MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475458
2	NC_018630	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
3	NC_018630	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475463
4	NC_018630	TGCTTA	2	12	7714	7725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410475463
5	NC_018630	GCTAAC	2	12	7955	7966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410475463
6	NC_018630	TTGATT	2	12	8889	8900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410475465
7	NC_018630	TAAGGA	2	12	16895	16906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018630	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018630	GATAGA	2	12	20602	20613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475472
11	NC_018630	AGTTGA	2	12	21912	21923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475475
12	NC_018630	TTCTTG	2	12	25309	25320	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410475478
13	NC_018630	ACTTTT	2	12	25378	25389	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410475478
14	NC_018630	TTCAGT	2	12	25900	25911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410475479
15	NC_018630	AAATAA	2	12	28270	28281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410475486
16	NC_018630	ATTGAG	2	12	34734	34745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475503
17	NC_018630	GTAAAC	2	12	34879	34890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018630	AAAACA	2	12	36731	36742	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018630	TCATCT	2	12	39524	39535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410475512
20	NC_018630	ATCCAG	2	12	41168	41179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410475514
21	NC_018630	TCCTGA	2	12	41772	41783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410475514
22	NC_018630	ATGGAA	2	12	46046	46057	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475523
23	NC_018630	CGAAGT	2	12	46751	46762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410475524
24	NC_018630	ATTACT	2	12	49086	49097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410475524
25	NC_018630	ATTTGG	2	12	53027	53038	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410475526
26	NC_018630	AGGTTG	2	12	54747	54758	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475527
27	NC_018630	CGGTAG	2	12	56090	56101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410475528
28	NC_018630	CAGGCT	2	12	58821	58832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018630	TAAAAA	2	12	59031	59042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018630	AGGTTG	2	12	61541	61552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475539
31	NC_018630	TTGTTT	2	12	63754	63765	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018630	CGATTG	2	12	67774	67785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475544
33	NC_018630	TTCCTT	2	12	71099	71110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475547
34	NC_018630	TAAAAA	2	12	75363	75374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018630	AGGATA	2	12	76640	76651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475556
36	NC_018630	TCAATC	2	12	77969	77980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475556
37	NC_018630	TTACTG	2	12	88352	88363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410475563
38	NC_018630	AAAAAT	2	12	91512	91523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410475566
39	NC_018630	GTTTCT	2	12	98653	98664	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410475571
40	NC_018630	TTCTAT	2	12	99089	99100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018630	TTCCTT	2	12	99731	99742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475572
42	NC_018630	TTGCAG	2	12	103884	103895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475576
43	NC_018630	TCCCAT	2	12	104943	104954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018630	TCTTGC	2	12	105463	105474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410475578
45	NC_018630	GACTTG	2	12	105867	105878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475578
46	NC_018630	TAAAAT	2	12	107321	107332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018630	ACATCA	2	12	115526	115537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018630	GCTTGC	2	12	118995	119006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018630	TACAGG	2	12	121220	121231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410475594
50	NC_018630	AAAAAC	2	12	121321	121332	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410475594
51	NC_018630	TAAAAA	2	12	125030	125041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018630	TTTTGA	2	12	128242	128253	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410475602
53	NC_018630	AAGCAG	2	12	128770	128781	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410475602
54	NC_018630	AAAGGA	2	12	133736	133747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475608
55	NC_018630	AGACTT	2	12	144659	144670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475620
56	NC_018630	GCTTAT	2	12	145707	145718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018630	TTATCT	2	12	149353	149364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018630	TTTTAT	2	12	150622	150633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410475629
59	NC_018630	TAACAA	2	12	151117	151128	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410475629
60	NC_018630	ATAAAA	2	12	153927	153938	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410475634
61	NC_018630	CTCCAG	2	12	155301	155312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410475635
62	NC_018630	TTTGCT	2	12	162933	162944	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018630	ATAAAA	2	12	163312	163323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018630	ATAAAT	2	12	168225	168236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475649
65	NC_018630	GAAGCA	2	12	176262	176273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410475658
66	NC_018630	GTTTTA	2	12	179412	179423	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410475662
67	NC_018630	TCAGGT	2	12	189579	189590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475672
68	NC_018630	ATTGAG	2	12	196059	196070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475679
69	NC_018630	TTCGGA	2	12	196189	196200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475679
70	NC_018630	AACAAG	2	12	199812	199823	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410475682
71	NC_018630	GGATTG	2	12	201541	201552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475684
72	NC_018630	TGCACT	2	12	205306	205317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410475689
73	NC_018630	CAATAT	2	12	206786	206797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410475690
74	NC_018630	TTCCAT	2	12	208115	208126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410475691
75	NC_018630	ACTTGG	2	12	208374	208385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475691
76	NC_018630	ACCACG	2	12	212911	212922	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410475697
77	NC_018630	GCAGAC	2	12	213770	213781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475698
78	NC_018630	TTTTAC	2	12	215332	215343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018630	ACAAGA	2	12	221229	221240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410475704
80	NC_018630	CAGGAA	2	12	221433	221444	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410475705
81	NC_018630	TAAAGG	2	12	224110	224121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475709
82	NC_018630	GCAATC	2	12	226698	226709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410475714
83	NC_018630	ACATCA	2	12	227245	227256	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410475715
84	NC_018630	TAAAGG	2	12	231496	231507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475724
85	NC_018630	AAATTA	2	12	232535	232546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475727
86	NC_018630	ACTTGG	2	12	232602	232613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475727
87	NC_018630	TTGAAG	2	12	235543	235554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475731
88	NC_018630	GTAAAG	2	12	236226	236237	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475732
89	NC_018630	AAACTC	2	12	237601	237612	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410475734
90	NC_018630	AGATAA	2	12	241703	241714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410475739
91	NC_018630	CATAAT	2	12	243757	243768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410475741
