MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018631	TACAA	2	10	2790	2799	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018631	GTGAA	2	10	9766	9775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018631	ATTAA	2	10	15341	15350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018631	CATGT	2	10	16656	16665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018631	GCGTT	2	10	27862	27871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018631	TTATA	2	10	29108	29117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018631	AGCCC	2	10	29820	29829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018631	TACAA	2	10	30980	30989	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018631	GTGTT	2	10	31582	31591	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018631	AGTAT	2	10	32698	32707	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018631	TATAA	2	10	39308	39317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018631	TTTAT	2	10	39581	39590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018631	TAAAC	2	10	40624	40633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018631	ATCAA	2	10	51083	51092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018631	ATTAT	2	10	51378	51387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018631	AATTG	2	10	63283	63292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018631	GAAAT	2	10	65456	65465	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018631	ATTAA	2	10	65665	65674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018631	TGGCA	2	10	65687	65696	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018631	TATTT	2	10	66192	66201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018631	ACTAA	2	10	72030	72039	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018631	TGAAT	2	10	72748	72757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018631	TATCA	2	10	76150	76159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018631	AGTAA	2	10	84326	84335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018631	TTTAA	2	10	90466	90475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018631	TAGAT	2	10	96554	96563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018631	AGTAT	2	10	99481	99490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018631	TCATA	2	10	100016	100025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018631	ATCTC	2	10	100425	100434	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018631	CTGTG	2	10	107285	107294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018631	TTACA	2	10	113689	113698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018631	TGTAT	2	10	115031	115040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018631	ATAGA	2	10	119768	119777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018631	CATGC	2	10	122580	122589	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018631	GATAA	2	10	132144	132153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018631	TCTTA	2	10	147467	147476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018631	GAATT	2	10	148969	148978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018631	TATCA	2	10	166640	166649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018631	ATTAA	2	10	176513	176522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018631	TTAAT	2	10	197459	197468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018631	ATGTG	2	10	197580	197589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018631	ATGAC	2	10	198034	198043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018631	ATTAA	2	10	198126	198135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018631	TAAGT	2	10	198538	198547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018631	CTTAG	2	10	202361	202370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018631	AAATT	2	10	202434	202443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018631	AATAA	2	10	211644	211653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018631	TGTCA	2	10	211759	211768	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018631	TTTTA	2	10	211880	211889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018631	TATGT	2	10	218845	218854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018631	AATAA	2	10	235889	235898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018631	TACAA	2	10	241664	241673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018631	ATCTG	2	10	242742	242751	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018631	AAATG	2	10	243178	243187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018631	TTATT	2	10	245851	245860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018631	CCATA	2	10	246061	246070	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018631	ATTAA	2	10	255028	255037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018631	AATAA	2	10	255080	255089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018631	TGGTG	2	10	259741	259750	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018631	TCAAT	2	10	260126	260135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018631	ATAAA	2	10	265195	265204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018631	CAAAA	2	10	268183	268192	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018631	TAACA	2	10	273564	273573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018631	TATAA	2	10	302812	302821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018631	ATAAA	2	10	312636	312645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018631	ATATA	2	10	312680	312689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018631	AATTG	2	10	321032	321041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018631	TTACT	2	10	329852	329861	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018631	ATGAT	2	10	340790	340799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018631	GATTA	2	10	342932	342941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018631	ATAGT	2	10	350834	350843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018631	CACAA	2	10	351276	351285	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018631	TAAAT	2	10	359422	359431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018631	CAGGA	2	10	362427	362436	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018631	TTAAT	2	10	372664	372673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018631	TATAT	2	10	378002	378011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018631	ACATA	2	10	393852	393861	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018631	ATATT	2	10	399527	399536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018631	TATAA	2	10	409132	409141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018631	TTGAT	2	10	415110	415119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018631	TCTTT	2	10	415185	415194	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018631	ATTAA	2	10	423344	423353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018631	TGGTA	2	10	469292	469301	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018631	TGCTT	2	10	483525	483534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018631	AAATA	2	10	484410	484419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018631	TTTGT	2	10	499275	499284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018631	TTGGA	2	10	499418	