MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 27657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018631	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598990
2	NC_018631	ATT	2	6	130	135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598990
3	NC_018631	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598990
4	NC_018631	AGC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598990
5	NC_018631	TCA	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
6	NC_018631	TGT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
7	NC_018631	GGT	2	6	445	450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598990
8	NC_018631	ACA	2	6	505	510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598990
9	NC_018631	CAG	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598990
10	NC_018631	TGT	2	6	629	634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
11	NC_018631	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598990
12	NC_018631	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598990
13	NC_018631	ATC	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
14	NC_018631	TTG	2	6	761	766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598990
15	NC_018631	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598990
16	NC_018631	ACT	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598990
17	NC_018631	TGA	2	6	1110	1115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598990
18	NC_018631	TGG	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598990
19	NC_018631	ATA	2	6	1364	1369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018631	TTA	3	9	1457	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018631	CTA	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018631	ATG	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
23	NC_018631	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598991
24	NC_018631	AAG	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
25	NC_018631	AAC	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598991
26	NC_018631	CTG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598991
27	NC_018631	GAT	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
28	NC_018631	GCA	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598991
29	NC_018631	TTG	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598991
30	NC_018631	ATT	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598991
31	NC_018631	AGC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598991
32	NC_018631	TAC	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598991
33	NC_018631	GTT	2	6	2259	2264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598991
34	NC_018631	TTA	2	6	2341	2346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598991
35	NC_018631	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
36	NC_018631	AAG	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598991
37	NC_018631	GAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598991
38	NC_018631	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598992
39	NC_018631	ATT	2	6	2877	2882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598992
40	NC_018631	TCT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598992
41	NC_018631	GGT	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
42	NC_018631	TGA	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598992
43	NC_018631	GCA	3	9	3045	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598992
44	NC_018631	AAG	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598992
45	NC_018631	TGC	4	12	3074	3085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598992
46	NC_018631	GCT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598992
47	NC_018631	GGT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
48	NC_018631	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
49	NC_018631	GTG	2	6	3226	3231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598992
50	NC_018631	AGT	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
51	NC_018631	AAG	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598993
52	NC_018631	CGG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406598993
53	NC_018631	TGC	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598993
54	NC_018631	CAA	2	6	4004	4009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
55	NC_018631	GAT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
56	NC_018631	CAA	2	6	4112	4117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
57	NC_018631	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
58	NC_018631	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598993
59	NC_018631	CAA	2	6	4343	4348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598993
60	NC_018631	AGA	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598993
61	NC_018631	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
62	NC_018631	TGA	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
63	NC_018631	ACT	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598994
64	NC_018631	TTG	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
65	NC_018631	TGA	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
66	NC_018631	TGA	2	6	4709	4714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
67	NC_018631	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
68	NC_018631	TGG	3	9	4805	4813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
69	NC_018631	ACA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598994
70	NC_018631	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
71	NC_018631	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598994
72	NC_018631	GGT	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598994
73	NC_018631	ATG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
74	NC_018631	TTG	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
75	NC_018631	GCT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598994
76	NC_018631	GTT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598994
77	NC_018631	GAA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
78	NC_018631	TGA	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
79	NC_018631	TTA	2	6	5980	5985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598994
80	NC_018631	ACC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598994
81	NC_018631	TGA	2	6	6152	6157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
82	NC_018631	ACA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598994
83	NC_018631	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598994
84	NC_018631	TGA	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598994
85	NC_018631	CAC	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598994
86	NC_018631	GAA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598994
87	NC_018631	ATG	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018631	CAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
89	NC_018631	TCG	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
90	NC_018631	TTG	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
91	NC_018631	ATC	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
92	NC_018631	TTG	2	6	6832	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
93	NC_018631	TGC	3	9	6875	6883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
94	NC_018631	ATG	2	6	6973	6978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
95	NC_018631	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
96	NC_018631	CAA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598995
97	NC_018631	TGA	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
98	NC_018631	ATT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
99	NC_018631	TGA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
100	NC_018631	TGG	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598995
101	NC_018631	TCG	3	9	7610	7618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
102	NC_018631	TGA	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
103	NC_018631	CAT	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
104	NC_018631	TCA	2	6	7719	7724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
105	NC_018631	AGA	2	6	7733	7738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
106	NC_018631	GAA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
107	NC_018631	ATG	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
108	NC_018631	CGT	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
109	NC_018631	GAA	3	9	8028	8036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
110	NC_018631	GTG	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598995
111	NC_018631	TTG	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
112	NC_018631	CAA	2	6	8207	8212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598995
113	NC_018631	GTT	2	6	8280	8285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
114	NC_018631	TGA	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
115	NC_018631	TTA	2	6	8326	8331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
116	NC_018631	GTG	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598995
117	NC_018631	ATT	2	6	8362	8367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
118	NC_018631	GTT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
119	NC_018631	TGA	4	12	8462	8473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
120	NC_018631	TAT	2	6	8510	8515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
121	NC_018631	GAA	2	6	8553	8558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
122	NC_018631	TGC	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598995
123	NC_018631	TGT	2	6	8639	8644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
124	NC_018631	GTG	2	6	8728	8733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598995
125	NC_018631	TGA	2	6	8804	8809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598995
126	NC_018631	TAC	2	6	8852	8857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598995
127	NC_018631	TTG	2	6	8965	8970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598995
128	NC_018631	AGA	2	6	8981	8986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598995
129	NC_018631	CAG	2	6	9015	9020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598995
130	NC_018631	ATT	2	6	9038	9043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598995
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256	NC_018631	AGC	2	6	15851	15856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_018631	TGA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018631	CAG	2	6	15925	15930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_018631	TGT	2	6	16073	16078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018631	GTT	2	6	19061	19066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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