MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 23153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475458
2	NC_018630	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
3	NC_018630	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
4	NC_018630	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
5	NC_018630	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
6	NC_018630	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
7	NC_018630	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
8	NC_018630	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
9	NC_018630	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
10	NC_018630	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
11	NC_018630	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475458
12	NC_018630	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
13	NC_018630	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
14	NC_018630	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475459
15	NC_018630	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
16	NC_018630	TTG	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
17	NC_018630	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
18	NC_018630	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
19	NC_018630	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
20	NC_018630	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
21	NC_018630	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475459
22	NC_018630	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475459
23	NC_018630	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
24	NC_018630	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
25	NC_018630	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
26	NC_018630	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
27	NC_018630	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475459
28	NC_018630	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475459
29	NC_018630	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
30	NC_018630	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
31	NC_018630	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
32	NC_018630	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
33	NC_018630	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475460
34	NC_018630	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
35	NC_018630	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
36	NC_018630	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
37	NC_018630	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475461
38	NC_018630	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
39	NC_018630	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475461
40	NC_018630	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
41	NC_018630	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
42	NC_018630	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
43	NC_018630	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
44	NC_018630	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
45	NC_018630	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
46	NC_018630	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475461
47	NC_018630	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
48	NC_018630	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475461
49	NC_018630	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
50	NC_018630	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
51	NC_018630	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475462
52	NC_018630	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
53	NC_018630	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
54	NC_018630	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475462
55	NC_018630	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
56	NC_018630	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475462
57	NC_018630	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
58	NC_018630	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
59	NC_018630	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
60	NC_018630	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
61	NC_018630	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
62	NC_018630	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
63	NC_018630	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
64	NC_018630	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475463
65	NC_018630	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475463
66	NC_018630	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
67	NC_018630	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475463
68	NC_018630	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
69	NC_018630	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
70	NC_018630	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
71	NC_018630	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
72	NC_018630	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
73	NC_018630	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
74	NC_018630	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
75	NC_018630	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
76	NC_018630	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475463
77	NC_018630	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475463
78	NC_018630	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475463
79	NC_018630	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475463
80	NC_018630	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
81	NC_018630	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
82	NC_018630	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
83	NC_018630	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
84	NC_018630	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
85	NC_018630	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475463
86	NC_018630	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475463
87	NC_018630	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
88	NC_018630	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
89	NC_018630	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
90	NC_018630	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410475463
91	NC_018630	TAT	2	6	7424	7429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
92	NC_018630	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475463
93	NC_018630	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475463
94	NC_018630	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
95	NC_018630	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
96	NC_018630	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
97	NC_018630	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475463
98	NC_018630	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
99	NC_018630	CTG	2	6	8399	8404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475463
100	NC_018630	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
101	NC_018630	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
102	NC_018630	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475464
103	NC_018630	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475464
104	NC_018630	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475464
105	NC_018630	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475464
106	NC_018630	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475465
107	NC_018630	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475465
108	NC_018630	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475465
109	NC_018630	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475465
110	NC_018630	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475465
111	NC_018630	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475465
112	NC_018630	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475465
113	NC_018630	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475466
114	NC_018630	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475466
115	NC_018630	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475466
116	NC_018630	AAG	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475466
117	NC_018630	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475467
118	NC_018630	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475467
119	NC_018630	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475467
120	NC_018630	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475467
121	NC_018630	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475467
122	NC_018630	ATC	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475467
123	NC_018630	CAA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475467
124	NC_018630	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475467
125	NC_018630	ATC	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475467
126	NC_018630	GAA	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475467
127	NC_018630	ACT	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475467
128	NC_018630	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475467
129	NC_018630	TAT	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475467
130	NC_018630	ATA	2	6	10092	10097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475467
131	NC_018630	GAT	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475467
132	NC_018630	TCT	2	6	10262	10267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475467
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135	NC_018630	GAA	2	6	10726	10731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475468
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252	NC_018630	CAA	2	6	25752	25757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475479
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254	NC_018630	ATC	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475479
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497	NC_018630	ACA	2	6	45328	45333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475522
498	NC_018630	TGA	2	6	45398	45403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475522
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