MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci MN plasmid pcpMN

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018636	GGT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018636	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018636	GGT	2	6	50	55	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598902
4	NC_018636	GGT	2	6	72	77	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598902
5	NC_018636	CAC	3	9	157	165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598902
6	NC_018636	ATT	2	6	174	179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598903
7	NC_018636	AGC	2	6	195	200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598903
8	NC_018636	TAG	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598903
9	NC_018636	TGT	2	6	316	321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598903
10	NC_018636	AGC	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598903
11	NC_018636	TTA	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598903
12	NC_018636	GTT	2	6	558	563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598903
13	NC_018636	ACA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598903
14	NC_018636	TAT	3	9	850	858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598903
15	NC_018636	TCT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598903
16	NC_018636	GAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018636	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018636	TAG	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598904
19	NC_018636	TAA	2	6	1469	1474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598904
20	NC_018636	TTG	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598904
21	NC_018636	TGT	2	6	1548	1553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598904
22	NC_018636	GAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598904
23	NC_018636	ATA	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598904
24	NC_018636	TGA	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598904
25	NC_018636	ATT	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598904
26	NC_018636	TGC	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598904
27	NC_018636	TGT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598904
28	NC_018636	AGA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598904
29	NC_018636	GTT	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598904
30	NC_018636	AAT	2	6	2201	2206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018636	GAA	3	9	2275	2283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598905
32	NC_018636	ATT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598905
33	NC_018636	TGT	3	9	2349	2357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598905
34	NC_018636	CAC	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598905
35	NC_018636	AGA	2	6	2479	2484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598905
36	NC_018636	ATC	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598905
37	NC_018636	TTC	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598905
38	NC_018636	TGT	2	6	2919	2924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598905
39	NC_018636	TGC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598905
40	NC_018636	CTT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598905
41	NC_018636	AGA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598905
42	NC_018636	TGT	2	6	3428	3433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598905
43	NC_018636	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598905
44	NC_018636	TAG	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598905
45	NC_018636	CAA	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598905
46	NC_018636	AAG	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598905
47	NC_018636	AGA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018636	AGC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018636	CAA	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018636	AAG	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018636	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018636	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018636	TCA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018636	TAG	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018636	CAA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018636	CAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018636	TTG	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018636	CAA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598906
59	NC_018636	CAG	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598906
60	NC_018636	CCA	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598906
61	NC_018636	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598906
62	NC_018636	AAT	2	6	5050	5055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598906
63	NC_018636	CTG	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598906
64	NC_018636	CAT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598906
65	NC_018636	TCA	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598906
66	NC_018636	ACA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598906
67	NC_018636	TGG	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598906
68	NC_018636	GTG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598906
69	NC_018636	ACA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598906
70	NC_018636	TAA	2	6	5522	5527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598906
71	NC_018636	ATA	2	6	5851	5856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598907
72	NC_018636	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018636	AAC	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018636	GTA	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018636	GAT	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018636	AGA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018636	AGA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018636	ATG	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018636	CCT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018636	AAG	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018636	CAA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018636	CAA	2	6	6513	6518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018636	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018636	TTA	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018636	ATC	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018636	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018636	AGC	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018636	TGA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018636	AAG	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598908
90	NC_018636	TAG	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598908
91	NC_018636	GAA	2	6	6904	6909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598908
92	NC_018636	ACA	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598908
93	NC_018636	ACA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598908
94	NC_018636	CCT	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406598908
95	NC_018636	TCT	2	6	7303	7308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598908
96	NC_018636	TCT	2	6	7387	7392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598908
97	NC_018636	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.