MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	GAAAA	2	10	3352	3361	80 %	0 %	20 %	0 %	406591808
2	NC_018625	AGGAG	2	10	4410	4419	40 %	0 %	60 %	0 %	406591809
3	NC_018625	TGTTT	2	10	6758	6767	0 %	80 %	20 %	0 %	406591811
4	NC_018625	AACAT	2	10	7322	7331	60 %	20 %	0 %	20 %	406591812
5	NC_018625	AAGAA	2	10	9567	9576	80 %	0 %	20 %	0 %	406591814
6	NC_018625	ATAAA	2	10	13042	13051	80 %	20 %	0 %	0 %	406591815
7	NC_018625	AACTC	2	10	13486	13495	40 %	20 %	0 %	40 %	406591815
8	NC_018625	GTTTT	2	10	13556	13565	0 %	80 %	20 %	0 %	406591815
9	NC_018625	GAAAC	2	10	14324	14333	60 %	0 %	20 %	20 %	406591816
10	NC_018625	AACAA	2	10	15353	15362	80 %	0 %	0 %	20 %	406591816
11	NC_018625	AATAG	2	10	17065	17074	60 %	20 %	20 %	0 %	406591818
12	NC_018625	GCCGT	2	10	18923	18932	0 %	20 %	40 %	40 %	406591821
13	NC_018625	GCCTA	2	10	19901	19910	20 %	20 %	20 %	40 %	406591821
14	NC_018625	AGTGT	2	10	21115	21124	20 %	40 %	40 %	0 %	406591822
15	NC_018625	GCCAC	2	10	29444	29453	20 %	0 %	20 %	60 %	406591826
16	NC_018625	AAGGA	2	10	38569	38578	60 %	0 %	40 %	0 %	406591838
17	NC_018625	CCATA	2	10	38776	38785	40 %	20 %	0 %	40 %	406591838
18	NC_018625	CTTTA	2	10	38942	38951	20 %	60 %	0 %	20 %	406591838
19	NC_018625	CTTTC	2	10	43206	43215	0 %	60 %	0 %	40 %	406591845
20	NC_018625	ACAAA	2	10	43868	43877	80 %	0 %	0 %	20 %	406591846
21	NC_018625	TATGG	2	10	44278	44287	20 %	40 %	40 %	0 %	406591847
22	NC_018625	TCTTT	2	10	46087	46096	0 %	80 %	0 %	20 %	406591849
23	NC_018625	AGCCC	2	10	47084	47093	20 %	0 %	20 %	60 %	406591850
24	NC_018625	TCAAA	2	10	47439	47448	60 %	20 %	0 %	20 %	406591850
25	NC_018625	TCTAT	2	10	49558	49567	20 %	60 %	0 %	20 %	406591852
26	NC_018625	TTTGG	2	10	51472	51481	0 %	60 %	40 %	0 %	406591852
27	NC_018625	TTTTC	2	10	55341	55350	0 %	80 %	0 %	20 %	406591856
28	NC_018625	GTAAG	2	10	57389	57398	40 %	20 %	40 %	0 %	406591859
29	NC_018625	AAAAT	2	10	60211	60220	80 %	20 %	0 %	0 %	406591861
30	NC_018625	TAGTT	2	10	62813	62822	20 %	60 %	20 %	0 %	406591861
31	NC_018625	GAATG	2	10	62829	62838	40 %	20 %	40 %	0 %	406591861
32	NC_018625	TCCTA	2	10	64878	64887	20 %	40 %	0 %	40 %	406591863
33	NC_018625	AGAAA	2	10	70134	70143	80 %	0 %	20 %	0 %	406591867
34	NC_018625	GGATA	2	10	70941	70950	40 %	20 %	40 %	0 %	406591868
35	NC_018625	ATAGC	2	10	74380	74389	40 %	20 %	20 %	20 %	406591872
36	NC_018625	GCACA	2	10	77213	77222	40 %	0 %	20 %	40 %	406591874
37	NC_018625	AAAGA	2	10	78166	78175	80 %	0 %	20 %	0 %	406591875
38	NC_018625	AGTTC	2	10	79171	79180	20 %	40 %	20 %	20 %	406591875
39	NC_018625	CGTAT	2	10	81544	81553	20 %	40 %	20 %	20 %	406591878
40	NC_018625	GAAAA	2	10	82754	82763	80 %	0 %	20 %	0 %	406591879
41	NC_018625	AGGAA	2	10	84753	84762	60 %	0 %	40 %	0 %	406591882
42	NC_018625	CTTTT	2	10	85642	85651	0 %	80 %	0 %	20 %	406591884
43	NC_018625	CAAAG	2	10	87113	87122	60 %	0 %	20 %	20 %	406591886
