC	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598921
44	NC_018638	ATT	2	6	3244	3249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598922
45	NC_018638	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598923
46	NC_018638	ACC	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598923
47	NC_018638	GTT	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598923
48	NC_018638	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598923
49	NC_018638	ATG	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598923
50	NC_018638	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598923
51	NC_018638	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598923
52	NC_018638	CTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598923
53	NC_018638	TGG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598923
54	NC_018638	GCT	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598923
55	NC_018638	GTT	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598923
56	NC_018638	CAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018638	TGT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
58	NC_018638	TTG	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
59	NC_018638	CTT	2	6	4505	4510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
60	NC_018638	CTA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598924
61	NC_018638	ATG	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598924
62	NC_018638	TTC	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
63	NC_018638	CTT	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
64	NC_018638	CTT	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
65	NC_018638	TTG	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
66	NC_018638	GCT	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598924
67	NC_018638	TCT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
68	NC_018638	CTT	2	6	5473	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
69	NC_018638	GTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598925
70	NC_018638	CTA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598925
71	NC_018638	AAT	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
72	NC_018638	ACA	2	6	5668	5673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
73	NC_018638	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
74	NC_018638	AAG	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598925
75	NC_018638	GCA	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598925
76	NC_018638	AAC	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
77	NC_018638	ATA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
78	NC_018638	GAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598925
79	NC_018638	ATG	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598925
80	NC_018638	TCT	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
81	NC_018638	GTG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598925
82	NC_018638	AAC	3	9	6743	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
83	NC_018638	AAT	2	6	6766	6771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
84	NC_018638	TCT	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
85	NC_018638	ATT	2	6	6895	6900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018638	AAC	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018638	TCT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018638	AGT	2	6	7259	7264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018638	AGC	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018638	AAT	2	6	7346	7351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018638	TCA	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018638	TAT	2	6	7447	7452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018638	TTC	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018638	ACA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.