MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 plasmid pcpVS225

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018638	AGA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598919
2	NC_018638	ATA	3	9	690	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
3	NC_018638	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598919
4	NC_018638	AAC	2	6	985	990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598919
5	NC_018638	TAA	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
6	NC_018638	TGC	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598919
7	NC_018638	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598919
8	NC_018638	GCT	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598919
9	NC_018638	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598919
10	NC_018638	TGG	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598919
11	NC_018638	AGA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598920
12	NC_018638	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598920
13	NC_018638	AGG	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598920
14	NC_018638	TGT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598920
15	NC_018638	GTT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598920
16	NC_018638	TAT	2	6	2185	2190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598920
17	NC_018638	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598920
18	NC_018638	ACT	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598920
19	NC_018638	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598920
20	NC_018638	TCA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
21	NC_018638	GCT	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598921
22	NC_018638	TGA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598921
23	NC_018638	TAA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598921
24	NC_018638	CTG	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598921
25	NC_018638	TTG	2	6	2646	2651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598921
26	NC_018638	CTT	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598921
27	NC_018638	AGG	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598921
28	NC_018638	TCT	2	6	2870	2875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598921
29	NC_018638	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
30	NC_018638	TAC	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598921
31	NC_018638	GTT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598921
32	NC_018638	ACC	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598921
33	NC_018638	ATT	2	6	3244	3249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598922
34	NC_018638	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598923
35	NC_018638	ACC	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598923
36	NC_018638	GTT	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598923
37	NC_018638	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598923
38	NC_018638	ATG	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598923
39	NC_018638	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598923
40	NC_018638	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598923
41	NC_018638	CTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598923
42	NC_018638	TGG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598923
43	NC_018638	GCT	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598923
44	NC_018638	GTT	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598923
45	NC_018638	TGT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
46	NC_018638	TTG	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
47	NC_018638	CTT	2	6	4505	4510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
48	NC_018638	CTA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598924
49	NC_018638	ATG	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598924
50	NC_018638	TTC	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
51	NC_018638	CTT	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
52	NC_018638	CTT	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
53	NC_018638	TTG	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598924
54	NC_018638	GCT	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598924
55	NC_018638	TCT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598924
56	NC_018638	CTT	2	6	5473	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
57	NC_018638	GTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598925
58	NC_018638	CTA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598925
59	NC_018638	AAT	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
60	NC_018638	ACA	2	6	5668	5673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
61	NC_018638	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
62	NC_018638	AAG	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598925
63	NC_018638	GCA	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598925
64	NC_018638	AAC	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
65	NC_018638	ATA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
66	NC_018638	GAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598925
67	NC_018638	ATG	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598925
68	NC_018638	TCT	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925
69	NC_018638	GTG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598925
70	NC_018638	AAC	3	9	6743	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598925
71	NC_018638	AAT	2	6	6766	6771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598925
72	NC_018638	TCT	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.