MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 6003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018630	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018630	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018630	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	410475458
5	NC_018630	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	410475458
6	NC_018630	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	410475458
7	NC_018630	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	410475458
8	NC_018630	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	410475459
10	NC_018630	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	410475459
11	NC_018630	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	410475459
12	NC_018630	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	410475459
13	NC_018630	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018630	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	410475461
15	NC_018630	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	410475461
16	NC_018630	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	410475461
17	NC_018630	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	410475461
18	NC_018630	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	410475462
19	NC_018630	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	410475462
20	NC_018630	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	410475462
21	NC_018630	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	410475463
22	NC_018630	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
23	NC_018630	TTTA	2	8	7633	7640	25 %	75 %	0 %	0 %	410475463
24	NC_018630	GTCG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	410475463
25	NC_018630	ATCA	2	8	7747	7754	50 %	25 %	0 %	25 %	410475463
26	NC_018630	GAAA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
27	NC_018630	AAGA	2	8	8372	8379	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
28	NC_018630	GAAA	2	8	9355	9362	75 %	0 %	25 %	0 %	410475467
29	NC_018630	TATT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	410475467
30	NC_018630	TAAA	2	8	9522	9529	75 %	25 %	0 %	0 %	410475467
31	NC_018630	ATCA	2	8	9597	9604	50 %	25 %	0 %	25 %	410475467
32	NC_018630	GAAG	2	8	9740	9747	50 %	0 %	50 %	0 %	410475467
33	NC_018630	TTCT	2	8	9859	9866	0 %	75 %	0 %	25 %	410475467
34	NC_018630	ATCA	2	8	9908	9915	50 %	25 %	0 %	25 %	410475467
35	NC_018630	CAGC	2	8	9933	9940	25 %	0 %	25 %	50 %	410475467
36	NC_018630	TTCT	2	8	10455	10462	0 %	75 %	0 %	25 %	410475467
37	NC_018630	CTAT	2	8	10947	10954	25 %	50 %	0 %	25 %	410475468
38	NC_018630	CTTA	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	410475468
39	NC_018630	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	410475468
40	NC_018630	TTTA	2	8	11640	11647	25 %	75 %	0 %	0 %	410475468
41	NC_018630	AGAA	2	8	12353	12360	75 %	0 %	25 %	0 %	410475469
42	NC_018630	TTAA	2	8	12391	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	410475470
43	NC_018630	ACCA	2	8	12548	12555	50 %	0 %	0 %	50 %	410475470
44	NC_018630	TGCT	2	8	13073	13080	0 %	50 %	25 %	25 %	410475470
45	NC_018630	GATG	2	8	13317	13324	25 %	25 %	50 %	0 %	410475470
