MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 2994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018626	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	406592922
2	NC_018626	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	406592922
3	NC_018626	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	406592923
4	NC_018626	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	406592923
5	NC_018626	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	406592924
6	NC_018626	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	406592924
7	NC_018626	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	406592924
8	NC_018626	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	406592925
9	NC_018626	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	406592925
10	NC_018626	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	406592925
11	NC_018626	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018626	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	406592926
13	NC_018626	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	406592927
14	NC_018626	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018626	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	406592928
16	NC_018626	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	406592928
17	NC_018626	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	406592928
18	NC_018626	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	406592929
19	NC_018626	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	406592929
20	NC_018626	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	406592929
21	NC_018626	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	406592929
22	NC_018626	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	406592929
23	NC_018626	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	406592929
24	NC_018626	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	406592929
25	NC_018626	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	406592929
26	NC_018626	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	406592930
27	NC_018626	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	406592930
28	NC_018626	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	406592930
29	NC_018626	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	406592930
30	NC_018626	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	406592930
31	NC_018626	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	406592930
32	NC_018626	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	406592930
33	NC_018626	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	406592930
34	NC_018626	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	406592930
35	NC_018626	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	406592930
36	NC_018626	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	406592930
37	NC_018626	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	406592931
38	NC_018626	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	406592931
39	NC_018626	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	406592931
40	NC_018626	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	406592931
41	NC_018626	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018626	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	406592933
43	NC_018626	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	406592933
44	NC_018626	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018626	GTCA	2	8	17838	17845	25 %	25 %	25 %	25 %	406592934
46	NC_018626	AAGC	2	8	18229	18236	50 %	0 %	25 %	25 %	406592934
47	NC_018626	ATTA	2	8	18369	18376	50 %	50 %	0 %	0 %	406592934
48	NC_018626	ATTA	2	8	18991	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	406592936
49	NC_018626	GTTT	2	8	19264	19271	0 %	75 %	25 %	0 %	406592936
50	NC_018626	TTTG	2	8	19504	19511	0 %	75 %	25 %	0 %	406592936
51	NC_018626	GCGT	2	8	19668	19675	0 %	25 %	50 %	25 %	406592936
52	NC_018626	TGGT	2	8	20449	20456	0 %	50 %	50 %	0 %	406592937
53	NC_018626	TAAA	2	8	21089	21096	75 %	25 %	0 %	0 %	406592937
54	NC_018626	TATG	2	8	21588	21595	25 %	50 %	25 %	0 %	406592937
55	NC_018626	CAAT	2	8	22283	22290	50 %	25 %	0 %	25 %	406592938
56	NC_018626	AGAA	2	8	22700	22707	75 %	0 %	25 %	0 %	406592938
57	NC_018626	TGAT	2	8	22907	22914	25 %	50 %	25 %	0 %	406592938
58	NC_018626	TGTC	2	8	24056	24063	0 %	50 %	25 %	25 %	406592939
59	NC_018626	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	406592939
60	NC_018626	AAAT	2	8	24506	24513	75 %	25 %	0 %	0 %	406592939
61	NC_018626	AATT	2	8	24631	24638	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
62	NC_018626	ATAA	2	8	24698	24705	75 %	25 %	0 %	0 %	406592939
63	NC_018626	TAGT	2	8	24987	24994	25 %	50 %	25 %	0 %	406592939
64	NC_018626	GAAC	2	8	25446	25453	50 %	0 %	25 %	25 %	406592939
65	NC_018626	GATA	2	8	26111	26118	50 %	25 %	25 %	0 %	406592939
66	NC_018626	TAAA	2	8	26476	26483	75 %	25 %	0 %	0 %	406592939
67	NC_018626	TATT	2	8	26657	26664	25 %	75 %	0 %	0 %	406592940
