MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 15686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018627	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018627	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594902
4	NC_018627	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594902
5	NC_018627	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594902
6	NC_018627	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594902
7	NC_018627	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594902
8	NC_018627	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594902
9	NC_018627	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594902
10	NC_018627	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594902
11	NC_018627	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594902
12	NC_018627	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594902
13	NC_018627	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594902
14	NC_018627	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594902
15	NC_018627	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594902
16	NC_018627	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594902
17	NC_018627	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594902
18	NC_018627	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594902
19	NC_018627	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018627	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018627	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594804
22	NC_018627	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594804
23	NC_018627	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594804
24	NC_018627	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594804
25	NC_018627	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594804
26	NC_018627	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594804
27	NC_018627	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594804
28	NC_018627	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594804
29	NC_018627	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594804
30	NC_018627	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594804
31	NC_018627	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594804
32	NC_018627	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594804
33	NC_018627	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594804
34	NC_018627	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594804
35	NC_018627	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594804
36	NC_018627	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594804
37	NC_018627	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594804
38	NC_018627	AGT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594726
39	NC_018627	TTA	2	6	2653	2658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594726
40	NC_018627	TCC	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594726
41	NC_018627	TTC	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594726
42	NC_018627	TTA	2	6	2800	2805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594726
43	NC_018627	AGA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594726
44	NC_018627	TAT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594726
45	NC_018627	TAT	2	6	3003	3008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594726
46	NC_018627	TAT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018627	ATT	3	9	3070	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018627	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018627	GAA	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
50	NC_018627	ATG	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594534
51	NC_018627	AGT	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594534
52	NC_018627	CTT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594534
53	NC_018627	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594534
54	NC_018627	ATC	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594534
55	NC_018627	TGG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594534
56	NC_018627	AAG	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
57	NC_018627	AGA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
58	NC_018627	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594534
59	NC_018627	GAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
60	NC_018627	AGC	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594534
61	NC_018627	TAA	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594534
62	NC_018627	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
63	NC_018627	CTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594534
64	NC_018627	ATG	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594534
65	NC_018627	GAT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594534
66	NC_018627	GCT	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594534
67	NC_018627	GAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
68	NC_018627	AAG	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
69	NC_018627	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594534
70	NC_018627	AAG	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
71	NC_018627	AGA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594534
72	NC_018627	TTA	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594534
73	NC_018627	CAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594534
74	NC_018627	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018627	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018627	AGA	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594817
77	NC_018627	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594817
78	NC_018627	TAT	2	6	5618	5623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594817
79	NC_018627	GTT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594817
80	NC_018627	CAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594817
81	NC_018627	GAT	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594817
82	NC_018627	TGT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594817
83	NC_018627	GGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594817
84	NC_018627	CAA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594817
85	NC_018627	TGA	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594817
86	NC_018627	GAT	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594817
87	NC_018627	TGT	3	9	5980	5988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594817
88	NC_018627	TGA	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594817
89	NC_018627	TGC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594817
90	NC_018627	TGC	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594817
91	NC_018627	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594817
92	NC_018627	GAA	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594817
93	NC_018627	GAG	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594817
94	NC_018627	TTC	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594817
95	NC_018627	CCT	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594817
96	NC_018627	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594817
97	NC_018627	GTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594817
98	NC_018627	ACA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594817
99	NC_018627	ATA	2	6	6587	6592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594817
100	NC_018627	CAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594817
101	NC_018627	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018627	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594370
103	NC_018627	CAT	2	6	6913	6918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594370
104	NC_018627	ACA	2	6	6931	6936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594370
105	NC_018627	GTG	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594370
106	NC_018627	TGT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594370
107	NC_018627	TTC	2	6	7101	7106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594370
108	NC_018627	GTT	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594370
109	NC_018627	CAT	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594370
110	NC_018627	AGA	2	6	7167	7172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594370
111	NC_018627	TAA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594370
112	NC_018627	TTG	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594370
113	NC_018627	CTC	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594370
114	NC_018627	GGA	2	6	7459	7464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594370
115	NC_018627	TGA	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594370
116	NC_018627	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594370
117	NC_018627	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594370
118	NC_018627	TTC	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594370
119	NC_018627	TTG	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594531
120	NC_018627	TGC	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594531
121	NC_018627	AAG	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594531
122	NC_018627	TTA	2	6	8250	8255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594531
123	NC_018627	CTT	2	6	8269	8274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594531
124	NC_018627	GAA	2	6	8340	8345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594531
125	NC_018627	TTC	2	6	8375	8380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594531
126	NC_018627	TTC	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594531
127	NC_018627	AGG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594531
128	NC_018627	CCT	2	6	8764	8769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594531
129	NC_018627	AAG	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594531
130	NC_018627	GTT	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594531
131	NC_018627	GAA	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594531
132	NC_018627	CAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594531
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259	NC_018627	CAA	2	6	19699	19704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594049
260	NC_018627	CGT	2	6	19800	19805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594049
261	NC_018627	GTT	2	6	19876	19881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594049
262	NC_018627	GTT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594049
263	NC_018627	TAC	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594049
264	NC_018627	ATC	2	6	20135	20140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594049
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268	NC_018627	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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270	NC_018627	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_018627	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_018627	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_018627	AGA	3	9	27566	27574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594343
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