MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 1241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	410475458
2	NC_018630	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	410475458
3	NC_018630	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	410475458
4	NC_018630	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	410475459
5	NC_018630	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	410475460
6	NC_018630	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	410475462
7	NC_018630	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
8	NC_018630	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	410475463
9	NC_018630	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	410475463
10	NC_018630	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	410475463
11	NC_018630	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	410475463
12	NC_018630	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	410475463
13	NC_018630	CAATT	2	10	8238	8247	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
14	NC_018630	AGGAA	2	10	9254	9263	60 %	0 %	40 %	0 %	410475466
15	NC_018630	ATTGA	2	10	10672	10681	40 %	40 %	20 %	0 %	410475468
16	NC_018630	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	410475470
17	NC_018630	ATGGT	2	10	23039	23048	20 %	40 %	40 %	0 %	410475477
18	NC_018630	GGTAA	2	10	26023	26032	40 %	20 %	40 %	0 %	410475479
19	NC_018630	AGGAT	2	10	27097	27106	40 %	20 %	40 %	0 %	410475482
20	NC_018630	TTTTA	2	10	27753	27762	20 %	80 %	0 %	0 %	410475484
21	NC_018630	CTTAT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	0 %	20 %	410475497
22	NC_018630	GAAGA	2	10	33889	33898	60 %	0 %	40 %	0 %	410475501
23	NC_018630	TTTAG	2	10	34650	34659	20 %	60 %	20 %	0 %	410475503
24	NC_018630	ATTAC	2	10	35386	35395	40 %	40 %	0 %	20 %	410475504
25	NC_018630	CAGAA	2	10	36573	36582	60 %	0 %	20 %	20 %	410475507
26	NC_018630	TTTTG	2	10	36824	36833	0 %	80 %	20 %	0 %	410475508
27	NC_018630	GAATG	2	10	36913	36922	40 %	20 %	40 %	0 %	410475508
28	NC_018630	GAAAC	2	10	40707	40716	60 %	0 %	20 %	20 %	410475514
29	NC_018630	TCTAA	2	10	41050	41059	40 %	40 %	0 %	20 %	410475514
30	NC_018630	CTCTT	2	10	41671	41680	0 %	60 %	0 %	40 %	410475514
31	NC_018630	TGATT	2	10	41929	41938	20 %	60 %	20 %	0 %	410475515
32	NC_018630	AAATC	2	10	42997	43006	60 %	20 %	0 %	20 %	410475516
33	NC_018630	GGGTG	2	10	44110	44119	0 %	20 %	80 %	0 %	410475518
34	NC_018630	CCTAT	2	10	44431	44440	20 %	40 %	0 %	40 %	410475519
35	NC_018630	ATGAC	2	10	45157	45166	40 %	20 %	20 %	20 %	410475522
36	NC_018630	GGTCA	2	10	49718	49727	20 %	20 %	40 %	20 %	410475525
37	NC_018630	CTAGG	2	10	53838	53847	20 %	20 %	40 %	20 %	410475527
38	NC_018630	CTCAA	2	10	54829	54838	40 %	20 %	0 %	40 %	410475527
39	NC_018630	TTTTG	2	10	59411	59420	0 %	80 %	20 %	0 %	410475535
40	NC_018630	CTTCC	2	10	65955	65964	0 %	40 %	0 %	60 %	410475542
41	NC_018630	AGCAG	2	10	67382	67391	40 %	0 %	40 %	20 %	410475544
42	NC_018630	CAGAT	2	10	76925	76934	40 %	20 %	20 %	20 %	410475556
43	NC_018630	TTTAC	2	10	77627	77636	20 %	60 %	0 %	20 %	410475556
