MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci M56 plasmid pcpM56

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018635	TCG	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018635	AAT	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018635	ATC	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018635	AGA	2	6	378	383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598893
5	NC_018635	ATA	3	9	513	521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598893
6	NC_018635	TGT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598893
7	NC_018635	AAC	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598893
8	NC_018635	TAA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598893
9	NC_018635	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598893
10	NC_018635	CTA	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598893
11	NC_018635	GCT	2	6	1171	1176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598893
12	NC_018635	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598893
13	NC_018635	TGG	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598893
14	NC_018635	ACC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018635	ACC	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018635	ACC	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018635	ACC	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018635	TTC	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018635	CTG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018635	AGA	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598894
21	NC_018635	AGG	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598894
22	NC_018635	TGT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598894
23	NC_018635	TGT	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598894
24	NC_018635	TAT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598894
25	NC_018635	TTC	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598894
26	NC_018635	ACT	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598894
27	NC_018635	CTT	2	6	2170	2175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598894
28	NC_018635	TCA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598895
29	NC_018635	GCT	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598895
30	NC_018635	TGA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598895
31	NC_018635	TAA	2	6	2311	2316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598895
32	NC_018635	CTG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598895
33	NC_018635	TTG	2	6	2469	2474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598895
34	NC_018635	CTT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598895
35	NC_018635	AGG	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598895
36	NC_018635	ATC	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598895
37	NC_018635	TAC	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598895
38	NC_018635	GTT	2	6	2918	2923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598895
39	NC_018635	ACC	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598895
40	NC_018635	ATT	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598896
41	NC_018635	TTA	2	6	3398	3403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598897
42	NC_018635	ACC	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598897
43	NC_018635	GTT	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598897
44	NC_018635	TGA	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598897
45	NC_018635	ATG	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598897
46	NC_018635	CAG	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598897
47	NC_018635	ATT	2	6	3870	3875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598897
48	NC_018635	CTT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598897
49	NC_018635	TGG	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598897
50	NC_018635	GCT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598897
51	NC_018635	GTT	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598897
52	NC_018635	AAT	2	6	4246	4251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598898
53	NC_018635	TTG	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598898
54	NC_018635	CTT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598898
55	NC_018635	CTA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598898
56	NC_018635	ATG	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598898
57	NC_018635	TTC	2	6	4737	4742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598898
58	NC_018635	CTT	2	6	4832	4837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598898
59	NC_018635	CTT	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598898
60	NC_018635	GCC	2	6	4929	4934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598898
61	NC_018635	TTG	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598898
62	NC_018635	GCT	2	6	5116	5121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598898
63	NC_018635	TCT	2	6	5209	5214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598898
64	NC_018635	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598899
65	NC_018635	GTT	2	6	5343	5348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598899
66	NC_018635	CTA	2	6	5377	5382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598899
67	NC_018635	AAT	2	6	5416	5421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598899
68	NC_018635	ACA	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598899
69	NC_018635	TCT	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598899
70	NC_018635	AAG	2	6	5754	5759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598899
71	NC_018635	AAG	2	6	5842	5847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598899
72	NC_018635	GCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598899
73	NC_018635	AAC	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598899
74	NC_018635	ATA	2	6	6019	6024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598899
75	NC_018635	GAA	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598899
76	NC_018635	ATG	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598899
77	NC_018635	TCT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598899
78	NC_018635	GTG	2	6	6545	6550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598899
79	NC_018635	AAC	3	9	6566	6574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598899
80	NC_018635	AAT	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598899
81	NC_018635	TCT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598899
82	NC_018635	TCA	2	6	6658	6663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598899
83	NC_018635	AAT	2	6	6726	6731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018635	AAC	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018635	TCT	2	6	6930	6935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018635	AGT	2	6	7082	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018635	AGC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018635	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018635	TCA	2	6	7193	7198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018635	TAT	2	6	7270	7275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018635	ACA	2	6	7371	7376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018635	ACA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018635	ATT	2	6	7449	7454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.