MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci CP3 plasmid pcpCP3

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018634	AT	3	6	190	195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018634	TC	3	6	1111	1116	0 %	50 %	0 %	50 %	406598884
3	NC_018634	AT	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	406598884
4	NC_018634	AT	3	6	1268	1273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018634	GA	3	6	1330	1335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018634	TG	3	6	2108	2113	0 %	50 %	50 %	0 %	406598886
7	NC_018634	GA	3	6	2709	2714	50 %	0 %	50 %	0 %	406598887
8	NC_018634	GT	3	6	3040	3045	0 %	50 %	50 %	0 %	406598887
9	NC_018634	AT	3	6	3551	3556	50 %	50 %	0 %	0 %	406598888
10	NC_018634	TA	3	6	3691	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	406598888
11	NC_018634	AG	3	6	3823	3828	50 %	0 %	50 %	0 %	406598888
12	NC_018634	AG	3	6	4066	4071	50 %	0 %	50 %	0 %	406598888
13	NC_018634	TA	3	6	4351	4356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018634	TG	3	6	4601	4606	0 %	50 %	50 %	0 %	406598889
15	NC_018634	AC	3	6	4760	4765	50 %	0 %	0 %	50 %	406598889
16	NC_018634	AT	3	6	5063	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	406598889
17	NC_018634	AC	3	6	5106	5111	50 %	0 %	0 %	50 %	406598889
18	NC_018634	CA	4	8	5427	5434	50 %	0 %	0 %	50 %	406598889
19	NC_018634	AT	3	6	5675	5680	50 %	50 %	0 %	0 %	406598890
20	NC_018634	AT	3	6	5696	5701	50 %	50 %	0 %	0 %	406598890
21	NC_018634	AG	3	6	6321	6326	50 %	0 %	50 %	0 %	406598890
22	NC_018634	TC	3	6	7387	7392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.