44	NC_018630	GTGAC	2	10	81258	81267	20 %	20 %	40 %	20 %	410475559
45	NC_018630	GTGAT	2	10	82248	82257	20 %	40 %	40 %	0 %	410475559
46	NC_018630	GTTTG	2	10	85065	85074	0 %	60 %	40 %	0 %	410475560
47	NC_018630	AAATG	2	10	85674	85683	60 %	20 %	20 %	0 %	410475560
48	NC_018630	AGCTA	2	10	86568	86577	40 %	20 %	20 %	20 %	410475561
49	NC_018630	CCTTG	2	10	89458	89467	0 %	40 %	20 %	40 %	410475564
50	NC_018630	TCAAA	2	10	89652	89661	60 %	20 %	0 %	20 %	410475564
51	NC_018630	AGTGG	2	10	92019	92028	20 %	20 %	60 %	0 %	410475567
52	NC_018630	GGGTG	2	10	92057	92066	0 %	20 %	80 %	0 %	410475567
53	NC_018630	AAGCA	2	10	93215	93224	60 %	0 %	20 %	20 %	410475568
54	NC_018630	GCTTG	2	10	93669	93678	0 %	40 %	40 %	20 %	410475570
55	NC_018630	GCTTT	2	10	95098	95107	0 %	60 %	20 %	20 %	410475571
56	NC_018630	TCTGG	2	10	95704	95713	0 %	40 %	40 %	20 %	410475571
57	NC_018630	AGCAT	2	10	96658	96667	40 %	20 %	20 %	20 %	410475571
58	NC_018630	TACCA	2	10	97356	97365	40 %	20 %	0 %	40 %	410475571
59	NC_018630	TTCCT	2	10	98373	98382	0 %	60 %	0 %	40 %	410475571
60	NC_018630	TTTAT	2	10	98950	98959	20 %	80 %	0 %	0 %	410475571
61	NC_018630	TTGGT	2	10	102326	102335	0 %	60 %	40 %	0 %	410475574
62	NC_018630	CTTCA	2	10	103381	103390	20 %	40 %	0 %	40 %	410475575
63	NC_018630	AATCA	2	10	103493	103502	60 %	20 %	0 %	20 %	410475576
64	NC_018630	AGCTC	2	10	105716	105725	20 %	20 %	20 %	40 %	410475578
65	NC_018630	GCTGT	2	10	110316	110325	0 %	40 %	40 %	20 %	410475585
66	NC_018630	TCTAT	2	10	111519	111528	20 %	60 %	0 %	20 %	410475587
67	NC_018630	AGAAA	2	10	112444	112453	80 %	0 %	20 %	0 %	410475587
68	NC_018630	GAAAG	2	10	112496	112505	60 %	0 %	40 %	0 %	410475588
69	NC_018630	GCGGT	2	10	113737	113746	0 %	20 %	60 %	20 %	410475590
70	NC_018630	AGGGC	2	10	120747	120756	20 %	0 %	60 %	20 %	410475593
71	NC_018630	ATTCT	2	10	123181	123190	20 %	60 %	0 %	20 %	410475598
72	NC_018630	TTACT	2	10	126823	126832	20 %	60 %	0 %	20 %	410475601
73	NC_018630	TGGGA	2	10	127477	127486	20 %	20 %	60 %	0 %	410475601
74	NC_018630	TGCTT	2	10	128197	128206	0 %	60 %	20 %	20 %	410475602
75	NC_018630	TGGCT	2	10	128380	128389	0 %	40 %	40 %	20 %	410475602
76	NC_018630	AGATA	2	10	132452	132461	60 %	20 %	20 %	0 %	410475607
77	NC_018630	GTTTG	2	10	132619	132628	0 %	60 %	40 %	0 %	410475607
78	NC_018630	TATTT	2	10	134576	134585	20 %	80 %	0 %	0 %	410475609
79	NC_018630	AAAGC	2	10	137439	137448	60 %	0 %	20 %	20 %	410475612
80	NC_018630	CACAA	2	10	139202	139211	60 %	0 %	0 %	40 %	410475614
81	NC_018630	GGAAT	2	10	140683	140692	40 %	20 %	40 %	0 %	410475616
82	NC_018630	AGGAT	2	10	141248	141257	40 %	20 %	40 %	0 %	410475617
83	NC_018630	CTTTG	2	10	142557	142566	0 %	60 %	20 %	20 %	410475617
84	NC_018630	TCCTC	2	10	142683	142692	0 %	40 %	0 %	60 %	410475617
85	NC_018630	TGACT	2	10	144124	144133	20 %	40 %	20 %	20 %	410475619
86	NC_018630	ATTTT	2	10	147143	147152	20 %	80 %	0 %	0 %	410475624
87	NC_018630	TTGGA	2	10	147590	147599	20 %	40 %	40 %	0 %	410475624
88	NC_018630	AACTA	2	10	155071	155080	60 %	20 %	0 %	20 %	410475635
89	NC_018630	CGTGG	2	10	157137	157146	0 %	20 %	60 %	20 %	410475636
90	NC_018630	CCAGG	2	10	157731	157740	20 %	0 %	40 %	40 %	410475636