46	NC_018630	TTGG	2	8	13426	13433	0 %	50 %	50 %	0 %	410475470
47	NC_018630	TGAA	2	8	13568	13575	50 %	25 %	25 %	0 %	410475470
48	NC_018630	AAGA	2	8	13666	13673	75 %	0 %	25 %	0 %	410475470
49	NC_018630	TCTA	2	8	13842	13849	25 %	50 %	0 %	25 %	410475470
50	NC_018630	TGGC	2	8	13871	13878	0 %	25 %	50 %	25 %	410475470
51	NC_018630	AACA	2	8	14075	14082	75 %	0 %	0 %	25 %	410475470
52	NC_018630	GTTC	2	8	14104	14111	0 %	50 %	25 %	25 %	410475470
53	NC_018630	ATGA	2	8	14311	14318	50 %	25 %	25 %	0 %	410475470
54	NC_018630	AAAC	2	8	14800	14807	75 %	0 %	0 %	25 %	410475471
55	NC_018630	TGAG	2	8	15330	15337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018630	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018630	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018630	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018630	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018630	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018630	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018630	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018630	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018630	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018630	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018630	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018630	CTTT	2	8	21355	21362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018630	ATGT	2	8	22789	22796	25 %	50 %	25 %	0 %	410475477
69	NC_018630	GATA	2	8	23430	23437	50 %	25 %	25 %	0 %	410475477
70	NC_018630	CAAG	2	8	23594	23601	50 %	0 %	25 %	25 %	410475477
71	NC_018630	GGTT	2	8	23749	23756	0 %	50 %	50 %	0 %	410475477
72	NC_018630	CTTT	2	8	23806	23813	0 %	75 %	0 %	25 %	410475477
73	NC_018630	CTAT	2	8	23933	23940	25 %	50 %	0 %	25 %	410475477
74	NC_018630	TTGG	2	8	24037	24044	0 %	50 %	50 %	0 %	410475477
75	NC_018630	AACA	2	8	24083	24090	75 %	0 %	0 %	25 %	410475477
76	NC_018630	TTCA	2	8	24544	24551	25 %	50 %	0 %	25 %	410475478
77	NC_018630	TTAT	2	8	26915	26922	25 %	75 %	0 %	0 %	410475482
78	NC_018630	GTCC	2	8	27589	27596	0 %	25 %	25 %	50 %	410475484
79	NC_018630	GTAG	2	8	27599	27606	25 %	25 %	50 %	0 %	410475484
80	NC_018630	ACTT	2	8	27956	27963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018630	GACA	2	8	28424	28431	50 %	0 %	25 %	25 %	410475486
82	NC_018630	TTGA	2	8	28666	28673	25 %	50 %	25 %	0 %	410475487
83	NC_018630	GAAA	2	8	28770	28777	75 %	0 %	25 %	0 %	410475487
84	NC_018630	ATGA	2	8	29049	29056	50 %	25 %	25 %	0 %	410475489
85	NC_018630	AATC	2	8	29084	29091	50 %	25 %	0 %	25 %	410475489
86	NC_018630	AAAT	2	8	29192	29199	75 %	25 %	0 %	0 %	410475489
87	NC_018630	TTTA	2	8	29238	29245	25 %	75 %	0 %	0 %	410475490
88	NC_018630	TTGC	2	8	29260	29267	0 %	50 %	25 %	25 %	410475490
89	NC_018630	TCAT	2	8	29332	29339	25 %	50 %	0 %	25 %	410475490
90	NC_018630	TATC	2	8	29456	29463	25 %	50 %	0 %	25 %	410475490
91	NC_018630	TCAG	2	8	30223	30230	25 %	25 %	25 %	25 %	410475491
92	NC_018630	GATG	2	8	30517	30524	25 %	25 %	50 %	0 %	410475492
93	NC_018630	ATTG	2	8	31097	31104	25 %	50 %	25 %	0 %	410475494
94	NC_018630	GGAA	2	8	31142	31149	50 %	0 %	50 %	0 %	410475494
95	NC_018630	CCGT	2	8	31584	31591	0 %	25 %	25 %	50 %	410475495
