MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 3027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	406591805
2	NC_018625	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	406591805
3	NC_018625	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	406591806
4	NC_018625	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	406591806
5	NC_018625	TGTT	2	8	2837	2844	0 %	75 %	25 %	0 %	406591807
6	NC_018625	GAAG	2	8	2948	2955	50 %	0 %	50 %	0 %	406591807
7	NC_018625	AGTA	2	8	2978	2985	50 %	25 %	25 %	0 %	406591807
8	NC_018625	TTTG	2	8	3296	3303	0 %	75 %	25 %	0 %	406591808
9	NC_018625	TCCT	2	8	3322	3329	0 %	50 %	0 %	50 %	406591808
10	NC_018625	GAAA	2	8	5252	5259	75 %	0 %	25 %	0 %	406591809
11	NC_018625	AATC	2	8	5411	5418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018625	CGAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	406591810
13	NC_018625	TAAT	2	8	6729	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	406591811
14	NC_018625	GAAT	2	8	6849	6856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018625	AGAA	2	8	6961	6968	75 %	0 %	25 %	0 %	406591812
16	NC_018625	TCCC	2	8	7278	7285	0 %	25 %	0 %	75 %	406591812
17	NC_018625	GTAG	2	8	7312	7319	25 %	25 %	50 %	0 %	406591812
18	NC_018625	AATA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	406591813
19	NC_018625	ATGA	2	8	8480	8487	50 %	25 %	25 %	0 %	406591813
20	NC_018625	TGGA	2	8	8668	8675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018625	CTGT	2	8	8678	8685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018625	ATTT	2	8	9399	9406	25 %	75 %	0 %	0 %	406591814
23	NC_018625	AAAG	2	8	10223	10230	75 %	0 %	25 %	0 %	406591814
24	NC_018625	AAGT	2	8	10522	10529	50 %	25 %	25 %	0 %	406591814
25	NC_018625	AGGG	2	8	10761	10768	25 %	0 %	75 %	0 %	406591814
26	NC_018625	TAAG	2	8	10771	10778	50 %	25 %	25 %	0 %	406591814
27	NC_018625	AAAG	2	8	11064	11071	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
28	NC_018625	AGTA	2	8	11722	11729	50 %	25 %	25 %	0 %	406591815
29	NC_018625	TCTT	2	8	12003	12010	0 %	75 %	0 %	25 %	406591815
30	NC_018625	TAAT	2	8	12144	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	406591815
31	NC_018625	CAAA	2	8	12455	12462	75 %	0 %	0 %	25 %	406591815
32	NC_018625	AGAT	2	8	12565	12572	50 %	25 %	25 %	0 %	406591815
33	NC_018625	AAGA	2	8	12576	12583	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
34	NC_018625	ACTT	2	8	12698	12705	25 %	50 %	0 %	25 %	406591815
35	NC_018625	CACT	2	8	12795	12802	25 %	25 %	0 %	50 %	406591815
36	NC_018625	GCAA	2	8	13323	13330	50 %	0 %	25 %	25 %	406591815
37	NC_018625	GAAA	2	8	13743	13750	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
38	NC_018625	AGAT	2	8	14312	14319	50 %	25 %	25 %	0 %	406591816
39	NC_018625	TTGT	2	8	14362	14369	0 %	75 %	25 %	0 %	406591816
40	NC_018625	TTGG	2	8	14817	14824	0 %	50 %	50 %	0 %	406591816
41	NC_018625	GGAT	2	8	14946	14953	25 %	25 %	50 %	0 %	406591816
42	NC_018625	CCCA	2	8	15417	15424	25 %	0 %	0 %	75 %	406591816
43	NC_018625	TAAA	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018625	AGAA	2	8	17161	17168	75 %	0 %	25 %	0 %	406591818
45	NC_018625	TCTT	2	8	17431	17438	0 %	75 %	0 %	25 %	406591818
46	NC_018625	TTTC	2	8	17678	17685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018625	GTCA	2	8	17834	17841	25 %	25 %	25 %	25 %	406591819
