MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 plasmid pcp8455

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018633	TCTG	2	8	232	239	0 %	50 %	25 %	25 %	406598877
2	NC_018633	AGTA	2	8	603	610	50 %	25 %	25 %	0 %	406598877
3	NC_018633	TTTC	2	8	1038	1045	0 %	75 %	0 %	25 %	406598876
4	NC_018633	ATAC	2	8	1227	1234	50 %	25 %	0 %	25 %	406598876
5	NC_018633	TATG	2	8	1369	1376	25 %	50 %	25 %	0 %	406598876
6	NC_018633	TAAG	2	8	1759	1766	50 %	25 %	25 %	0 %	406598881
7	NC_018633	TCAT	2	8	1923	1930	25 %	50 %	0 %	25 %	406598881
8	NC_018633	TTTG	2	8	2032	2039	0 %	75 %	25 %	0 %	406598880
9	NC_018633	AACA	2	8	2204	2211	75 %	0 %	0 %	25 %	406598880
10	NC_018633	TAAA	2	8	2414	2421	75 %	25 %	0 %	0 %	406598880
11	NC_018633	TAAA	2	8	2941	2948	75 %	25 %	0 %	0 %	406598878
12	NC_018633	GTTT	2	8	2991	2998	0 %	75 %	25 %	0 %	406598878
13	NC_018633	ATAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	406598878
14	NC_018633	AATC	2	8	4700	4707	50 %	25 %	0 %	25 %	406598882
15	NC_018633	TTTC	2	8	5476	5483	0 %	75 %	0 %	25 %	406598879
16	NC_018633	AGAA	2	8	5607	5614	75 %	0 %	25 %	0 %	406598879
17	NC_018633	CTAA	2	8	5761	5768	50 %	25 %	0 %	25 %	406598879
18	NC_018633	GAAA	2	8	6124	6131	75 %	0 %	25 %	0 %	406598879
19	NC_018633	TGAT	2	8	6703	6710	25 %	50 %	25 %	0 %	406598875
20	NC_018633	TTCT	2	8	7306	7313	0 %	75 %	0 %	25 %	406598875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.