499427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018631	TTTAA	2	10	501400	501409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018631	TTTTA	2	10	503356	503365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018631	AAATA	2	10	538503	538512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018631	ATAAA	2	10	543108	543117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018631	ATATA	2	10	564615	564624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018631	ATAAA	2	10	564725	564734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018631	ATTTA	2	10	566202	566211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018631	TGTAT	2	10	586669	586678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018631	CCATA	2	10	587039	587048	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018631	ATTTA	2	10	587055	587064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018631	ACATG	2	10	590657	590666	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018631	TGAAT	2	10	591818	591827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018631	ATACT	2	10	617279	617288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018631	ATAGA	2	10	629246	629255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018631	TTAAA	2	10	637260	637269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018631	TATAA	2	10	639477	639486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018631	TTTTG	2	10	639534	639543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018631	TACAT	2	10	652800	652809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018631	AAGAT	2	10	672487	672496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018631	TAAAC	2	10	689471	689480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018631	ATAAA	2	10	689602	689611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018631	AGAAA	2	10	695240	695249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018631	CCTTA	2	10	695342	695351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018631	TCTAT	2	10	702879	702888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018631	ATTAG	2	10	702988	702997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018631	ATTAA	2	10	703199	703208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018631	ATTTT	2	10	721852	721861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018631	ATTTT	2	10	732120	732129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018631	TGTTA	2	10	736036	736045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018631	GTTAT	2	10	742553	742562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018631	GTTTG	2	10	748413	748422	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018631	AATTT	2	10	751476	751485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018631	TAAAA	2	10	769870	769879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018631	TAATT	2	10	770851	770860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018631	TAGTT	2	10	770886	770895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018631	ACAAA	2	10	772247	772256	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018631	TTTCA	2	10	772712	772721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018631	TAAAA	2	10	784413	784422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018631	AGAAA	2	10	787292	787301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018631	GTAGT	2	10	787584	787593	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018631	AATTA	2	10	799819	799828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018631	AATTT	2	10	803417	803426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018631	ATTTT	2	10	805755	805764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018631	GTGAT	2	10	809942	809951	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018631	ATTAA	2	10	825609	825618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018631	TCTTT	2	10	827779	827788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018631	TATAA	2	10	831770	831779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018631	TCATT	2	10	837996	838005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018631	TATAA	2	10	841945	841954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018631	AATCA	2	10	849485	849494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018631	TCTAA	2	10	850073	850082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018631	GTATT	2	10	859377	859386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018631	GATAA	2	10	859764	859773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018631	CAATA	2	10	862959	862968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018631	ATTTA	2	10	863002	863011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018631	ATTAA	2	10	871547	871556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018631	AACAA	2	10	876115	876124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018631	ATAAA	2	10	876203	876212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018631	AAACT	2	10	876500	876509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018631	TAAAA	2	10	877630	877639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018631	GAAAA	2	10	886884	886893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_018631	TTAAC	2	10	1770483	1770492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_018631	GTTTA	2	10	1773984	1773993	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018631	CTATA	2	10	1776464	1776473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_018631	TATCA	2	10	1781634	1781643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_018631	CTTCT	2	10	1783326	1783335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018631	ATAAA	2	10	1784843	1784852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018631	ATTAT	2	10	1791943	1791952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018631	AACTA	2	10	1795119	1795128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_018631	TGCCA	2	10	1801284	1801293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_018631	CTTTT	2	10	1801614	1801623	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_018631	ATTTT	2	10	1801659	1801668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_018631	TTTAT	2	10	1804388	1804397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_018631	TCACT	2	10	1807953	1807962	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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306	NC_018631	AAAGC	2	10	1813924	1813933	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
307	NC_018631	GTATG	2	10	1827359	1827368	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
308	NC_018631	ATAAA	2	10	1837592	1837601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_018631	TATCT	2	10	1850317	1850326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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311	NC_018631	CAACA	2	10	1866785	1866794	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
312	NC_018631	ATCTC	2	10	1869014	1869023	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
313	NC_018631	CACGA	2	10	1872660	1872669	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
314	NC_018631	TGGTA	2	10	1873246	1873255	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
315	NC_018631	GCTTT	2	10	1887061	1887070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.