MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018630	TCGTG	2	10	16422	16431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018630	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018630	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018630	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018630	TTGAA	2	10	20076	20085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018630	CTTTT	2	10	24207	24216	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018630	TTTTA	2	10	27986	27995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	TTTTA	2	10	29647	29656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018630	ATTAT	2	10	59552	59561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018630	TTTTA	2	10	59690	59699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018630	AATCA	2	10	66711	66720	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018630	AGAGG	2	10	78489	78498	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018630	ATTCA	2	10	104872	104881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018630	TATCA	2	10	110640	110649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018630	TGACT	2	10	115491	115500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018630	ATAAA	2	10	122908	122917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018630	TAACC	2	10	123006	123015	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018630	GGCTT	2	10	138863	138872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018630	GCTTT	2	10	147008	147017	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018630	TATTG	2	10	147045	147054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018630	TAAAA	2	10	152867	152876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018630	ATTAA	2	10	156312	156321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018630	GTTTG	2	10	163101	163110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018630	ACATG	2	10	163234	163243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018630	GAAAA	2	10	163826	163835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018630	TGAAA	2	10	193218	193227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018630	CCCTG	2	10	201844	201853	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_018630	AAGGA	2	10	229304	229313	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018630	GTTCA	2	10	230938	230947	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018630	AAAAT	2	10	234745	234754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018630	ATCGA	2	10	235493	235502	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018630	ATTCT	2	10	244874	244883	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018630	CTATC	2	10	246193	246202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018630	CTTTT	2	10	259154	259163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018630	CTTAA	2	10	261511	261520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018630	AAGCC	2	10	275238	275247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018630	AATAG	2	10	276784	276793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018630	TGATA	2	10	285916	285925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018630	TTTAT	2	10	304235	304244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018630	TTAAG	2	10	304656	304665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018630	TAAAG	2	10	309208	309217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018630	CTTTT	2	10	312890	312899	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018630	AAATA	2	10	327782	327791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018630	TATAT	2	10	343961	343970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018630	ATTTC	2	10	356498	356507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018630	GGAAC	2	10	360707	360716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018630	CTATC	2	10	362645	362654	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018630	ATAAA	2	10	377539	377548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018630	GACTG	2	10	434300	434309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018630	ATATA	2	10	442960	442969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018630	AAATA	2	10	445294	445303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018630	AGAAA	2	10	445315	445324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018630	ATTTC	3	15	448059	448073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018630	TTTAT	2	10	451799	451808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018630	ATTTA	2	10	451913	451922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018630	AAGAG	2	10	463654	463663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018630	CAGGG	2	10	466982	466991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018630	TGAAA	2	10	472315	472324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018630	TATTT	2	10	474386	474395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018630	AATAA	2	10	479642	479651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018630	CTTTT	2	10	480910	480919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018630	TAAAA	2	10	480923	480932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018630	CTAAG	2	10	485246	485255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018630	TGTTT	2	10	485497	485506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018630	CTTTC	2	10	491539	491548	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018630	ATAAA	2	10	493919	493928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018630	AGCGA	2	10	497055	497064	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018630	TTGCC	2	10	500794	500803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018630	ATTCA	2	10	501564	501573	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018630	TACTG	2	10	502337	502346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018630	ATATA	2	10	502354	502363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018630	TTCTT	2	10	504919	504928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018630	GATAA	2	10	507595	507604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018630	CAATA	2	10	512649	512658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018630	TATAA	2	10	524995	525004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018630	CTTTT	2	10	527811	527820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018630	TTTTA	2	10	527892	527901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018630	ATTTT	2	10	535658	535667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018630	TTGCC	2	10	536433	536442	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018630	GATTG	2	10	537539	537548	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018630	TAATT	2	10	537865	537874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018630	AGATG	2	10	538339	538348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018630	ATAAA	2	10	538534	538543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018630	TTTTA	2	10	538686	538695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018630	TTTAT	2	10	542927	542936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018630	AGGAA	2	10	545006	545015	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018630	ATAAA	2	10	553041	