48	NC_018625	AAGC	2	8	18225	18232	50 %	0 %	25 %	25 %	406591819
49	NC_018625	ATTA	2	8	18365	18372	50 %	50 %	0 %	0 %	406591819
50	NC_018625	ATTA	2	8	18987	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	406591821
51	NC_018625	GTTT	2	8	19260	19267	0 %	75 %	25 %	0 %	406591821
52	NC_018625	TTTG	2	8	19500	19507	0 %	75 %	25 %	0 %	406591821
53	NC_018625	TGCC	2	8	19532	19539	0 %	25 %	25 %	50 %	406591821
54	NC_018625	GCGT	2	8	19664	19671	0 %	25 %	50 %	25 %	406591821
55	NC_018625	TGGT	2	8	20445	20452	0 %	50 %	50 %	0 %	406591822
56	NC_018625	TAAA	2	8	21085	21092	75 %	25 %	0 %	0 %	406591822
57	NC_018625	TATG	2	8	21584	21591	25 %	50 %	25 %	0 %	406591822
58	NC_018625	CAAT	2	8	22279	22286	50 %	25 %	0 %	25 %	406591823
59	NC_018625	AGAA	2	8	22696	22703	75 %	0 %	25 %	0 %	406591823
60	NC_018625	TGAT	2	8	22903	22910	25 %	50 %	25 %	0 %	406591823
61	NC_018625	AGCT	2	8	24164	24171	25 %	25 %	25 %	25 %	406591824
62	NC_018625	AAAT	2	8	24501	24508	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
63	NC_018625	AATT	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	406591824
64	NC_018625	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
65	NC_018625	TAGT	2	8	24982	24989	25 %	50 %	25 %	0 %	406591824
66	NC_018625	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	406591824
67	NC_018625	ATTC	2	8	25880	25887	25 %	50 %	0 %	25 %	406591824
68	NC_018625	TTTC	2	8	26012	26019	0 %	75 %	0 %	25 %	406591824
69	NC_018625	ATAG	2	8	26107	26114	50 %	25 %	25 %	0 %	406591824
70	NC_018625	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
71	NC_018625	ATTT	2	8	26653	26660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018625	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018625	ACTT	2	8	27128	27135	25 %	50 %	0 %	25 %	406591825
74	NC_018625	ATCA	2	8	27658	27665	50 %	25 %	0 %	25 %	406591825
75	NC_018625	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	406591825
76	NC_018625	GAAA	2	8	28152	28159	75 %	0 %	25 %	0 %	406591825
77	NC_018625	AAAT	2	8	28806	28813	75 %	25 %	0 %	0 %	406591825
78	NC_018625	AGGG	2	8	29429	29436	25 %	0 %	75 %	0 %	406591826
79	NC_018625	GAAT	2	8	29623	29630	50 %	25 %	25 %	0 %	406591827
80	NC_018625	ACCA	2	8	30238	30245	50 %	0 %	0 %	50 %	406591827
81	NC_018625	AACG	2	8	30845	30852	50 %	0 %	25 %	25 %	406591829
82	NC_018625	GTTT	2	8	31409	31416	0 %	75 %	25 %	0 %	406591829
83	NC_018625	TTTC	2	8	31649	31656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018625	GCAG	2	8	32005	32012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018625	TCTA	2	8	32053	32060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018625	AATT	2	8	32377	32384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018625	TTAA	2	8	32417	32424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018625	ATTT	2	8	32432	32439	25 %	75 %	0 %	0 %	406591831
89	NC_018625	TTGT	2	8	32458	32465	0 %	75 %	25 %	0 %	406591831
90	NC_018625	TAGA	2	8	32664	32671	50 %	25 %	25 %	0 %	406591831
91	NC_018625	TTTA	2	8	33118	33125	25 %	75 %	0 %	0 %	406591831
92	NC_018625	TTAA	2	8	33507	33514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018625	AGAT	2	8	33550	33557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018625	TTAG	2	8	33605	33612	25 %	50 %	25 %	0 %	406591832
