MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018630	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018630	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018630	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018630	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018630	TGAG	2	8	15330	15337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018630	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018630	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018630	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018630	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018630	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018630	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018630	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018630	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018630	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018630	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018630	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018630	CTTT	2	8	21355	21362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018630	ACTT	2	8	27956	27963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018630	ACAA	2	8	36119	36126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018630	CAAA	2	8	38274	38281	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018630	CTAT	2	8	46176	46183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018630	CTGA	2	8	53171	53178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018630	CTCA	2	8	53206	53213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018630	AACC	2	8	58870	58877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018630	AAAT	2	8	58897	58904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018630	ATTG	2	8	59272	59279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018630	AATA	2	8	60409	60416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018630	AGAA	2	8	63378	63385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018630	ACGG	2	8	63451	63458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018630	GGGA	2	8	63599	63606	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018630	TTGA	2	8	64246	64253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018630	AATA	2	8	65349	65356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018630	TTCT	2	8	65723	65730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018630	AATT	2	8	66816	66823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018630	CTAT	2	8	66920	66927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018630	ATTT	2	8	75964	75971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018630	GGGA	2	8	76081	76088	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018630	GAAG	2	8	76104	76111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018630	TGAC	2	8	76218	76225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018630	ATAG	2	8	84670	84677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018630	TTTC	2	8	89977	89984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018630	TAAT	2	8	100219	100226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018630	GTTT	2	8	106223	106230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018630	GAAG	2	8	113279	113286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018630	AAAG	2	8	114636	114643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018630	AGAA	2	8	114939	114946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018630	AAAC	2	8	114962	114969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018630	CAAG	2	8	115078	115085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018630	GAAA	2	8	115125	115132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018630	CCTA	2	8	115613	115620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018630	CCTA	2	8	116069	116076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018630	CCTA	2	8	116523	116530	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018630	CCTA	2	8	116979	116986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018630	CCTA	2	8	117435	117442	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018630	CCTA	2	8	117890	117897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018630	CCTA	2	8	118346	118353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018630	AAAT	2	8	119066	119073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018630	CTTT	2	8	119127	119134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018630	AATT	2	8	122168	122175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018630	TTTG	2	8	122934	122941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018630	ATTC	2	8	126552	126559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018630	AAAT	2	8	126710	126717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018630	ATAA	2	8	126753	126760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018630	TTAG	2	8	130027	130034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018630	ACAT	2	8	131935	131942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018630	AAAG	2	8	131953	131960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018630	AAAT	2	8	134390	134397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018630	AGAA	2	8	139032	139039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018630	GAAG	2	8	140332	140339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018630	AAAT	2	8	140416	140423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018630	TCCC	2	8	140719	140726	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_018630	TGAC	2	8	143528	143535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018630	TAGA	2	8	145483	145490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018630	GTAG	2	8	145849	145856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018630	GTAT	2	8	145907	145914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018630	TGCT	2	8	146044	146051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018630	AGGA	2	8	146240	146247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018630	TTAT	2	8	148277	148284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018630	ATAA	2	8	148310	148317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018630	ATTT	2	8	148682	148689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018630	ATTT	2	8	152706	152713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018630	AATT	2	8	153298	153305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018630	GAAG	2	8	154155	154162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018630	TTAT	2	8	156491	156498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018630	TGAA	2	8	156509	156516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018630	AAAG	2	8	160493	160500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018630	TTGC	2	8	162979	162986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018630	TAGG	2	8	167881	167888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018630	GTAG	2	8	167979	167986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018630	AAGC	2	8	168000	168007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018630	AAAT	2	8	168717	168724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018630	ATGG	2	8	169119	169126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018630	AATA	2	8	169265	169272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018630	GAAA	2	8	169492	169499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018630	GAAG	2	8	169722	169729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018630	GGGA	2	8	172483	172490	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018630	AAAG	2	8	173702	173709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018630	GGCT	2	8	177157	177164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018630	AATT	2	8	181450	181457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018630	GAAA	2	8	181720	181727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018630	GCAG	2	8	181747	181754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018630	AGAT	2	8	182399	182406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018630	GGTG	2	8	183333	183340	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018630	CAAA	2	8	183408	183415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018630	TTTC	2	8	194794	194801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018630	TTCT	2	8	195857	195864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018630	TAAT	2	8	195885	195892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018630	AGCT	2	8	205186	205193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018630	GGTA	2	8	211061	211068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018630	AGAA	2	8	211519	211526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018630	AAAT	2	8	212111	212118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018630	ATTG	2	8	213476	213483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018630	AGAA	2	8	217028	217035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018630	AGAA	2	8	218859	218866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018630	AGAA	2	8	223025	223032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018630	GTTT	2	8	230887	230894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018630	ACAA	2	8	230895	230902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018630	ACAA	2	8	235864	235871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018630	TAAA	2	8	239978	239985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018630	TTTA	2	8	240052	240059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018630	CTTG	2	8	240868	240875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018630	AATT	2	8	244936	244943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018630	GTAT	2	8	245336	245343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018630	GAAA	2	8	246211	246218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018630	ACGA	2	8	246226	246233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018630	GAAA	2	8	250326	250333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018630	GAAA	2	8	250347	250354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018630	AATT	2	8	254701	254708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018630	TATT	2	8	254800	254807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018630	ATTA	2	8	254816	254823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018630	ATTT	2	8	257556	257563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018630	TAAA	2	8	258926	258933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018630	TTTA	2	8	258945	258952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018630	TTTA	2	8	259133	259140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018630	AATA	2	8	261614	261621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018630	CTGA	2	8	267897	267904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018630	GAAA	2	8	267980	267987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018630	AGAT	2	8	270140	270147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018630	CAAT	2	8	275091	275098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018630	CAAG	2	8	275335	275342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018630	CTAA	2	8	276633	276640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018630	AAAT	2	8	276801	276808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018630	AAAC	2	8	276814	276821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018630	GAAG	2	8	278922	278929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018630	CTTT	2	8	283460	283467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018630	ATAA	2	8	290020	290027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018630	GATT	2	8	292318	292325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018630	GCAG	2	8	293476	293483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018630	CAAA	2	8	293496	293503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018630	CAAA	2	8	293535	293542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018630	GGAA	2	8	300345	300352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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