44	NC_018625	AACAA	2	10	87280	87289	80 %	0 %	0 %	20 %	406591886
45	NC_018625	AAAGA	2	10	89185	89194	80 %	0 %	20 %	0 %	406591889
46	NC_018625	TTTTC	2	10	90200	90209	0 %	80 %	0 %	20 %	406591889
47	NC_018625	AGGAT	2	10	90723	90732	40 %	20 %	40 %	0 %	406591889
48	NC_018625	ATAAC	2	10	90809	90818	60 %	20 %	0 %	20 %	406591889
49	NC_018625	TGGCA	2	10	93294	93303	20 %	20 %	40 %	20 %	406591890
50	NC_018625	TGTTT	2	10	95020	95029	0 %	80 %	20 %	0 %	406591893
51	NC_018625	TCACC	2	10	96594	96603	20 %	20 %	0 %	60 %	406591894
52	NC_018625	AAAAT	2	10	96729	96738	80 %	20 %	0 %	0 %	406591894
53	NC_018625	TTAAT	2	10	97773	97782	40 %	60 %	0 %	0 %	406591895
54	NC_018625	ATTAC	2	10	102904	102913	40 %	40 %	0 %	20 %	406591903
55	NC_018625	CTACA	2	10	103278	103287	40 %	20 %	0 %	40 %	406591903
56	NC_018625	AATTA	2	10	104825	104834	60 %	40 %	0 %	0 %	406591905
57	NC_018625	CTATA	2	10	105815	105824	40 %	40 %	0 %	20 %	406591906
58	NC_018625	AGCTT	2	10	108468	108477	20 %	40 %	20 %	20 %	406591910
59	NC_018625	GTTTG	2	10	108775	108784	0 %	60 %	40 %	0 %	406591910
60	NC_018625	AGTTA	2	10	115580	115589	40 %	40 %	20 %	0 %	406591925
61	NC_018625	AGTTT	2	10	116070	116079	20 %	60 %	20 %	0 %	406591926
62	NC_018625	TTTAC	2	10	119182	119191	20 %	60 %	0 %	20 %	406591931
63	NC_018625	AATTA	2	10	122075	122084	60 %	40 %	0 %	0 %	406591934
64	NC_018625	AGATG	2	10	123429	123438	40 %	20 %	40 %	0 %	406591936
65	NC_018625	GTCAA	2	10	124747	124756	40 %	20 %	20 %	20 %	406591938
66	NC_018625	TAGGG	2	10	127219	127228	20 %	20 %	60 %	0 %	406591941
67	NC_018625	AACTT	2	10	128151	128160	40 %	40 %	0 %	20 %	406591941
68	NC_018625	TGTCA	2	10	132037	132046	20 %	40 %	20 %	20 %	406591944
69	NC_018625	AAAAG	2	10	135443	135452	80 %	0 %	20 %	0 %	406591946
70	NC_018625	TAAAA	2	10	135724	135733	80 %	20 %	0 %	0 %	406591946
71	NC_018625	GATTT	2	10	137983	137992	20 %	60 %	20 %	0 %	406591948
72	NC_018625	TTGTT	2	10	138325	138334	0 %	80 %	20 %	0 %	406591948
73	NC_018625	AAGAA	2	10	138806	138815	80 %	0 %	20 %	0 %	406591948
74	NC_018625	TTCTT	2	10	139399	139408	0 %	80 %	0 %	20 %	406591950
75	NC_018625	CTTTG	2	10	141303	141312	0 %	60 %	20 %	20 %	406591952
76	NC_018625	AGAAA	2	10	143340	143349	80 %	0 %	20 %	0 %	406591955
77	NC_018625	AAAGA	2	10	146005	146014	80 %	0 %	20 %	0 %	406591957
78	NC_018625	TACTC	2	10	149636	149645	20 %	40 %	0 %	40 %	406591964
79	NC_018625	CGTTT	2	10	149683	149692	0 %	60 %	20 %	20 %	406591964
80	NC_018625	ATTTT	2	10	149823	149832	20 %	80 %	0 %	0 %	406591964
81	NC_018625	ACCAT	2	10	151854	151863	40 %	20 %	0 %	40 %	406591965
82	NC_018625	CAGAA	2	10	152819	152828	60 %	0 %	20 %	20 %	406591966
83	NC_018625	TTCAT	2	10	153389	153398	20 %	60 %	0 %	20 %	406591966
84	NC_018625	AAAGG	2	10	154219	154228	60 %	0 %	40 %	0 %	406591967
85	NC_018625	ATAGG	2	10	155911	155920	40 %	20 %	40 %	0 %	406591969
