MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN plasmid pcpMN

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018636	GGT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018636	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018636	GAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018636	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018636	AAT	2	6	2201	2206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018636	AGA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018636	AGC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018636	CAA	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018636	AAG	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018636	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018636	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018636	TCA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018636	TAG	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018636	CAA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018636	CAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018636	TTG	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018636	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018636	AAC	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018636	GTA	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018636	GAT	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018636	AGA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018636	AGA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018636	ATG	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018636	CCT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018636	AAG	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018636	CAA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018636	CAA	2	6	6513	6518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018636	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018636	TTA	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018636	ATC	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018636	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018636	AGC	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018636	TGA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018636	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.