MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci M56 plasmid pcpM56

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018635	TGAT	2	8	526	533	25 %	50 %	25 %	0 %	406598893
2	NC_018635	TTCT	2	8	1129	1136	0 %	75 %	0 %	25 %	406598893
3	NC_018635	AGTA	2	8	1979	1986	50 %	25 %	25 %	0 %	406598894
4	NC_018635	TTTC	2	8	2414	2421	0 %	75 %	0 %	25 %	406598895
5	NC_018635	TATG	2	8	2745	2752	25 %	50 %	25 %	0 %	406598895
6	NC_018635	TAAG	2	8	3135	3142	50 %	25 %	25 %	0 %	406598896
7	NC_018635	TCAT	2	8	3299	3306	25 %	50 %	0 %	25 %	406598896
8	NC_018635	TTAA	2	8	3378	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018635	TTTG	2	8	3408	3415	0 %	75 %	25 %	0 %	406598897
10	NC_018635	AACA	2	8	3580	3587	75 %	0 %	0 %	25 %	406598897
11	NC_018635	TAAA	2	8	3790	3797	75 %	25 %	0 %	0 %	406598897
12	NC_018635	TGTT	2	8	4259	4266	0 %	75 %	25 %	0 %	406598898
13	NC_018635	TAAA	2	8	4317	4324	75 %	25 %	0 %	0 %	406598898
14	NC_018635	GTTT	2	8	4367	4374	0 %	75 %	25 %	0 %	406598898
15	NC_018635	ATTC	2	8	4937	4944	25 %	50 %	0 %	25 %	406598898
16	NC_018635	ATAA	2	8	5057	5064	75 %	25 %	0 %	0 %	406598898
17	NC_018635	AATC	2	8	6076	6083	50 %	25 %	0 %	25 %	406598899
18	NC_018635	TTTC	2	8	6852	6859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018635	AGAA	2	8	6983	6990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018635	CTAA	2	8	7137	7144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018635	GAAA	2	8	7500	7507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.