MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 plasmid pcp8455

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018633	AGA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598877
2	NC_018633	AGA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598877
3	NC_018633	AGG	2	6	252	257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598877
4	NC_018633	TGT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598877
5	NC_018633	GTT	2	6	575	580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598877
6	NC_018633	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598877
7	NC_018633	TTC	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598877
8	NC_018633	ACT	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598877
9	NC_018633	CTT	2	6	794	799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598877
10	NC_018633	TCA	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598876
11	NC_018633	GCT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598876
12	NC_018633	TGA	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598876
13	NC_018633	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598876
14	NC_018633	CTG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598876
15	NC_018633	TTG	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598876
16	NC_018633	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598876
17	NC_018633	AGG	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598876
18	NC_018633	TCT	2	6	1317	1322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598876
19	NC_018633	ATC	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598876
20	NC_018633	TAC	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598876
21	NC_018633	GTT	2	6	1542	1547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598876
22	NC_018633	ACC	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598876
23	NC_018633	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598881
24	NC_018633	TTA	2	6	2022	2027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598880
25	NC_018633	ACC	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598880
26	NC_018633	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598880
27	NC_018633	TGA	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598880
28	NC_018633	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598880
29	NC_018633	CAG	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598880
30	NC_018633	ATT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598880
31	NC_018633	CTT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598880
32	NC_018633	TGG	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598880
33	NC_018633	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598880
34	NC_018633	GTT	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598880
35	NC_018633	TGT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598878
36	NC_018633	TTG	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598878
37	NC_018633	CTT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598878
38	NC_018633	CTA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598878
39	NC_018633	ATG	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598878
40	NC_018633	TTC	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598878
41	NC_018633	CTT	2	6	3456	3461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598878
42	NC_018633	CTT	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598878
43	NC_018633	TTG	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598878
44	NC_018633	GCT	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598878
45	NC_018633	TCT	2	6	3833	3838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598878
46	NC_018633	CTT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598882
47	NC_018633	GTT	2	6	3967	3972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598882
48	NC_018633	CTA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598882
49	NC_018633	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598882
50	NC_018633	ACA	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598882
51	NC_018633	TCT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598882
52	NC_018633	AAG	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598882
53	NC_018633	GCA	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598882
54	NC_018633	AAC	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598882
55	NC_018633	ATA	2	6	4643	4648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598882
56	NC_018633	GAA	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598882
57	NC_018633	ATG	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598882
58	NC_018633	TCT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598882
59	NC_018633	GTG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598882
60	NC_018633	AAC	3	9	5190	5198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598882
61	NC_018633	AAT	2	6	5213	5218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598882
62	NC_018633	TCT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598882
63	NC_018633	AAC	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598879
64	NC_018633	TCT	2	6	5554	5559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598879
65	NC_018633	AGT	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598879
66	NC_018633	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598879
67	NC_018633	AAT	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598879
68	NC_018633	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598879
69	NC_018633	TAT	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598879
70	NC_018633	TTC	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598879
71	NC_018633	ACA	2	6	5995	6000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598879
72	NC_018633	ACA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598879
73	NC_018633	ATT	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598879
74	NC_018633	CTA	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598879
75	NC_018633	AGA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598875
76	NC_018633	ATA	3	9	6690	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598875
77	NC_018633	TGT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598875
78	NC_018633	AAC	2	6	6985	6990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598875
79	NC_018633	TAA	2	6	7082	7087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598875
80	NC_018633	TGC	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598875
81	NC_018633	CTA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598875
82	NC_018633	GCT	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598875
83	NC_018633	AAT	2	6	7369	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598875
84	NC_018633	TGG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.