68	NC_018626	ATTA	2	8	26669	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	406592940
69	NC_018626	CTGG	2	8	27189	27196	0 %	25 %	50 %	25 %	406592941
70	NC_018626	TGGT	2	8	27331	27338	0 %	50 %	50 %	0 %	406592941
71	NC_018626	AATC	2	8	27725	27732	50 %	25 %	0 %	25 %	406592941
72	NC_018626	AATT	2	8	27962	27969	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
73	NC_018626	GAAA	2	8	28154	28161	75 %	0 %	25 %	0 %	406592941
74	NC_018626	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	406592941
75	NC_018626	GGCA	2	8	29086	29093	25 %	0 %	50 %	25 %	406592941
76	NC_018626	AGGG	2	8	29431	29438	25 %	0 %	75 %	0 %	406592942
77	NC_018626	GAAT	2	8	29625	29632	50 %	25 %	25 %	0 %	406592943
78	NC_018626	ACCA	2	8	30240	30247	50 %	0 %	0 %	50 %	406592943
79	NC_018626	GTTT	2	8	31411	31418	0 %	75 %	25 %	0 %	406592945
80	NC_018626	TTTC	2	8	31651	31658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018626	TCTA	2	8	32054	32061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018626	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018626	TTAA	2	8	32418	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018626	ATTT	2	8	32433	32440	25 %	75 %	0 %	0 %	406592947
85	NC_018626	TTGT	2	8	32459	32466	0 %	75 %	25 %	0 %	406592947
86	NC_018626	TAGA	2	8	32665	32672	50 %	25 %	25 %	0 %	406592947
87	NC_018626	TTTA	2	8	33119	33126	25 %	75 %	0 %	0 %	406592947
88	NC_018626	TTAA	2	8	33514	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018626	AGAT	2	8	33557	33564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018626	TTAG	2	8	33612	33619	25 %	50 %	25 %	0 %	406592948
91	NC_018626	TGAA	2	8	34016	34023	50 %	25 %	25 %	0 %	406592949
92	NC_018626	GTAC	2	8	34094	34101	25 %	25 %	25 %	25 %	406592949
93	NC_018626	GATA	2	8	34130	34137	50 %	25 %	25 %	0 %	406592949
94	NC_018626	TCTT	2	8	34390	34397	0 %	75 %	0 %	25 %	406592950
95	NC_018626	AGGA	2	8	35342	35349	50 %	0 %	50 %	0 %	406592950
96	NC_018626	TAAT	2	8	36130	36137	50 %	50 %	0 %	0 %	406592951
97	NC_018626	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018626	AAAG	2	8	38201	38208	75 %	0 %	25 %	0 %	406592952
99	NC_018626	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	406592952
100	NC_018626	TCAA	2	8	38353	38360	50 %	25 %	0 %	25 %	406592952
101	NC_018626	TTTA	2	8	38686	38693	25 %	75 %	0 %	0 %	406592952
102	NC_018626	CTTT	2	8	38816	38823	0 %	75 %	0 %	25 %	406592952
103	NC_018626	AGCG	2	8	39005	39012	25 %	0 %	50 %	25 %	406592952
104	NC_018626	CCTG	2	8	40301	40308	0 %	25 %	25 %	50 %	406592955
105	NC_018626	GAAA	2	8	41242	41249	75 %	0 %	25 %	0 %	406592955
106	NC_018626	AGCA	2	8	41413	41420	50 %	0 %	25 %	25 %	406592955
107	NC_018626	CTGT	2	8	41881	41888	0 %	50 %	25 %	25 %	406592955
108	NC_018626	TCTT	2	8	41921	41928	0 %	75 %	0 %	25 %	406592955
109	NC_018626	GAAG	2	8	42332	42339	50 %	0 %	50 %	0 %	406592955
110	NC_018626	AATA	2	8	42363	42370	75 %	25 %	0 %	0 %	406592955
111	NC_018626	GAAA	2	8	43500	43507	75 %	0 %	25 %	0 %	406592959
112	NC_018626	GTCG	2	8	44198	44205	0 %	25 %	50 %	25 %	406592960
113	NC_018626	TTAA	2	8	44228	44235	50 %	50 %	0 %	0 %	406592960
114	NC_018626	ATCA	2	8	44817	44824	50 %	25 %	0 %	25 %	406592960
115	NC_018626	ATGA	2	8	45095	45102	50 %	25 %	25 %	0 %	406592960
116	NC_018626	TAAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	406592961
117	NC_018626	GAAA	2	8	46976	46983	75 %	0 %	25 %	0 %	406592963
118	NC_018626	TCTT	2	8	47082	47089	0 %	75 %	0 %	25 %	406592963
119	NC_018626	GCTT	2	8	47611	47618	0 %	50 %	25 %	25 %	406592963
120	NC_018626	AAGA	2	8	48053	48060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018626	TGTT	2	8	48463	48470	0 %	75 %	25 %	0 %	406592964
122	NC_018626	ATAA	2	8	49531	49538	75 %	25 %	0 %	0 %	406592965
123	NC_018626	TAAA	2	8	49700	49707	75 %	25 %	0 %	0 %	406592965
124	NC_018626	AAGC	2	8	49729	49736	50 %	0 %	25 %	25 %	406592965
125	NC_018626	CCAA	2	8	49753	49760	50 %	0 %	0 %	50 %	406592965
126	NC_018626	TTCC	2	8	49900	49907	0 %	50 %	0 %	50 %	406592965
127	NC_018626	AACA	2	8	50877	50884	75 %	0 %	0 %	25 %	406592965
128	NC_018626	AAAG	2	8	52611	52618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018626	TTTA	2	8	52621	52628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018626	GAAG	2	8	52724	52731	50 %	0 %	50 %	0 %	406592966
131	NC_018626	TTCA	2	8	53482	53489	25 %	50 %	0 %	25 %	406592967
132	NC_018626	GTAT	2	8	54135	54142	25 %	50 %	25 %	0 %	406592968
133	NC_018626	CATA	2	8	54330	54337	50 %	25 %	0 %	25 %	406592968
134	NC_018626	TAGC	2	8	55861	55868	25 %	25 %	25 %	25 %	406592970
135	NC_018626	CTGT	2	8	56040	56047	0 %	50 %	25 %	25 %	406592970
136	NC_018626	CTTT	2	8	56430	56437	0 %	75 %	0 %	25 %	406592971
137	NC_018626	AGAA	2	8	56450	56457	75 %	0 %	25 %	0 %	406592971
138	NC_018626	GAAG	2	8	56619	56626	50 %	0 %	50 %	0 %	406592971
139	NC_018626	GTAA	2	8	56842	56849	50 %	25 %	25 %	0 %	406592971
140	NC_018626	TTAG	2	8	56965	56972	25 %	50 %	25 %	0 %	406592971
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142	NC_018626	GTTA	2	8	57472	57479	25 %	50 %	25 %	0 %	406592972
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