95	NC_018625	TGAA	2	8	34009	34016	50 %	25 %	25 %	0 %	406591833
96	NC_018625	GTAC	2	8	34087	34094	25 %	25 %	25 %	25 %	406591833
97	NC_018625	GATA	2	8	34123	34130	50 %	25 %	25 %	0 %	406591833
98	NC_018625	TCTT	2	8	34383	34390	0 %	75 %	0 %	25 %	406591834
99	NC_018625	AGGA	2	8	35335	35342	50 %	0 %	50 %	0 %	406591834
100	NC_018625	TAAT	2	8	36123	36130	50 %	50 %	0 %	0 %	406591835
101	NC_018625	CGCT	2	8	36839	36846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018625	TCAA	2	8	37771	37778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018625	AAAG	2	8	38193	38200	75 %	0 %	25 %	0 %	406591838
104	NC_018625	TAAT	2	8	38209	38216	50 %	50 %	0 %	0 %	406591838
105	NC_018625	TCAA	2	8	38345	38352	50 %	25 %	0 %	25 %	406591838
106	NC_018625	TTTA	2	8	38678	38685	25 %	75 %	0 %	0 %	406591838
107	NC_018625	CTTT	2	8	38808	38815	0 %	75 %	0 %	25 %	406591838
108	NC_018625	CCTG	2	8	40294	40301	0 %	25 %	25 %	50 %	406591842
109	NC_018625	GAAA	2	8	41235	41242	75 %	0 %	25 %	0 %	406591842
110	NC_018625	AGCA	2	8	41406	41413	50 %	0 %	25 %	25 %	406591842
111	NC_018625	CTGT	2	8	41874	41881	0 %	50 %	25 %	25 %	406591842
112	NC_018625	TCTT	2	8	41914	41921	0 %	75 %	0 %	25 %	406591842
113	NC_018625	GAAG	2	8	42325	42332	50 %	0 %	50 %	0 %	406591842
114	NC_018625	AATA	2	8	42356	42363	75 %	25 %	0 %	0 %	406591842
115	NC_018625	GAAA	2	8	43493	43500	75 %	0 %	25 %	0 %	406591846
116	NC_018625	TAAT	2	8	43819	43826	50 %	50 %	0 %	0 %	406591846
117	NC_018625	GTCG	2	8	44191	44198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018625	TTAA	2	8	44221	44228	50 %	50 %	0 %	0 %	406591847
119	NC_018625	ATCA	2	8	44810	44817	50 %	25 %	0 %	25 %	406591847
120	NC_018625	ATGA	2	8	45088	45095	50 %	25 %	25 %	0 %	406591847
121	NC_018625	TAAA	2	8	45988	45995	75 %	25 %	0 %	0 %	406591849
122	NC_018625	GAAA	2	8	46970	46977	75 %	0 %	25 %	0 %	406591850
123	NC_018625	TCTT	2	8	47076	47083	0 %	75 %	0 %	25 %	406591850
124	NC_018625	GCTT	2	8	47605	47612	0 %	50 %	25 %	25 %	406591850
125	NC_018625	AAGA	2	8	48047	48054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018625	TGTT	2	8	48457	48464	0 %	75 %	25 %	0 %	406591851
127	NC_018625	ATAA	2	8	49525	49532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018625	TAAA	2	8	49694	49701	75 %	25 %	0 %	0 %	406591852
129	NC_018625	AAGC	2	8	49723	49730	50 %	0 %	25 %	25 %	406591852
130	NC_018625	CCAA	2	8	49747	49754	50 %	0 %	0 %	50 %	406591852
131	NC_018625	TTCC	2	8	49894	49901	0 %	50 %	0 %	50 %	406591852
132	NC_018625	AACA	2	8	50871	50878	75 %	0 %	0 %	25 %	406591852
133	NC_018625	AAAG	2	8	52605	52612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018625	TTTA	2	8	52615	52622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018625	GAAG	2	8	52718	52725	50 %	0 %	50 %	0 %	406591853
136	NC_018625	ATCC	2	8	53024	53031	25 %	25 %	0 %	50 %	406591854
137	NC_018625	AGCA	2	8	53316	53323	50 %	0 %	25 %	25 %	406591854
138	NC_018625	TTCA	2	8	53476	53483	25 %	50 %	0 %	25 %	406591854
139	NC_018625	GTAT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	25 %	0 %	406591855
140	NC_018625	CATA	2	8	54324	54331	50 %	25 %	0 %	25 %	406591855
141	NC_018625	AAAG	2	8	54783	54790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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