553050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018630	ATATA	2	10	564881	564890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018630	TAGTA	2	10	568111	568120	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018630	TAAAA	2	10	577984	577993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018630	TTTAC	3	15	607192	607206	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018630	TTTCC	2	10	608956	608965	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018630	CTATC	2	10	609018	609027	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018630	AAACA	2	10	609367	609376	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018630	GAAAA	2	10	650217	650226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018630	GTTAT	2	10	650256	650265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018630	AGGGG	2	10	690966	690975	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018630	ATGGA	2	10	712640	712649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018630	TTATT	2	10	714935	714944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018630	ATAAA	2	10	722539	722548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018630	AAAAG	2	10	725821	725830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018630	TAAAA	2	10	741420	741429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018630	GACTC	2	10	756210	756219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018630	AAAAT	2	10	756486	756495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018630	ATTTT	2	10	759489	759498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018630	CAAGA	2	10	765437	765446	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018630	CAAAT	2	10	767566	767575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018630	AAAAT	2	10	767611	767620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018630	TCTGA	2	10	771139	771148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018630	CTGAA	2	10	773337	773346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018630	ATAAA	2	10	773511	773520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018630	TTTGA	2	10	773539	773548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018630	AAATA	2	10	781175	781184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018630	TATTT	2	10	796728	796737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018630	TTTTG	2	10	821826	821835	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018630	AAATT	2	10	821920	821929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018630	ATTTG	2	10	829621	829630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018630	TATAT	2	10	833929	833938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018630	ATCTA	2	10	840421	840430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018630	TATGA	2	10	842486	842495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018630	AAATC	2	10	850089	850098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018630	AGGTT	2	10	850168	850177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018630	AGAAC	2	10	854985	854994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018630	ATATA	2	10	857916	857925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018630	CTTTT	2	10	863318	863327	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018630	TAATA	2	10	864330	864339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018630	ATAGA	2	10	873193	873202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018630	CTTTT	2	10	885078	885087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018630	CATCT	2	10	885447	885456	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018630	GAAGA	2	10	885933	885942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018630	ACCAA	2	10	892148	892157	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018630	TCTTT	2	10	894198	894207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018630	ATCAA	2	10	909423	909432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018630	TAGAA	2	10	909808	909817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018630	AGGCT	2	10	914564	914573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018630	AGCTC	2	10	924531	924540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018630	AAAAG	2	10	925321	925330	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018630	TACTT	2	10	932640	932649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018630	TTTTA	2	10	932943	932952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018630	GTAAG	2	10	938977	938986	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018630	ATAAG	2	10	940993	941002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018630	TTAGA	2	10	941074	941083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018630	TAAAG	2	10	944043	944052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018630	TTGAT	2	10	946482	946491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018630	ACATA	2	10	946749	946758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018630	TATTT	2	10	949999	950008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018630	TATAT	2	10	950087	950096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018630	TGAAA	2	10	982158	982167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018630	TAAAA	2	10	984085	984094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018630	TTTGG	2	10	984106	984115	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_018630	TTTTC	2	10	1212098	1212107	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_018630	GGCAA	2	10	1213918	1213927	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_018630	TGAAA	2	10	1873318	1873327	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018630	ACTAT	2	10	1879889	1879898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_018630	TCCCT	2	10	1881281	1881290	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
291	NC_018630	CTCCC	2	10	1883492	1883501	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
292	NC_018630	CACGA	2	10	1884732	1884741	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018630	TATAT	2	10	1888209	1888218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018630	TTATA	2	10	1892418	1892427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018630	TAGTA	2	10	1910943	1910952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018630	TTAAA	2	10	1911094	1911103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_018630	GAAAA	2	10	1916714	1916723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018630	TTCGA	2	10	1924390	1924399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
299	NC_018630	ATTAT	2	10	1925950	1925959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_018630	ATCAA	2	10	1930494	1930503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_018630	AAATC	2	10	1931931	1931940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_018630	ACTTT	2	10	1956071	1956080	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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307	NC_018630	CTTTT	2	10	2024086	2024095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
308	NC_018630	CTTCC	2	10	2028439	2028448	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
309	NC_018630	TATTT	2	10	2054503	2054512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_018630	TCTCA	2	10	2057375	2057384	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.