91	NC_018630	GTGAA	2	10	158139	158148	40 %	20 %	40 %	0 %	410475637
92	NC_018630	AAGCA	2	10	161829	161838	60 %	0 %	20 %	20 %	410475640
93	NC_018630	TGGAC	2	10	164112	164121	20 %	20 %	40 %	20 %	410475644
94	NC_018630	TATAC	2	10	173655	173664	40 %	40 %	0 %	20 %	410475654
95	NC_018630	ATGTT	2	10	176239	176248	20 %	60 %	20 %	0 %	410475658
96	NC_018630	GATCT	2	10	177751	177760	20 %	40 %	20 %	20 %	410475659
97	NC_018630	AGCTG	2	10	177900	177909	20 %	20 %	40 %	20 %	410475659
98	NC_018630	GAAAT	2	10	179650	179659	60 %	20 %	20 %	0 %	410475662
99	NC_018630	TTAGT	2	10	180522	180531	20 %	60 %	20 %	0 %	410475663
100	NC_018630	CTTGC	2	10	180878	180887	0 %	40 %	20 %	40 %	410475663
101	NC_018630	GGCCT	2	10	181787	181796	0 %	20 %	40 %	40 %	410475664
102	NC_018630	AGAAA	2	10	183536	183545	80 %	0 %	20 %	0 %	410475666
103	NC_018630	TATAC	2	10	185497	185506	40 %	40 %	0 %	20 %	410475667
104	NC_018630	AGATC	2	10	185802	185811	40 %	20 %	20 %	20 %	410475668
105	NC_018630	TTTGT	2	10	187811	187820	0 %	80 %	20 %	0 %	410475670
106	NC_018630	ACTAT	2	10	191817	191826	40 %	40 %	0 %	20 %	410475673
107	NC_018630	TTGAG	2	10	194397	194406	20 %	40 %	40 %	0 %	410475676
108	NC_018630	GCCTT	2	10	196221	196230	0 %	40 %	20 %	40 %	410475679
109	NC_018630	AAGTA	2	10	199003	199012	60 %	20 %	20 %	0 %	410475682
110	NC_018630	TTGAT	2	10	200162	200171	20 %	60 %	20 %	0 %	410475683
111	NC_018630	TCACT	2	10	200537	200546	20 %	40 %	0 %	40 %	410475684
112	NC_018630	ATTTT	2	10	200860	200869	20 %	80 %	0 %	0 %	410475684
113	NC_018630	TTAAG	2	10	201212	201221	40 %	40 %	20 %	0 %	410475684
114	NC_018630	TCAGG	2	10	202127	202136	20 %	20 %	40 %	20 %	410475685
115	NC_018630	GCCTT	2	10	203741	203750	0 %	40 %	20 %	40 %	410475687
116	NC_018630	AAATG	2	10	203854	203863	60 %	20 %	20 %	0 %	410475687
117	NC_018630	TTCCC	2	10	204297	204306	0 %	40 %	0 %	60 %	410475688
118	NC_018630	TCTCT	2	10	207844	207853	0 %	60 %	0 %	40 %	410475691
119	NC_018630	GAAAG	2	10	209860	209869	60 %	0 %	40 %	0 %	410475691
120	NC_018630	AGTTA	2	10	211140	211149	40 %	40 %	20 %	0 %	410475693
121	NC_018630	TGGAG	2	10	211830	211839	20 %	20 %	60 %	0 %	410475694
122	NC_018630	AAATC	2	10	212372	212381	60 %	20 %	0 %	20 %	410475695
123	NC_018630	GCAGA	2	10	214037	214046	40 %	0 %	40 %	20 %	410475698
124	NC_018630	ATGAT	2	10	217073	217082	40 %	40 %	20 %	0 %	410475701
125	NC_018630	GTAGA	2	10	217244	217253	40 %	20 %	40 %	0 %	410475702
126	NC_018630	TTTAG	2	10	217729	217738	20 %	60 %	20 %	0 %	410475702
127	NC_018630	CTTTT	2	10	218203	218212	0 %	80 %	0 %	20 %	410475702
128	NC_018630	GTCTG	2	10	218680	218689	0 %	40 %	40 %	20 %	410475702
129	NC_018630	AGCAG	2	10	221709	221718	40 %	0 %	40 %	20 %	410475705
130	NC_018630	GGGAG	2	10	222048	222057	20 %	0 %	80 %	0 %	410475706
131	NC_018630	ACTTA	2	10	222990	222999	40 %	40 %	0 %	20 %	410475707
132	NC_018630	TACAC	2	10	225643	225652	40 %	20 %	0 %	40 %	410475712
133	NC_018630	TTTGG	2	10	226788	226797	0 %	60 %	40 %	0 %	410475714
134	NC_018630	TTCAC	2	10	227144	227153	20 %	40 %	0 %	40 %	410475715
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