92	NC_018630	TATCTG	2	12	249232	249243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410475749
93	NC_018630	ACAATT	2	12	251352	251363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410475750
94	NC_018630	CCAATC	2	12	256332	256343	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410475753
95	NC_018630	CGAAAT	2	12	257363	257374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410475753
96	NC_018630	TCTTAA	2	12	259519	259530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018630	TGTCAA	2	12	266136	266147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475761
98	NC_018630	GATGGT	2	12	266896	266907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475762
99	NC_018630	TGCCTT	2	12	268548	268559	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410475763
100	NC_018630	GTTGCT	2	12	273140	273151	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410475766
101	NC_018630	GGTTGC	2	12	276454	276465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018630	GCAAGA	2	12	276986	276997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410475769
103	NC_018630	ATTCGA	2	12	278384	278395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475769
104	NC_018630	GTCAGT	2	12	281789	281800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410475770
105	NC_018630	AAAATA	2	12	284204	284215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410475773
106	NC_018630	CGATAC	2	12	292080	292091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410475781
107	NC_018630	TCTTTT	2	12	295852	295863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018630	TTTTGG	2	12	296374	296385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475786
109	NC_018630	TCTTGT	2	12	301754	301765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410475793
110	NC_018630	GAATTA	2	12	302262	302273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410475794
111	NC_018630	AAAAGG	2	12	304389	304400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475797
112	NC_018630	TATTCC	2	12	304572	304583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410475797
113	NC_018630	TAGATA	2	12	309400	309411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410475802
114	NC_018630	GATAAA	2	12	314748	314759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410475805
115	NC_018630	AAAATG	2	12	318559	318570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410475808
116	NC_018630	AGAGGA	2	12	321132	321143	50 %	0 %	50 %	0 %	410475811
117	NC_018630	ATGGAG	2	12	321565	321576	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410475812
118	NC_018630	GGACAA	2	12	322432	322443	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410475813
119	NC_018630	CCATAG	2	12	325895	325906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410475817
120	NC_018630	TTGATT	2	12	326338	326349	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410475817
121	NC_018630	AGGAGT	2	12	328084	328095	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410475819
122	NC_018630	AGCGTG	2	12	329718	329729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410475823
123	NC_018630	AACTGT	2	12	332262	332273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475825
124	NC_018630	GAAAAA	2	12	334377	334388	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018630	CAACCT	2	12	339322	339333	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410475830
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127	NC_018630	AGTTGA	2	12	342700	342711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475834
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144	NC_018630	GCAGTT	2	12	379704	379715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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229	NC_018630	AAGGAA	2	12	592808	592819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410476088
230	NC_018630	CAGCTA	2	12	594485	594496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410476091
231	NC_018630	CTGTAA	2	12	595580	595591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
232	NC_018630	AAAGTT	2	12	600608	600619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
233	NC_018630	TAAAGA	2	12	601065	601076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410476099
234	NC_018630	CAAAAA	2	12	603354	603365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410476099
235	NC_018630	AGGAGA	2	12	605364	605375	50 %	0 %	50 %	0 %	410476099
236	NC_018630	ATCTAA	2	12	605928	605939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410476099
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340	NC_018630	ATGGGA	2	12	834989	835000	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410476336
341	NC_018630	TGATAT	3	18	835117	835134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410476336
342	NC_018630	GCCTAC	2	12	836153	836164	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410476336
343	NC_018630	TGAAGT	2	12	838860	838871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410476338
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348	NC_018630	TCTGGT	2	12	850491	850502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410476354
349	NC_018630	CTCTAA	2	12	852389	852400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410476355
350	NC_018630	TCAAGT	2	12	853854	853865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410476357
351	NC_018630	CTTTTC	2	12	854383	854394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410476358
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353	NC_018630	GCATTT	2	12	856130	856141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410476359
354	NC_018630	GTCGAA	2	12	859463	859474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410476362
355	NC_018630	ATCTAC	2	12	859817	859828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410476362
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376	NC_018630	GCTGGA	2	12	910305	910316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410476418
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387	NC_018630	AGTTCT	2	12	932106	932117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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389	NC_018630	TCGACC	2	12	933315	933326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410476442
390	NC_018630	GGGGCT	2	12	938071	938082	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410476448
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447	NC_018630	AAATGG	2	12	1073020	1073031	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410476565
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454	NC_018630	TCACTC	2	12	1086100	1086111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410476580
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457	NC_018630	GTAATG	2	12	1095751	1095762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410476587
458	NC_018630	TTCTGC	2	12	1096613	1096624	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410476588
459	NC_018630	GTAATG	2	12	1098359	1098370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410476588
460	NC_018630	AGAGAT	2	12	1099888	1099899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410476590
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462	NC_018630	TGCAAC	2	12	1100938	1100949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410476590
463	NC_018630	CATCTG	2	12	1101044	1101055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410476591
464	NC_018630	GATATG	2	12	1103800	1103811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410476593
465	NC_018630	ACCAAT	2	12	1104623	1104634	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410476594
466	NC_018630	TTTTTG	2	12	1105311	1105322	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
467	NC_018630	CATAAA	2	12	1109153	1109164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410476598
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469	NC_018630	GTTTGT	2	12	1114494	1114505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018630	ACTTGA	2	12	1116316	1116327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410476609
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489	NC_018630	TTGCGC	2	12	1174922	1174933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410476667
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494	NC_018630	CTGCAA	2	12	1197581	1197592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410476689
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500	NC_018630	TCACCA	2	12	1208126	1208137	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410476702

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