MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	TAAGGA	2	12	16895	16906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018630	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018630	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018630	GTAAAC	2	12	34879	34890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018630	AAAACA	2	12	36731	36742	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018630	CAGGCT	2	12	58821	58832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018630	TAAAAA	2	12	59031	59042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018630	TTGTTT	2	12	63754	63765	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	TAAAAA	2	12	75363	75374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018630	TTCTAT	2	12	99089	99100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018630	TCCCAT	2	12	104943	104954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018630	TAAAAT	2	12	107321	107332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018630	ACATCA	2	12	115526	115537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018630	GCTTGC	2	12	118995	119006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018630	TAAAAA	2	12	125030	125041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018630	GCTTAT	2	12	145707	145718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018630	TTATCT	2	12	149353	149364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018630	TTTGCT	2	12	162933	162944	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018630	ATAAAA	2	12	163312	163323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018630	TTTTAC	2	12	215332	215343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018630	TCTTAA	2	12	259519	259530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018630	GGTTGC	2	12	276454	276465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018630	TCTTTT	2	12	295852	295863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018630	GAAAAA	2	12	334377	334388	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018630	ACAAGA	2	12	341623	341634	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018630	GCCAAA	2	12	361444	361455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018630	GCAGTT	2	12	379704	379715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018630	AGAAAT	2	12	425253	425264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018630	ATGAAG	2	12	436083	436094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018630	GCTTGC	2	12	466940	466951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018630	TAAAAA	2	12	511415	511426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018630	TCTATT	2	12	513066	513077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018630	TGCTTT	2	12	517774	517785	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018630	AAAACA	2	12	537020	537031	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018630	GCAATT	2	12	537460	537471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018630	GAAAGA	2	12	537670	537681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018630	TCTTTT	2	12	549657	549668	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018630	CTGTAA	2	12	595580	595591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018630	AAAGTT	2	12	600608	600619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018630	ACTTCT	2	12	619013	619024	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018630	ATGGAA	2	12	639922	639933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018630	AGATTG	2	12	702219	702230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018630	TAAAAA	2	12	773300	773311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018630	TTCGGG	2	12	796571	796582	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018630	CATATG	2	12	828630	828641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018630	ATCATG	2	12	828933	828944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018630	TTAAAA	2	12	830441	830452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018630	TATAAA	2	12	833965	833976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018630	AAAAAG	2	12	884773	884784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018630	ACCAAG	2	12	885636	885647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018630	ACAAAC	2	12	892161	892172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018630	TTTTTA	2	12	905059	905070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018630	AGGACA	2	12	909520	909531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018630	CTATTT	2	12	916536	916547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018630	AAAAAG	2	12	916585	916596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018630	TTTTCT	2	12	926851	926862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018630	AGTTCT	2	12	932106	932117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018630	GTATTG	2	12	932462	932473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018630	CTATTT	2	12	946510	946521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018630	TTTCAA	2	12	984342	984353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018630	ACGATA	2	12	1046719	1046730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018630	ACCCCG	2	12	1047139	1047150	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018630	TCCATT	2	12	1047541	1047552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018630	ATCTGG	2	12	1051827	1051838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018630	AAGGCT	2	12	1051903	1051914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018630	TTCGAA	2	12	1053174	1053185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018630	ATATTT	2	12	1060027	1060038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018630	CTGCTC	2	12	1062850	1062861	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018630	TTTTTA	2	12	1068917	1068928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018630	TTTTTG	2	12	1105311	1105322	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018630	GTTTGT	2	12	1114494	1114505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018630	TGAAAA	2	12	1130113	1130124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018630	AGAAAA	2	12	1167974	1167985	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018630	ATACTA	2	12	1194644	1194655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018630	TAAAAA	2	12	1208364	1208375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018630	GAGTAA	2	12	1210514	1210525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018630	TAGGTA	2	12	1252224	1252235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018630	GATGGT	2	12	1292021	1292032	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018630	TTTTAT	2	12	1303391	1303402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018630	TTTCCT	2	12	1306869	1306880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018630	GTCCCA	2	12	1310733	1310744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018630	ACTAAA	2	12	1361027	1361038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018630	AAATTT	2	12	1375787	1375798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018630	CTTTCT	2	12	1472239	1472250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018630	CCGTTT	2	12	1478823	1478834	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018630	ATGGTC	2	12	1499183	1499194	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018630	CACTTC	2	12	1500951	1500962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018630	GAATCG	2	12	1522091	1522102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018630	TTAAAA	2	12	1532990	1533001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018630	AACTTG	2	12	1568180	1568191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018630	TAATCA	2	12	1598169	1598180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018630	AAAAAG	2	12	1604529	1604540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018630	CACTTC	2	12	1614737	1614748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018630	AAAAAT	2	12	1625667	1625678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018630	TCTATT	2	12	1631087	1631098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018630	GAACAT	2	12	1649529	1649540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018630	CTTTCT	2	12	1668544	1668555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018630	TAGGCT	2	12	1669471	1669482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018630	ATATCA	2	12	1674208	1674219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018630	TCATTA	2	12	1681218	1681229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018630	TAATCA	2	12	1699975	1699986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018630	TAAAAA	2	12	1726420	1726431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018630	TATTAG	2	12	1728176	1728187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018630	CACTTC	2	12	1728207	1728218	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018630	TCCTTA	2	12	1731295	1731306	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018630	TGGGCT	2	12	1736570	1736581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018630	TTCATC	2	12	1746837	1746848	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018630	CCAGAA	2	12	1758027	1758038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018630	AAAAGA	2	12	1797202	1797213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018630	ATACCA	2	12	1803210	1803221	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018630	AAAAAT	2	12	1806992	1807003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018630	TATTAG	2	12	1819033	1819044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018630	CACTTC	2	12	1819064	1819075	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018630	TCCTTA	2	12	1822152	1822163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018630	ATGATT	2	12	1835160	1835171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018630	CCCGAA	2	12	1880260	1880271	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018630	TATTAG	2	12	1881137	1881148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018630	CACTTC	2	12	1881168	1881179	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018630	TCCTTA	2	12	1884257	1884268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018630	TAATTT	2	12	1911180	1911191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018630	TAAATT	2	12	1962422	1962433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018630	TCCAAC	2	12	1967841	1967852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.