MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci VS225 plasmid pcpVS225

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018638	GT	3	6	56	61	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018638	CA	3	6	215	220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018638	TA	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018638	CT	3	6	750	755	0 %	50 %	0 %	50 %	406598919
5	NC_018638	CT	3	6	993	998	0 %	50 %	0 %	50 %	406598919
6	NC_018638	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	406598919
7	NC_018638	AT	3	6	1265	1270	50 %	50 %	0 %	0 %	406598919
8	NC_018638	AC	3	6	1776	1781	50 %	0 %	0 %	50 %	406598920
9	NC_018638	AT	4	8	1912	1919	50 %	50 %	0 %	0 %	406598920
10	NC_018638	TC	3	6	2107	2112	0 %	50 %	0 %	50 %	406598920
11	NC_018638	AC	3	6	2707	2712	50 %	0 %	0 %	50 %	406598921
12	NC_018638	TC	3	6	3486	3491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018638	AT	3	6	3549	3554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018638	AT	3	6	3613	3618	50 %	50 %	0 %	0 %	406598923
15	NC_018638	AG	3	6	3705	3710	50 %	0 %	50 %	0 %	406598923
16	NC_018638	AT	3	6	4627	4632	50 %	50 %	0 %	0 %	406598924
17	NC_018638	GA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	50 %	0 %	406598924
18	NC_018638	TC	3	6	6047	6052	0 %	50 %	0 %	50 %	406598925
19	NC_018638	AT	3	6	6673	6678	50 %	50 %	0 %	0 %	406598925
20	NC_018638	AT	3	6	6694	6699	50 %	50 %	0 %	0 %	406598925
21	NC_018638	TG	4	8	6940	6947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018638	GT	3	6	7263	7268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018638	TA	3	6	7305	7310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.