86	NC_018625	TTTGA	2	10	155997	156006	20 %	60 %	20 %	0 %	406591969
87	NC_018625	AAGGT	2	10	160938	160947	40 %	20 %	40 %	0 %	406591972
88	NC_018625	TTTTG	2	10	161877	161886	0 %	80 %	20 %	0 %	406591974
89	NC_018625	GGGGC	2	10	162024	162033	0 %	0 %	80 %	20 %	406591974
90	NC_018625	AAATG	2	10	166430	166439	60 %	20 %	20 %	0 %	406591977
91	NC_018625	GGGGA	2	10	168205	168214	20 %	0 %	80 %	0 %	406591978
92	NC_018625	CTGTT	2	10	169734	169743	0 %	60 %	20 %	20 %	406591980
93	NC_018625	AATGA	2	10	169769	169778	60 %	20 %	20 %	0 %	406591980
94	NC_018625	ATTTT	2	10	173229	173238	20 %	80 %	0 %	0 %	406591985
95	NC_018625	GAGAG	2	10	173246	173255	40 %	0 %	60 %	0 %	406591985
96	NC_018625	CTAAG	2	10	181193	181202	40 %	20 %	20 %	20 %	406591992
97	NC_018625	TTTTC	2	10	181793	181802	0 %	80 %	0 %	20 %	406591992
98	NC_018625	GGTAC	2	10	183788	183797	20 %	20 %	40 %	20 %	406591994
99	NC_018625	AGGGA	2	10	186974	186983	40 %	0 %	60 %	0 %	406592000
100	NC_018625	AGGAA	2	10	187997	188006	60 %	0 %	40 %	0 %	406592001
101	NC_018625	TTCTT	2	10	188376	188385	0 %	80 %	0 %	20 %	406592001
102	NC_018625	GATAA	2	10	191019	191028	60 %	20 %	20 %	0 %	406592001
103	NC_018625	CCCTT	2	10	193223	193232	0 %	40 %	0 %	60 %	406592002
104	NC_018625	AGTTA	2	10	194213	194222	40 %	40 %	20 %	0 %	406592003
105	NC_018625	TTATT	2	10	194233	194242	20 %	80 %	0 %	0 %	406592003
106	NC_018625	AGGGT	2	10	197156	197165	20 %	20 %	60 %	0 %	406592005
107	NC_018625	TGGAT	2	10	197597	197606	20 %	40 %	40 %	0 %	406592005
108	NC_018625	CTAAA	2	10	197654	197663	60 %	20 %	0 %	20 %	406592005
109	NC_018625	CTTTA	2	10	197957	197966	20 %	60 %	0 %	20 %	406592005
110	NC_018625	AAAAT	2	10	198134	198143	80 %	20 %	0 %	0 %	406592005
111	NC_018625	TTGGT	2	10	201436	201445	0 %	60 %	40 %	0 %	406592009
112	NC_018625	AGCAA	2	10	203913	203922	60 %	0 %	20 %	20 %	406592012
113	NC_018625	ATGTG	2	10	204299	204308	20 %	40 %	40 %	0 %	406592013
114	NC_018625	TAATG	2	10	205028	205037	40 %	40 %	20 %	0 %	406592013
115	NC_018625	AAAAT	2	10	206974	206983	80 %	20 %	0 %	0 %	406592017
116	NC_018625	TGGTT	2	10	207893	207902	0 %	60 %	40 %	0 %	406592017
117	NC_018625	TCTCT	2	10	208671	208680	0 %	60 %	0 %	40 %	406592019
118	NC_018625	GAAAA	2	10	214203	214212	80 %	0 %	20 %	0 %	406592025
119	NC_018625	TAGCA	2	10	214569	214578	40 %	20 %	20 %	20 %	406592026
120	NC_018625	AAGAA	2	10	215267	215276	80 %	0 %	20 %	0 %	406592026
121	NC_018625	GTTAG	2	10	218553	218562	20 %	40 %	40 %	0 %	406592029
122	NC_018625	TGGAT	2	10	218705	218714	20 %	40 %	40 %	0 %	406592029
123	NC_018625	TTGTA	2	10	221369	221378	20 %	60 %	20 %	0 %	406592029
124	NC_018625	GCTTA	2	10	222500	222509	20 %	40 %	20 %	20 %	406592029
125	NC_018625	GCTGA	2	10	227379	227388	20 %	20 %	40 %	20 %	406592033
126	NC_018625	AGGAG	2	10	230689	230698	40 %	0 %	60 %	0 %	406592038
