MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018631	TACTAT	2	12	11775	11786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018631	ATTTTT	2	12	30910	30921	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018631	AGCTAA	2	12	66755	66766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018631	TAATCA	2	12	67248	67259	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018631	TTTGCT	2	12	75432	75443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018631	TAAATG	2	12	123574	123585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018631	TAAATT	2	12	156538	156549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018631	CATAGT	2	12	164652	164663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018631	AATAGA	2	12	218896	218907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018631	CTTTTG	2	12	229932	229943	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018631	GTTTAT	2	12	232628	232639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018631	AATAAA	2	12	254974	254985	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018631	ATCATT	2	12	276132	276143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018631	AGTGAA	2	12	284461	284472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018631	TTAAAA	2	12	329814	329825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018631	ATTTTA	2	12	379356	379367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018631	AAAAAT	2	12	379377	379388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018631	TATAAA	2	12	384876	384887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018631	TGTTAA	2	12	385063	385074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018631	CTAAAA	2	12	420684	420695	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018631	TTATTG	2	12	422692	422703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018631	AAATAA	2	12	428096	428107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018631	TAAAAA	2	12	461676	461687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018631	ATTTTA	2	12	503287	503298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018631	TAAAAA	2	12	511772	511783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018631	TCGTAT	2	12	586738	586749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018631	ATAACA	2	12	633840	633851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018631	TTATTT	2	12	637319	637330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018631	TAAAAC	2	12	753102	753113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018631	ACTAAT	2	12	786185	786196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018631	TTATAA	2	12	810004	810015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018631	TATTTT	2	12	819087	819098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018631	TAAAAA	2	12	838065	838076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018631	GTATTT	2	12	857140	857151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018631	TAAAAA	2	12	866754	866765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018631	AATAGC	2	12	939127	939138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018631	AAAATC	4	24	956182	956205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018631	AACCAA	2	12	959396	959407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018631	TTTATA	2	12	960995	961006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018631	AAAATA	2	12	994012	994023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018631	TACTAT	2	12	1015795	1015806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018631	AGTGTT	2	12	1030576	1030587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018631	TGTTAA	2	12	1051909	1051920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018631	ATTTCA	2	12	1055465	1055476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018631	ACTTCA	2	12	1067446	1067457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018631	ACTTCA	2	12	1093855	1093866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018631	GGTTAG	2	12	1108277	1108288	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018631	TTTTAA	2	12	1120744	1120755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018631	TAAAAT	2	12	1142116	1142127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018631	GGTTCA	2	12	1162843	1162854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018631	TAATTT	2	12	1164805	1164816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018631	AAAAAC	2	12	1285732	1285743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018631	TTATAA	2	12	1287120	1287131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018631	TTAAAT	2	12	1291932	1291943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018631	GAAAAA	2	12	1301844	1301855	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018631	TTTTAT	2	12	1302114	1302125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018631	ACCTAA	2	12	1321157	1321168	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018631	CAAAAT	2	12	1434970	1434981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018631	TATTTT	2	12	1435015	1435026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018631	AATTTA	2	12	1453507	1453518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018631	AAAATG	2	12	1517726	1517737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018631	TAATTG	2	12	1655997	1656008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018631	TCAAAA	2	12	1678579	1678590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018631	TGATTT	2	12	1683191	1683202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018631	CATATT	2	12	1727335	1727346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018631	TTTAGG	2	12	1827434	1827445	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018631	TTTATA	2	12	1838236	1838247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018631	TTATTT	2	12	1851071	1851082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018631	GAGATT	2	12	1864660	1864671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018631	TGTTGG	2	12	1888299	1888310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.