96	NC_018630	ATAA	2	8	31867	31874	75 %	25 %	0 %	0 %	410475495
97	NC_018630	AAAG	2	8	32079	32086	75 %	0 %	25 %	0 %	410475495
98	NC_018630	ACCA	2	8	32272	32279	50 %	0 %	0 %	50 %	410475496
99	NC_018630	TGAA	2	8	32517	32524	50 %	25 %	25 %	0 %	410475497
100	NC_018630	AGCT	2	8	32649	32656	25 %	25 %	25 %	25 %	410475497
101	NC_018630	ACAA	2	8	33089	33096	75 %	0 %	0 %	25 %	410475497
102	NC_018630	CAAG	2	8	34087	34094	50 %	0 %	25 %	25 %	410475502
103	NC_018630	GTTG	2	8	34230	34237	0 %	50 %	50 %	0 %	410475502
104	NC_018630	AGTT	2	8	34290	34297	25 %	50 %	25 %	0 %	410475502
105	NC_018630	CTTG	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	410475503
106	NC_018630	GTCA	2	8	35315	35322	25 %	25 %	25 %	25 %	410475504
107	NC_018630	ATGT	2	8	35324	35331	25 %	50 %	25 %	0 %	410475504
108	NC_018630	AATG	2	8	35378	35385	50 %	25 %	25 %	0 %	410475504
109	NC_018630	AAAC	2	8	35683	35690	75 %	0 %	0 %	25 %	410475505
110	NC_018630	CTTT	2	8	35772	35779	0 %	75 %	0 %	25 %	410475505
111	NC_018630	AGAA	2	8	35849	35856	75 %	0 %	25 %	0 %	410475505
112	NC_018630	ACAA	2	8	36119	36126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018630	AAGA	2	8	37078	37085	75 %	0 %	25 %	0 %	410475508
114	NC_018630	GAGC	2	8	37168	37175	25 %	0 %	50 %	25 %	410475508
115	NC_018630	AGCA	2	8	37349	37356	50 %	0 %	25 %	25 %	410475508
116	NC_018630	TAAA	2	8	37608	37615	75 %	25 %	0 %	0 %	410475509
117	NC_018630	TTGC	2	8	38055	38062	0 %	50 %	25 %	25 %	410475510
118	NC_018630	CAAA	2	8	38274	38281	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018630	GATG	2	8	38835	38842	25 %	25 %	50 %	0 %	410475512
120	NC_018630	TATC	2	8	38918	38925	25 %	50 %	0 %	25 %	410475512
121	NC_018630	TGCT	2	8	39035	39042	0 %	50 %	25 %	25 %	410475512
122	NC_018630	CAAG	2	8	39144	39151	50 %	0 %	25 %	25 %	410475512
123	NC_018630	TTCT	2	8	39267	39274	0 %	75 %	0 %	25 %	410475512
124	NC_018630	AATC	2	8	39544	39551	50 %	25 %	0 %	25 %	410475512
125	NC_018630	ATGA	2	8	39664	39671	50 %	25 %	25 %	0 %	410475512
126	NC_018630	GGTT	2	8	39997	40004	0 %	50 %	50 %	0 %	410475512
127	NC_018630	ATGA	2	8	40448	40455	50 %	25 %	25 %	0 %	410475513
128	NC_018630	GTCA	2	8	40604	40611	25 %	25 %	25 %	25 %	410475513
129	NC_018630	AAGT	2	8	40722	40729	50 %	25 %	25 %	0 %	410475514
130	NC_018630	ACTT	2	8	41624	41631	25 %	50 %	0 %	25 %	410475514
131	NC_018630	TTTA	2	8	42052	42059	25 %	75 %	0 %	0 %	410475515
132	NC_018630	AAGA	2	8	42413	42420	75 %	0 %	25 %	0 %	410475515
133	NC_018630	TCAA	2	8	42511	42518	50 %	25 %	0 %	25 %	410475516
134	NC_018630	GATT	2	8	43035	43042	25 %	50 %	25 %	0 %	410475516
135	NC_018630	TCAA	2	8	43045	43052	50 %	25 %	0 %	25 %	410475516
136	NC_018630	TCAA	2	8	43139	43146	50 %	25 %	0 %	25 %	410475516
137	NC_018630	AGCA	2	8	43266	43273	50 %	0 %	25 %	25 %	410475516
138	NC_018630	GAAG	2	8	43838	43845	50 %	0 %	50 %	0 %	410475517
139	NC_018630	AAAG	2	8	44170	44177	75 %	0 %	25 %	0 %	410475518
140	NC_018630	GCAA	2	8	44407	44414	50 %	0 %	25 %	25 %	410475519
141	NC_018630	ACCT	2	8	44912	44919	25 %	25 %	0 %	50 %	410475521
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143	NC_018630	CAAC	2	8	45595	45602	50 %	0 %	0 %	50 %	410475522
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