127	NC_018625	TGCCC	2	10	230992	231001	0 %	20 %	20 %	60 %	406592038
128	NC_018625	TACCT	2	10	231858	231867	20 %	40 %	0 %	40 %	406592039
129	NC_018625	CTAGT	2	10	232149	232158	20 %	40 %	20 %	20 %	406592039
130	NC_018625	TGCGT	2	10	234315	234324	0 %	40 %	40 %	20 %	406592041
131	NC_018625	GTTTT	2	10	234360	234369	0 %	80 %	20 %	0 %	406592041
132	NC_018625	TAAAA	2	10	240123	240132	80 %	20 %	0 %	0 %	406592047
133	NC_018625	TTCAG	2	10	241352	241361	20 %	40 %	20 %	20 %	406592050
134	NC_018625	TTTAG	2	10	242642	242651	20 %	60 %	20 %	0 %	406592050
135	NC_018625	GTTGT	2	10	243447	243456	0 %	60 %	40 %	0 %	406592052
136	NC_018625	AGATA	2	10	245738	245747	60 %	20 %	20 %	0 %	406592054
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139	NC_018625	GAATC	2	10	247117	247126	40 %	20 %	20 %	20 %	406592056
140	NC_018625	TTGAG	2	10	248101	248110	20 %	40 %	40 %	0 %	406592058
141	NC_018625	TAACA	2	10	249725	249734	60 %	20 %	0 %	20 %	406592058
142	NC_018625	TTTAT	2	10	251898	251907	20 %	80 %	0 %	0 %	406592062
143	NC_018625	CTTTT	2	10	255586	255595	0 %	80 %	0 %	20 %	406592066
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147	NC_018625	ATCTC	2	10	261127	261136	20 %	40 %	0 %	40 %	406592071
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149	NC_018625	AAAAT	2	10	264129	264138	80 %	20 %	0 %	0 %	406592074
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153	NC_018625	AGCAG	2	10	266179	266188	40 %	0 %	40 %	20 %	406592076
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156	NC_018625	TTGGT	2	10	269455	269464	0 %	60 %	40 %	0 %	406592079
157	NC_018625	TGGCA	2	10	272092	272101	20 %	20 %	40 %	20 %	406592080
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246	NC_018625	GCTGA	2	10	413780	413789	20 %	20 %	40 %	20 %	406592208
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249	NC_018625	TTCTG	2	10	419348	419357	0 %	60 %	20 %	20 %	406592215
250	NC_018625	CATTC	2	10	419423	419432	20 %	40 %	0 %	40 %	406592215
251	NC_018625	TTACT	2	10	422533	422542	20 %	60 %	0 %	20 %	406592219
252	NC_018625	ATCCT	2	10	423247	423256	20 %	40 %	0 %	40 %	406592220
253	NC_018625	TATCT	2	10	424599	424608	20 %	60 %	0 %	20 %	406592220
254	NC_018625	GGAAT	2	10	424678	424687	40 %	20 %	40 %	0 %	406592220
255	NC_018625	AAAAG	2	10	428936	428945	80 %	0 %	20 %	0 %	406592226
256	NC_018625	TTTCT	2	10	429229	429238	0 %	80 %	0 %	20 %	406592226
257	NC_018625	GCTTC	2	10	433262	433271	0 %	40 %	20 %	40 %	406592230
258	NC_018625	CACTT	2	10	434167	434176	20 %	40 %	0 %	40 %	406592232
259	NC_018625	TTGAT	2	10	436867	436876	20 %	60 %	20 %	0 %	406592235
260	NC_018625	CAGCT	2	10	439414	439423	20 %	20 %	20 %	40 %	406592237
261	NC_018625	TAGGT	2	10	439840	439849	20 %	40 %	40 %	0 %	406592237
262	NC_018625	ACAAA	2	10	441503	441512	80 %	0 %	0 %	20 %	406592239
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